MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM400

Total Repeats: 1278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004604	T	6	6	6	11	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004604	T	7	7	13	19	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004604	T	7	7	31	37	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004604	TTCCT	2	10	85	94	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_004604	AG	3	6	120	125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004604	CT	3	6	217	222	0 %	50 %	0 %	50 %	294663010
7	NC_004604	CT	3	6	249	254	0 %	50 %	0 %	50 %	294663010
8	NC_004604	T	6	6	287	292	0 %	100 %	0 %	0 %	294663010
9	NC_004604	TTG	2	6	310	315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294663010
10	NC_004604	T	7	7	351	357	0 %	100 %	0 %	0 %	294663010
11	NC_004604	CAT	2	6	385	390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294663010
12	NC_004604	T	7	7	407	413	0 %	100 %	0 %	0 %	294663010
13	NC_004604	GTT	2	6	449	454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294663010
14	NC_004604	TTTTC	2	10	457	466	0 %	80 %	0 %	20 %	294663010
15	NC_004604	T	7	7	500	506	0 %	100 %	0 %	0 %	294663010
16	NC_004604	A	6	6	551	556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004604	TTGTA	2	10	572	581	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004604	A	7	7	585	591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004604	AATAAA	2	12	619	630	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	294663011
20	NC_004604	A	7	7	628	634	100 %	0 %	0 %	0 %	294663011
21	NC_004604	GCTT	2	8	639	646	0 %	50 %	25 %	25 %	294663011
22	NC_004604	T	7	7	655	661	0 %	100 %	0 %	0 %	294663011
23	NC_004604	A	6	6	663	668	100 %	0 %	0 %	0 %	294663011
24	NC_004604	CA	3	6	859	864	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_004604	TC	3	6	895	900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_004604	T	7	7	903	909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004604	ACT	2	6	916	921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_004604	AAATA	2	10	936	945	80 %	20 %	0 %	0 %	294663012
29	NC_004604	CTA	2	6	973	978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294663012
30	NC_004604	A	7	7	984	990	100 %	0 %	0 %	0 %	294663012
31	NC_004604	TGA	2	6	991	996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294663012
32	NC_004604	ATCA	2	8	1014	1021	50 %	25 %	0 %	25 %	294663012
33	NC_004604	CAG	2	6	1025	1030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294663012
34	NC_004604	CA	3	6	1050	1055	50 %	0 %	0 %	50 %	294663012
35	NC_004604	GGA	2	6	1185	1190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004604	TGA	2	6	1199	1204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004604	CATC	2	8	1239	1246	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_004604	TA	3	6	1261	1266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004604	AGAA	2	8	1336	1343	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004604	AAC	2	6	1352	1357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_004604	ATTGA	2	10	1377	1386	40 %	40 %	20 %	0 %	294663013
42	NC_004604	A	6	6	1397	1402	100 %	0 %	0 %	0 %	294663013
43	NC_004604	CAA	2	6	1492	1497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294663013
44	NC_004604	A	6	6	1496	1501	100 %	0 %	0 %	0 %	294663013
45	NC_004604	T	6	6	1563	1568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004604	A	6	6	1583	1588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004604	A	6	6	1596	1601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004604	AGA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004604	AC	3	6	1690	1695	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_004604	A	6	6	1718	1723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004604	ATG	2	6	1754	1759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004604	AT	3	6	1814	1819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004604	T	6	6	1828	1833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004604	ACT	2	6	1847	1852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_004604	TAA	2	6	1861	1866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004604	A	6	6	1891	1896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004604	AGTT	2	8	1990	1997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004604	TTTTA	2	10	2020	2029	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004604	TTAA	2	8	2067	2074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004604	TTC	2	6	2089	2094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_004604	GAAA	2	8	2209	2216	75 %	0 %	25 %	0 %	28894898
62	NC_004604	AGAA	2	8	2235	2242	75 %	0 %	25 %	0 %	28894898
63	NC_004604	TACT	2	8	2263	2270	25 %	50 %	0 %	25 %	28894898
64	NC_004604	ACA	3	9	2275	2283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894898
65	NC_004604	A	6	6	2309	2314	100 %	0 %	0 %	0 %	28894898
66	NC_004604	TTG	2	6	2349	2354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894898
67	NC_004604	ATCCA	2	10	2372	2381	40 %	20 %	0 %	40 %	28894898
68	NC_004604	AGA	2	6	2482	2487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894898
