MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 224297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_004463	TTTTCG	2	12	831324	831335	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	27375887
21003	NC_004463	CA	3	6	831338	831343	50 %	0 %	0 %	50 %	27375887
21004	NC_004463	TGCG	2	8	831369	831376	0 %	25 %	50 %	25 %	27375887
21005	NC_004463	GTC	2	6	831494	831499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375887
21006	NC_004463	CGA	2	6	831502	831507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375887
21007	NC_004463	TGCG	2	8	831541	831548	0 %	25 %	50 %	25 %	27375887
21008	NC_004463	CAG	2	6	831560	831565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375887
21009	NC_004463	TCCA	2	8	831606	831613	25 %	25 %	0 %	50 %	27375887
21010	NC_004463	CG	3	6	831641	831646	0 %	0 %	50 %	50 %	27375887
21011	NC_004463	GGCGG	2	10	831647	831656	0 %	0 %	80 %	20 %	27375887
21012	NC_004463	GC	3	6	831711	831716	0 %	0 %	50 %	50 %	27375888
21013	NC_004463	GCCG	2	8	831722	831729	0 %	0 %	50 %	50 %	27375888
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21017	NC_004463	GCG	3	9	831958	831966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375888
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21022	NC_004463	CAG	2	6	832097	832102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375888
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21025	NC_004463	GCA	2	6	832279	832284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375888
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21028	NC_004463	CG	3	6	832350	832355	0 %	0 %	50 %	50 %	27375888
21029	NC_004463	G	6	6	832399	832404	0 %	0 %	100 %	0 %	27375888
21030	NC_004463	AGC	2	6	832455	832460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375888
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21034	NC_004463	CG	3	6	832535	832540	0 %	0 %	50 %	50 %	27375888
21035	NC_004463	CCA	2	6	832703	832708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375889
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21039	NC_004463	TGC	2	6	832809	832814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375889
21040	NC_004463	TCCGA	2	10	832832	832841	20 %	20 %	20 %	40 %	27375889
21041	NC_004463	TCA	2	6	832896	832901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375889
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21051	NC_004463	GC	3	6	833099	833104	0 %	0 %	50 %	50 %	27375889
21052	NC_004463	GCT	2	6	833107	833112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375889
21053	NC_004463	CTGG	2	8	833278	833285	0 %	25 %	50 %	25 %	27375889
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21061	NC_004463	GAC	3	9	833632	833640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375889
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21098	NC_004463	CG	3	6	835076	835081	0 %	0 %	50 %	50 %	27375890
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21109	NC_004463	GAA	2	6	835293	835298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375890
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21240	NC_004463	GGCG	2	8	840381	840388	0 %	0 %	75 %	25 %	27375894
21241	NC_004463	GGCGA	2	10	840409	840418	20 %	0 %	60 %	20 %	27375894
21242	NC_004463	CGG	2	6	840430	840435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375894
21243	NC_004463	GC	3	6	840510	840515	0 %	0 %	50 %	50 %	27375894
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21246	NC_004463	AGC	2	6	840701	840706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375894
21247	NC_004463	TCGACG	2	12	840740	840751	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	27375894
21248	NC_004463	CGC	2	6	840756	840761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375894
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21250	NC_004463	TTG	2	6	840839	840844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27375894
21251	NC_004463	GAT	2	6	840853	840858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375894
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21254	NC_004463	ACG	2	6	840938	840943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375894
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21293	NC_004463	GCG	2	6	842156	842161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375894
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21295	NC_004463	CG	3	6	842295	842300	0 %	0 %	50 %	50 %	27375894
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21364	NC_004463	TCG	2	6	844979	844984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375897
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21367	NC_004463	CGT	2	6	845055	845060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375897
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21371	NC_004463	CGAT	2	8	845240	845247	25 %	25 %	25 %	25 %	27375897
21372	NC_004463	CTCGG	2	10	845462	845471	0 %	20 %	40 %	40 %	27375897
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21488	NC_004463	GC	3	6	850263	850268	0 %	0 %	50 %	50 %	27375902
21489	NC_004463	GCA	2	6	850302	850307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375902
21490	NC_004463	GAA	2	6	850348	850353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375902
21491	NC_004463	TGG	2	6	850383	850388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375902
21492	NC_004463	TCA	2	6	850449	850454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375902
21493	NC_004463	GGC	2	6	850465	850470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375902
21494	NC_004463	CTG	2	6	850489	850494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375902
21495	NC_004463	CGGC	2	8	850605	850612	0 %	0 %	50 %	50 %	27375902
21496	NC_004463	GC	4	8	850611	850618	0 %	0 %	50 %	50 %	27375902
21497	NC_004463	CACGC	2	10	850619	850628	20 %	0 %	20 %	60 %	27375902
21498	NC_004463	CG	3	6	850839	850844	0 %	0 %	50 %	50 %	27375902
21499	NC_004463	GGCG	2	8	850866	850873	0 %	0 %	75 %	25 %	27375902
21500	NC_004463	CGA	2	6	850962	850967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375902

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