MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 224297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_004463	CTG	2	6	633789	633794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375698
16002	NC_004463	GCGCTG	2	12	633795	633806	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	27375698
16003	NC_004463	CGG	2	6	633865	633870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375698
16004	NC_004463	TGC	2	6	633943	633948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375698
16005	NC_004463	GAA	2	6	633950	633955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375698
16006	NC_004463	GCT	2	6	633980	633985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375698
16007	NC_004463	TGG	2	6	634057	634062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375698
16008	NC_004463	TGC	2	6	634084	634089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375698
16009	NC_004463	TCGATC	2	12	634179	634190	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	27375698
16010	NC_004463	CGG	3	9	634220	634228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375698
16011	NC_004463	CGG	2	6	634289	634294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375698
16012	NC_004463	ATCT	2	8	634308	634315	25 %	50 %	0 %	25 %	27375698
16013	NC_004463	TCA	2	6	634342	634347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375698
16014	NC_004463	GC	3	6	634445	634450	0 %	0 %	50 %	50 %	27375698
16015	NC_004463	TGC	2	6	634474	634479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375698
16016	NC_004463	GCCG	2	8	634511	634518	0 %	0 %	50 %	50 %	27375698
16017	NC_004463	GCC	2	6	634560	634565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375698
16018	NC_004463	TAT	2	6	634608	634613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27375698
16019	NC_004463	TCTGA	2	10	634646	634655	20 %	40 %	20 %	20 %	27375698
16020	NC_004463	ATC	2	6	634661	634666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16021	NC_004463	TAT	2	6	634671	634676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_004463	CAT	2	6	634680	634685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16023	NC_004463	GC	4	8	634703	634710	0 %	0 %	50 %	50 %	27375699
16024	NC_004463	GTCAG	2	10	634743	634752	20 %	20 %	40 %	20 %	27375699
16025	NC_004463	AGC	2	6	634846	634851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375699
16026	NC_004463	CGG	2	6	634889	634894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375699
16027	NC_004463	CAA	3	9	634910	634918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375699
16028	NC_004463	GCCG	2	8	634922	634929	0 %	0 %	50 %	50 %	27375699
16029	NC_004463	TCA	2	6	634987	634992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375699
16030	NC_004463	GC	3	6	635057	635062	0 %	0 %	50 %	50 %	27375699
16031	NC_004463	GCC	2	6	635109	635114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375699
16032	NC_004463	CCA	2	6	635117	635122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375699
16033	NC_004463	GAA	2	6	635138	635143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375699
16034	NC_004463	GAC	2	6	635148	635153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375699
16035	NC_004463	TCC	2	6	635181	635186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375699
16036	NC_004463	CG	4	8	635270	635277	0 %	0 %	50 %	50 %	27375699
16037	NC_004463	T	6	6	635319	635324	0 %	100 %	0 %	0 %	27375699
16038	NC_004463	AGC	2	6	635332	635337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375699
16039	NC_004463	GAG	2	6	635349	635354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375699
16040	NC_004463	AAG	2	6	635458	635463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_004463	CAA	3	9	635473	635481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16042	NC_004463	CGGCGC	2	12	635509	635520	0 %	0 %	50 %	50 %	27375700
16043	NC_004463	CGG	2	6	635524	635529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375700
16044	NC_004463	TGG	2	6	635536	635541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375700
16045	NC_004463	GGCC	2	8	635554	635561	0 %	0 %	50 %	50 %	27375700
16046	NC_004463	GC	3	6	635590	635595	0 %	0 %	50 %	50 %	27375700
16047	NC_004463	TCA	2	6	635622	635627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375700
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16049	NC_004463	CGA	2	6	635734	635739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375700
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16051	NC_004463	CGG	2	6	635854	635859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375700
16052	NC_004463	GGT	2	6	635899	635904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375700
16053	NC_004463	CGA	2	6	635977	635982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375700
16054	NC_004463	GCCA	2	8	636014	636021	25 %	0 %	25 %	50 %	27375700
16055	NC_004463	CAT	2	6	636025	636030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375700
16056	NC_004463	TCCTC	2	10	636057	636066	0 %	40 %	0 %	60 %	27375700
16057	NC_004463	CCA	2	6	636078	636083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375700
16058	NC_004463	GC	3	6	636091	636096	0 %	0 %	50 %	50 %	27375700
16059	NC_004463	CGC	2	6	636115	636120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375700
16060	NC_004463	CGG	2	6	636124	636129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375700
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16065	NC_004463	CGT	2	6	636307	636312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375700
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16069	NC_004463	GTC	2	6	636437	636442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16070	NC_004463	CGT	2	6	636501	636506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16071	NC_004463	GC	4	8	636558	636565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16072	NC_004463	GC	3	6	636571	636576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16073	NC_004463	CGG	2	6	636590	636595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16074	NC_004463	CCG	2	6	636634	636639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375701
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16078	NC_004463	GC	3	6	636764	636769	0 %	0 %	50 %	50 %	27375701
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16087	NC_004463	GCCTTG	2	12	637095	637106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375701
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16093	NC_004463	GC	3	6	637296	637301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16094	NC_004463	GC	3	6	637306	637311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16095	NC_004463	ACG	2	6	637320	637325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16097	NC_004463	CG	3	6	637382	637387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16103	NC_004463	CGA	2	6	637558	637563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375702
