MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 224297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_004463	CCG	2	6	616336	616341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15502	NC_004463	GTT	2	6	616345	616350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15503	NC_004463	CTG	2	6	616393	616398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15504	NC_004463	CGG	2	6	616408	616413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15505	NC_004463	CG	3	6	616415	616420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15506	NC_004463	GAC	2	6	616497	616502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15507	NC_004463	GCC	2	6	616555	616560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375685
15508	NC_004463	CGG	3	9	616589	616597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375685
15509	NC_004463	TGG	2	6	616613	616618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375685
15510	NC_004463	GCG	2	6	616671	616676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375685
15511	NC_004463	GTCGGC	2	12	616720	616731	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	27375685
15512	NC_004463	CGC	2	6	616796	616801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375685
15513	NC_004463	CCG	2	6	616802	616807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375685
15514	NC_004463	CGG	2	6	616848	616853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375685
15515	NC_004463	CGC	2	6	616856	616861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375685
15516	NC_004463	CGG	2	6	616896	616901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375685
15517	NC_004463	TCGG	2	8	616936	616943	0 %	25 %	50 %	25 %	27375685
15518	NC_004463	ACG	2	6	616979	616984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375685
15519	NC_004463	ACG	2	6	617020	617025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375685
15520	NC_004463	GA	3	6	617056	617061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_004463	T	6	6	617090	617095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_004463	CG	3	6	617116	617121	0 %	0 %	50 %	50 %	27375686
15523	NC_004463	GCC	2	6	617139	617144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375686
15524	NC_004463	GC	3	6	617154	617159	0 %	0 %	50 %	50 %	27375686
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15527	NC_004463	CG	3	6	617196	617201	0 %	0 %	50 %	50 %	27375686
15528	NC_004463	CGC	2	6	617264	617269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375686
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15533	NC_004463	CTG	2	6	617400	617405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375686
15534	NC_004463	CG	4	8	617411	617418	0 %	0 %	50 %	50 %	27375686
15535	NC_004463	GGA	2	6	617489	617494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375686
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15537	NC_004463	CGC	3	9	617568	617576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375686
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15540	NC_004463	CGA	2	6	617773	617778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15541	NC_004463	GCGCG	2	10	617793	617802	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15542	NC_004463	CCT	2	6	617829	617834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15543	NC_004463	GTT	2	6	617863	617868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_004463	TCG	2	6	617979	617984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375687
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15549	NC_004463	CT	3	6	618283	618288	0 %	50 %	0 %	50 %	27375687
15550	NC_004463	CCG	2	6	618324	618329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375687
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15554	NC_004463	CGC	2	6	618409	618414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375687
15555	NC_004463	CCG	2	6	618585	618590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375687
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15558	NC_004463	GGA	2	6	618676	618681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375687
15559	NC_004463	CGA	2	6	618700	618705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375687
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15561	NC_004463	CG	3	6	618738	618743	0 %	0 %	50 %	50 %	27375687
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15565	NC_004463	TCCTGG	2	12	618855	618866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375687
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15570	NC_004463	CG	3	6	619007	619012	0 %	0 %	50 %	50 %	27375687
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15594	NC_004463	CG	3	6	619585	619590	0 %	0 %	50 %	50 %	27375687
15595	NC_004463	CGA	2	6	619597	619602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375687
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15601	NC_004463	GGCGCC	2	12	619823	619834	0 %	0 %	50 %	50 %	27375687
15602	NC_004463	CG	3	6	619867	619872	0 %	0 %	50 %	50 %	27375687
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15606	NC_004463	CGGC	2	8	619962	619969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15607	NC_004463	CAT	2	6	619988	619993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15624	NC_004463	CGG	2	6	620932	620937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375688
15625	NC_004463	GC	3	6	620971	620976	0 %	0 %	50 %	50 %	27375688
15626	NC_004463	GGCT	2	8	621095	621102	0 %	25 %	50 %	25 %	27375688
15627	NC_004463	CGG	2	6	621208	621213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375688
15628	NC_004463	CG	3	6	621221	621226	0 %	0 %	50 %	50 %	27375688
15629	NC_004463	CGGCGA	2	12	621232	621243	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	27375688
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15632	NC_004463	ACG	2	6	621375	621380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375688
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15644	NC_004463	CGG	2	6	621928	621933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15645	NC_004463	CGCT	2	8	621940	621947	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15646	NC_004463	CCA	2	6	621986	621991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375690
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15857	NC_004463	TGA	2	6	628560	628565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375694
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15868	NC_004463	CGC	2	6	628932	628937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375694
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15988	NC_004463	GAT	2	6	633419	633424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375698
15989	NC_004463	CGG	2	6	633442	633447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375698
15990	NC_004463	TTCT	2	8	633471	633478	0 %	75 %	0 %	25 %	27375698
15991	NC_004463	GTT	2	6	633567	633572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27375698
15992	NC_004463	ACG	2	6	633576	633581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375698
15993	NC_004463	CTG	2	6	633594	633599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375698
15994	NC_004463	CTCGAT	2	12	633602	633613	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	27375698
15995	NC_004463	CGG	2	6	633623	633628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375698
15996	NC_004463	TGA	2	6	633646	633651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375698
15997	NC_004463	GC	3	6	633699	633704	0 %	0 %	50 %	50 %	27375698
15998	NC_004463	TGC	2	6	633709	633714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375698
15999	NC_004463	CTG	2	6	633741	633746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375698
16000	NC_004463	GAT	2	6	633755	633760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375698

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