MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 224297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_004463	CAT	2	6	654214	654219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375721
16502	NC_004463	CGA	2	6	654232	654237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375721
16503	NC_004463	GCC	2	6	654273	654278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375721
16504	NC_004463	TGA	2	6	654279	654284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375721
16505	NC_004463	GGC	2	6	654286	654291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375721
16506	NC_004463	TCA	2	6	654308	654313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16507	NC_004463	GCGA	2	8	654388	654395	25 %	0 %	50 %	25 %	27375722
16508	NC_004463	CAT	2	6	654431	654436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375722
16509	NC_004463	ATG	2	6	654457	654462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375722
16510	NC_004463	GC	3	6	654481	654486	0 %	0 %	50 %	50 %	27375722
16511	NC_004463	TTG	2	6	654489	654494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27375722
16512	NC_004463	GGC	2	6	654549	654554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375722
16513	NC_004463	TCA	2	6	654595	654600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375722
16514	NC_004463	CG	3	6	654632	654637	0 %	0 %	50 %	50 %	27375722
16515	NC_004463	CTG	2	6	654654	654659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375722
16516	NC_004463	GCGA	2	8	654667	654674	25 %	0 %	50 %	25 %	27375722
16517	NC_004463	CCGCG	2	10	654680	654689	0 %	0 %	40 %	60 %	27375722
16518	NC_004463	CGG	2	6	654725	654730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375722
16519	NC_004463	GCG	2	6	654788	654793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375722
16520	NC_004463	GCA	2	6	654812	654817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375722
16521	NC_004463	GAAC	2	8	654843	654850	50 %	0 %	25 %	25 %	27375722
16522	NC_004463	CGG	2	6	654947	654952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16523	NC_004463	GC	3	6	655008	655013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16524	NC_004463	G	6	6	655033	655038	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16525	NC_004463	CGC	2	6	655049	655054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16526	NC_004463	ATT	2	6	655404	655409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27375723
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16528	NC_004463	GCC	2	6	655495	655500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375723
16529	NC_004463	CAAGAT	2	12	655556	655567	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	27375723
16530	NC_004463	CCG	2	6	655621	655626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375723
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16533	NC_004463	GGC	2	6	655794	655799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375724
16534	NC_004463	TGA	2	6	655901	655906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375724
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16536	NC_004463	TCT	2	6	655979	655984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375724
16537	NC_004463	CGT	2	6	655995	656000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375724
16538	NC_004463	CGG	2	6	656043	656048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375724
16539	NC_004463	CGG	2	6	656061	656066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375724
16540	NC_004463	ATG	2	6	656083	656088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375724
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16542	NC_004463	TCG	2	6	656198	656203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375724
16543	NC_004463	CT	3	6	656240	656245	0 %	50 %	0 %	50 %	27375724
16544	NC_004463	GGCCC	2	10	656303	656312	0 %	0 %	40 %	60 %	27375724
16545	NC_004463	GCG	2	6	656347	656352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375724
16546	NC_004463	GCG	3	9	656359	656367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375724
16547	NC_004463	CGA	2	6	656391	656396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375724
16548	NC_004463	ACGCCG	2	12	656402	656413	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	27375724
16549	NC_004463	AAG	2	6	656425	656430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375724
16550	NC_004463	GGC	2	6	656449	656454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375724
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16553	NC_004463	GAT	2	6	656565	656570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375724
16554	NC_004463	GCT	2	6	656580	656585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375724
16555	NC_004463	CGG	2	6	656634	656639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375724
16556	NC_004463	TCG	2	6	656666	656671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375724
16557	NC_004463	GCC	2	6	656680	656685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375724
16558	NC_004463	CGCC	2	8	656780	656787	0 %	0 %	25 %	75 %	27375724
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16565	NC_004463	CGG	2	6	656973	656978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375724
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16571	NC_004463	GC	3	6	657192	657197	0 %	0 %	50 %	50 %	27375724
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16574	NC_004463	CTTT	2	8	657320	657327	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16575	NC_004463	CG	3	6	657334	657339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16578	NC_004463	GTC	2	6	657419	657424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16584	NC_004463	CG	3	6	657633	657638	0 %	0 %	50 %	50 %	27375725
16585	NC_004463	CCG	2	6	657789	657794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375725
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16588	NC_004463	GAGGGC	2	12	657868	657879	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
16589	NC_004463	GA	3	6	657920	657925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16590	NC_004463	GGA	2	6	657974	657979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16591	NC_004463	CCCA	2	8	657997	658004	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16592	NC_004463	GTT	2	6	658009	658014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16593	NC_004463	GCG	2	6	658047	658052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16594	NC_004463	CTAT	2	8	658083	658090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16595	NC_004463	TGAAC	2	10	658093	658102	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16596	NC_004463	CCG	2	6	658109	658114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16599	NC_004463	TCG	2	6	658319	658324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375726
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16602	NC_004463	CGAG	2	8	658454	658461	25 %	0 %	50 %	25 %	27375726
16603	NC_004463	CGC	2	6	658500	658505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375726
16604	NC_004463	GGCGCC	2	12	658585	658596	0 %	0 %	50 %	50 %	27375726
16605	NC_004463	ACC	2	6	658630	658635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375726
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16607	NC_004463	GC	3	6	658687	658692	0 %	0 %	50 %	50 %	27375726
16608	NC_004463	CGCC	2	8	658715	658722	0 %	0 %	25 %	75 %	27375726
16609	NC_004463	CGA	2	6	658806	658811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375726
16610	NC_004463	GC	3	6	658850	658855	0 %	0 %	50 %	50 %	27375726
16611	NC_004463	CGC	2	6	658944	658949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375726
16612	NC_004463	AAG	2	6	658957	658962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375726
16613	NC_004463	CGA	2	6	659049	659054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375726
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16620	NC_004463	GCG	2	6	659457	659462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375727
16621	NC_004463	CGGCCT	2	12	659478	659489	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	27375727
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16623	NC_004463	CGGCT	2	10	659722	659731	0 %	20 %	40 %	40 %	27375727
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16739	NC_004463	CG	3	6	663678	663683	0 %	0 %	50 %	50 %	27375729
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16743	NC_004463	GC	3	6	663756	663761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16991	NC_004463	GAG	2	6	673973	673978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375738
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