69	NC_004604	T	6	6	2567	2572	0 %	100 %	0 %	0 %	28894898
70	NC_004604	ACA	2	6	2582	2587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894898
71	NC_004604	CAA	2	6	2603	2608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894898
72	NC_004604	GAA	2	6	2609	2614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894898
73	NC_004604	ACA	2	6	2672	2677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894898
74	NC_004604	A	6	6	2691	2696	100 %	0 %	0 %	0 %	28894898
75	NC_004604	TTA	2	6	2709	2714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894898
76	NC_004604	AAT	2	6	2741	2746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894898
77	NC_004604	A	6	6	2795	2800	100 %	0 %	0 %	0 %	28894898
78	NC_004604	TCA	2	6	2830	2835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894898
79	NC_004604	TGC	2	6	2866	2871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894898
80	NC_004604	AGATTG	2	12	2895	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894898
81	NC_004604	TTG	2	6	2943	2948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894898
82	NC_004604	CAAT	2	8	3037	3044	50 %	25 %	0 %	25 %	28894898
83	NC_004604	AGA	2	6	3070	3075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894898
84	NC_004604	CAT	2	6	3078	3083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894898
85	NC_004604	ACAT	2	8	3093	3100	50 %	25 %	0 %	25 %	28894898
86	NC_004604	AAC	2	6	3180	3185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894898
87	NC_004604	AGC	2	6	3228	3233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894898
88	NC_004604	AGA	3	9	3280	3288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894898
89	NC_004604	TGC	2	6	3294	3299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894898
90	NC_004604	ACA	3	9	3391	3399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894898
91	NC_004604	GAA	2	6	3437	3442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004604	TAT	3	9	3472	3480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004604	AT	3	6	3505	3510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004604	AGG	2	6	3521	3526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004604	TGTT	2	8	3677	3684	0 %	75 %	25 %	0 %	28894901
96	NC_004604	AAAG	2	8	3687	3694	75 %	0 %	25 %	0 %	28894901
97	NC_004604	TAA	2	6	3699	3704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894901
98	NC_004604	A	6	6	3717	3722	100 %	0 %	0 %	0 %	28894901
99	NC_004604	TAT	2	6	3726	3731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894901
100	NC_004604	AAG	2	6	3848	3853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894901
101	NC_004604	A	6	6	3871	3876	100 %	0 %	0 %	0 %	28894901
102	NC_004604	GAAGC	2	10	3877	3886	40 %	0 %	40 %	20 %	28894901
103	NC_004604	CAA	2	6	3904	3909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894901
104	NC_004604	CTA	2	6	3920	3925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894901
105	NC_004604	AGAA	2	8	3929	3936	75 %	0 %	25 %	0 %	28894901
106	NC_004604	AAG	2	6	3956	3961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894901
107	NC_004604	GAAA	2	8	3984	3991	75 %	0 %	25 %	0 %	28894901
108	NC_004604	AGC	2	6	4028	4033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894901
109	NC_004604	TGA	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894901
110	NC_004604	CTT	2	6	4098	4103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28894901
111	NC_004604	AGA	2	6	4131	4136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894901
112	NC_004604	TCG	2	6	4221	4226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894901
113	NC_004604	CT	3	6	4295	4300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_004604	AGG	2	6	4302	4307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004604	AT	3	6	4324	4329	50 %	50 %	0 %	0 %	294663014
116	NC_004604	ATC	2	6	4359	4364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294663014
117	NC_004604	ATT	2	6	4392	4397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294663014
118	NC_004604	GAT	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294663014
119	NC_004604	CGA	2	6	4412	4417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294663014
120	NC_004604	TA	3	6	4490	4495	50 %	50 %	0 %	0 %	294663014
121	NC_004604	AG	3	6	4535	4540	50 %	0 %	50 %	0 %	294663014
122	NC_004604	TAT	2	6	4555	4560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294663014
123	NC_004604	GAT	2	6	4565	4570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294663014
124	NC_004604	AGC	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294663014
125	NC_004604	CTG	2	6	4764	4769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294663014
126	NC_004604	CTA	2	6	4850	4855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294663014
127	NC_004604	TTA	2	6	4874	4879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294663014
128	NC_004604	TAA	2	6	4926	4931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294663014
129	NC_004604	A	6	6	4930	4935	100 %	0 %	0 %	0 %	294663014
130	NC_004604	TCC	2	6	4936	4941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294663014