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16106	NC_004463	TGT	2	6	637630	637635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27375702
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16108	NC_004463	GAGCG	2	10	637682	637691	20 %	0 %	60 %	20 %	27375702
16109	NC_004463	GCG	2	6	637717	637722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375702
16110	NC_004463	TGG	2	6	637776	637781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375702
16111	NC_004463	TCG	2	6	637845	637850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375702
16112	NC_004463	CGC	2	6	637909	637914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375702
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16120	NC_004463	CG	3	6	638346	638351	0 %	0 %	50 %	50 %	27375702
16121	NC_004463	GGCA	2	8	638390	638397	25 %	0 %	50 %	25 %	27375702
16122	NC_004463	TCT	2	6	638404	638409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375702
16123	NC_004463	TCA	2	6	638410	638415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375702
16124	NC_004463	CGC	2	6	638417	638422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375702
16125	NC_004463	CGG	2	6	638447	638452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375702
16126	NC_004463	CGG	2	6	638459	638464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375702
16127	NC_004463	TCG	2	6	638490	638495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375702
16128	NC_004463	CGG	2	6	638513	638518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375702
16129	NC_004463	TTC	2	6	638553	638558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375702
16130	NC_004463	CTG	2	6	638576	638581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375702
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16234	NC_004463	GCGATG	2	12	643110	643121	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	27375707
16235	NC_004463	GCG	2	6	643203	643208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375707
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16242	NC_004463	CCAC	2	8	643555	643562	25 %	0 %	0 %	75 %	27375707
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16353	NC_004463	TGC	2	6	648137	648142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375713
16354	NC_004463	CAA	2	6	648195	648200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16355	NC_004463	GTC	2	6	648208	648213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16356	NC_004463	AGGG	2	8	648241	648248	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16357	NC_004463	TGC	2	6	648291	648296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16358	NC_004463	GC	4	8	648317	648324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16359	NC_004463	GC	3	6	648330	648335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16360	NC_004463	GAC	2	6	648344	648349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16361	NC_004463	CAG	2	6	648401	648406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375714
16362	NC_004463	TTC	2	6	648453	648458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375714
16363	NC_004463	GCG	2	6	648460	648465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375714
16364	NC_004463	CGA	2	6	648475	648480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375714
16365	NC_004463	GGCCGA	2	12	648481	648492	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	27375714
16366	NC_004463	GCA	2	6	648508	648513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375714
16367	NC_004463	TGG	2	6	648550	648555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375714
16368	NC_004463	GCG	2	6	648581	648586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375714
16369	NC_004463	CG	3	6	648639	648644	0 %	0 %	50 %	50 %	27375714
16370	NC_004463	CGA	3	9	648649	648657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375714
16371	NC_004463	GCG	2	6	648669	648674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375714
16372	NC_004463	GC	3	6	648770	648775	0 %	0 %	50 %	50 %	27375714
16373	NC_004463	GC	3	6	648798	648803	0 %	0 %	50 %	50 %	27375714
16374	NC_004463	GCT	2	6	648847	648852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375714
16375	NC_004463	TCG	2	6	648873	648878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375714
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16378	NC_004463	GAG	2	6	648930	648935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375714
16379	NC_004463	GAC	2	6	649028	649033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375714
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16382	NC_004463	CGG	2	6	649108	649113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375714
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16395	NC_004463	CGA	2	6	649498	649503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375714
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16450	NC_004463	ACG	2	6	652166	652171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16475	NC_004463	CG	4	8	652975	652982	0 %	0 %	50 %	50 %	27375718
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16484	NC_004463	CCG	2	6	653320	653325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375719
16485	NC_004463	GGC	2	6	653393	653398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375719
16486	NC_004463	GCA	2	6	653489	653494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375719
16487	NC_004463	AGC	2	6	653541	653546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16488	NC_004463	CCGAC	2	10	653630	653639	20 %	0 %	20 %	60 %	27375720
16489	NC_004463	GCA	2	6	653730	653735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375720
16490	NC_004463	TGC	2	6	653744	653749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375720
16491	NC_004463	CGGA	2	8	653810	653817	25 %	0 %	50 %	25 %	27375720
16492	NC_004463	TCG	2	6	653819	653824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375720
16493	NC_004463	GC	3	6	653842	653847	0 %	0 %	50 %	50 %	27375720
16494	NC_004463	TAA	2	6	653924	653929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16495	NC_004463	CGC	2	6	653950	653955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375721
16496	NC_004463	CGA	2	6	653971	653976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375721
16497	NC_004463	GCC	2	6	654007	654012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375721
16498	NC_004463	GC	3	6	654025	654030	0 %	0 %	50 %	50 %	27375721
16499	NC_004463	GCC	2	6	654145	654150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375721
16500	NC_004463	CGG	2	6	654196	654201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375721

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