MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 224297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15004	NC_004463	CGAT	2	8	596884	596891	25 %	25 %	25 %	25 %	27375668
15005	NC_004463	CGC	2	6	596915	596920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375668
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15123	NC_004463	CGA	2	6	601474	601479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15124	NC_004463	TG	3	6	601586	601591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_004463	CG	3	6	601661	601666	0 %	0 %	50 %	50 %	27375672
15126	NC_004463	TCA	2	6	601696	601701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375672
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15133	NC_004463	TGA	2	6	602000	602005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15231	NC_004463	CG	4	8	605598	605605	0 %	0 %	50 %	50 %	27375675
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15239	NC_004463	TCG	2	6	605918	605923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375676
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15242	NC_004463	CGCGC	2	10	606024	606033	0 %	0 %	40 %	60 %	27375676
15243	NC_004463	CGA	2	6	606036	606041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375676
15244	NC_004463	GCA	2	6	606056	606061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375676
15245	NC_004463	CGA	2	6	606156	606161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375676
15246	NC_004463	GCC	3	9	606163	606171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375676
15247	NC_004463	CCG	2	6	606186	606191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375676
15248	NC_004463	GCG	2	6	606192	606197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375676
15249	NC_004463	GAG	2	6	606217	606222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375676
15250	NC_004463	CGA	2	6	606256	606261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375676
15251	NC_004463	GCC	2	6	606299	606304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375676
15252	NC_004463	CCGCG	2	10	606310	606319	0 %	0 %	40 %	60 %	27375676
15253	NC_004463	GCC	3	9	606371	606379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375676
15254	NC_004463	GTC	2	6	606400	606405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375676
15255	NC_004463	TCT	2	6	606426	606431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375676
15256	NC_004463	CTG	2	6	606436	606441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375676
15257	NC_004463	GC	3	6	606470	606475	0 %	0 %	50 %	50 %	27375676
15258	NC_004463	GCG	2	6	606521	606526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375676
15259	NC_004463	CGT	2	6	606543	606548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375676
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15265	NC_004463	CCAGC	2	10	606766	606775	20 %	0 %	20 %	60 %	27375676
15266	NC_004463	ACG	2	6	606794	606799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375676
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15269	NC_004463	GCTCGG	2	12	606930	606941	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	27375676
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15271	NC_004463	CGG	2	6	606955	606960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375676
15272	NC_004463	CGCC	2	8	606972	606979	0 %	0 %	25 %	75 %	27375676
15273	NC_004463	CCT	2	6	606981	606986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375676
15274	NC_004463	CGG	2	6	607027	607032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375676
15275	NC_004463	G	6	6	607031	607036	0 %	0 %	100 %	0 %	27375676
15276	NC_004463	GTC	2	6	607084	607089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375676
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15279	NC_004463	GCA	2	6	607311	607316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375677
15280	NC_004463	CG	3	6	607378	607383	0 %	0 %	50 %	50 %	27375677
15281	NC_004463	CG	3	6	607445	607450	0 %	0 %	50 %	50 %	27375677
15282	NC_004463	GGT	2	6	607479	607484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375677
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15288	NC_004463	CG	3	6	607592	607597	0 %	0 %	50 %	50 %	27375677
15289	NC_004463	GAC	2	6	607605	607610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375677
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15292	NC_004463	GCG	2	6	607742	607747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375677
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15297	NC_004463	CCG	2	6	607883	607888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375677
15298	NC_004463	GTGACG	2	12	607952	607963	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15299	NC_004463	CG	3	6	607980	607985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15300	NC_004463	ACC	2	6	608104	608109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375678
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15303	NC_004463	GC	4	8	608139	608146	0 %	0 %	50 %	50 %	27375678
15304	NC_004463	CGG	2	6	608211	608216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375678
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15307	NC_004463	CG	3	6	608239	608244	0 %	0 %	50 %	50 %	27375678
15308	NC_004463	CAT	2	6	608265	608270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375678
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15311	NC_004463	TCG	2	6	608360	608365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375678
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15319	NC_004463	GGC	2	6	608649	608654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375678
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15322	NC_004463	GCAGG	2	10	608694	608703	20 %	0 %	60 %	20 %	27375678
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15330	NC_004463	GC	3	6	608939	608944	0 %	0 %	50 %	50 %	27375678
15331	NC_004463	GCC	3	9	608985	608993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375678
15332	NC_004463	GAT	2	6	609018	609023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375678
15333	NC_004463	AGCCC	2	10	609075	609084	20 %	0 %	20 %	60 %	27375678
15334	NC_004463	GCTG	2	8	609092	609099	0 %	25 %	50 %	25 %	27375678
15335	NC_004463	GGAG	2	8	609331	609338	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15336	NC_004463	TGG	2	6	609406	609411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375679
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15340	NC_004463	CGAG	2	8	609535	609542	25 %	0 %	50 %	25 %	27375679
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15355	NC_004463	CG	3	6	609988	609993	0 %	0 %	50 %	50 %	27375679
15356	NC_004463	GCG	2	6	610027	610032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375679
15357	NC_004463	CG	3	6	610031	610036	0 %	0 %	50 %	50 %	27375679
15358	NC_004463	GTT	2	6	610084	610089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27375679
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15361	NC_004463	CGG	2	6	610150	610155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375679
15362	NC_004463	ACA	2	6	610258	610263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375679
15363	NC_004463	GCT	2	6	610292	610297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375679
15364	NC_004463	AGA	2	6	610316	610321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375679
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15366	NC_004463	GC	3	6	610470	610475	0 %	0 %	50 %	50 %	27375680
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15489	NC_004463	CGA	2	6	615687	615692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375684
15490	NC_004463	TCA	2	6	615695	615700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375684
15491	NC_004463	GC	3	6	615740	615745	0 %	0 %	50 %	50 %	27375684
15492	NC_004463	CGT	2	6	615777	615782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375684
15493	NC_004463	CCGA	2	8	615850	615857	25 %	0 %	25 %	50 %	27375684
15494	NC_004463	TCGCC	2	10	615908	615917	0 %	20 %	20 %	60 %	27375684
15495	NC_004463	CCG	2	6	616043	616048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375684
15496	NC_004463	CGA	2	6	616053	616058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375684
15497	NC_004463	AAG	2	6	616081	616086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375684
15498	NC_004463	CGCAG	2	10	616117	616126	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15499	NC_004463	C	6	6	616265	616270	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15500	NC_004463	ACA	2	6	616274	616279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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