131	NC_004604	AGC	2	6	4978	4983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294663014
132	NC_004604	ATT	2	6	4992	4997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294663014
133	NC_004604	TAA	2	6	5011	5016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294663014
134	NC_004604	GAT	2	6	5027	5032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294663014
135	NC_004604	AGA	2	6	5044	5049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294663014
136	NC_004604	TCTCT	2	10	5154	5163	0 %	60 %	0 %	40 %	294663014
137	NC_004604	AT	3	6	5224	5229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004604	AAT	2	6	5230	5235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004604	TTTTC	2	10	5273	5282	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_004604	AATG	2	8	5291	5298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004604	GC	3	6	5401	5406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_004604	ATA	2	6	5422	5427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004604	TATACA	2	12	5438	5449	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_004604	TA	3	6	5468	5473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004604	AGG	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_004604	T	6	6	11295	11300	0 %	100 %	0 %	0 %	28894867
284	NC_004604	TCT	2	6	11307	11312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28894867
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296	NC_004604	TAA	2	6	11736	11741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894867
297	NC_004604	ACTC	2	8	11779	11786	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
298	NC_004604	AAT	2	6	11796	11801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_004604	A	7	7	11844	11850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_004604	AG	3	6	11863	11868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
301	NC_004604	AT	3	6	11935	11940	50 %	50 %	0 %	0 %	294663018
302	NC_004604	A	6	6	11955	11960	100 %	0 %	0 %	0 %	294663018
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370	NC_004604	AAT	2	6	14366	14371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
371	NC_004604	TTA	2	6	14384	14389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
372	NC_004604	AT	5	10	14411	14420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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376	NC_004604	ACTAA	2	10	14713	14722	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
377	NC_004604	TA	3	6	14749	14754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
378	NC_004604	ACC	2	6	14812	14817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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381	NC_004604	ATT	2	6	14932	14937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294663019
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384	NC_004604	TGTTT	2	10	14981	14990	0 %	80 %	20 %	0 %	294663019
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393	NC_004604	T	6	6	15417	15422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
394	NC_004604	A	6	6	15444	15449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
395	NC_004604	TATC	2	8	15452	15459	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
396	NC_004604	A	6	6	15468	15473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
397	NC_004604	AATA	2	8	15516	15523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_004604	CAC	2	6	15557	15562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
399	NC_004604	AAAG	2	8	15572	15579	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
400	NC_004604	TCC	2	6	15584	15589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
401	NC_004604	ACA	2	6	15603	15608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894871
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403	NC_004604	T	6	6	15710	15715	0 %	100 %	0 %	0 %	28894871
404	NC_004604	CA	3	6	15789	15794	50 %	0 %	0 %	50 %	28894871
405	NC_004604	TCAT	2	8	15901	15908	25 %	50 %	0 %	25 %	28894871
406	NC_004604	TCA	2	6	15968	15973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894871
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408	NC_004604	TTTA	2	8	16069	16076	25 %	75 %	0 %	0 %	28894871
409	NC_004604	AT	3	6	16085	16090	50 %	50 %	0 %	0 %	28894871
410	NC_004604	AAG	2	6	16117	16122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894871
411	NC_004604	AAG	2	6	16162	16167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894871
412	NC_004604	AGA	2	6	16223	16228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894871
413	NC_004604	TGT	2	6	16258	16263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894871
414	NC_004604	T	6	6	16300	16305	0 %	100 %	0 %	0 %	28894871
415	NC_004604	CTAT	2	8	16306	16313	25 %	50 %	0 %	25 %	28894871
416	NC_004604	CTT	3	9	16318	16326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28894871
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418	NC_004604	TATT	2	8	16568	16575	25 %	75 %	0 %	0 %	28894871
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