MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 224297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_004463	CGG	2	6	576255	576260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375646
14502	NC_004463	CAC	2	6	576395	576400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14503	NC_004463	CTCG	2	8	576449	576456	0 %	25 %	25 %	50 %	27375647
14504	NC_004463	CG	3	6	576488	576493	0 %	0 %	50 %	50 %	27375647
14505	NC_004463	GCCG	2	8	576520	576527	0 %	0 %	50 %	50 %	27375647
14506	NC_004463	CAA	2	6	576530	576535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375647
14507	NC_004463	CTG	2	6	576537	576542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375647
14508	NC_004463	GCT	2	6	576569	576574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375647
14509	NC_004463	GCT	2	6	576614	576619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375647
14510	NC_004463	CGA	2	6	576632	576637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375647
14511	NC_004463	CGG	2	6	576746	576751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375647
14512	NC_004463	CGG	2	6	576803	576808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375647
14513	NC_004463	GC	3	6	576816	576821	0 %	0 %	50 %	50 %	27375647
14514	NC_004463	GGC	2	6	576842	576847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375647
14515	NC_004463	TCGA	2	8	576945	576952	25 %	25 %	25 %	25 %	27375647
14516	NC_004463	GGC	2	6	576977	576982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375647
14517	NC_004463	CGA	2	6	576998	577003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375647
14518	NC_004463	AGC	2	6	577005	577010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375647
14519	NC_004463	AGC	2	6	577027	577032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375647
14520	NC_004463	GCT	2	6	577040	577045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375647
14521	NC_004463	CGCGG	2	10	577111	577120	0 %	0 %	60 %	40 %	27375647
14522	NC_004463	CCGCGA	2	12	577133	577144	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	27375647
14523	NC_004463	CGCCTG	2	12	577146	577157	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	27375647
14524	NC_004463	GCCT	2	8	577161	577168	0 %	25 %	25 %	50 %	27375647
14525	NC_004463	GAA	2	6	577184	577189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375647
14526	NC_004463	TGC	2	6	577204	577209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375647
14527	NC_004463	GCG	2	6	577210	577215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375647
14528	NC_004463	GGA	2	6	577226	577231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375647
14529	NC_004463	AGC	2	6	577236	577241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375647
14530	NC_004463	GC	3	6	577260	577265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14531	NC_004463	GCTT	2	8	577335	577342	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14532	NC_004463	GCG	2	6	577405	577410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14533	NC_004463	CAC	2	6	577423	577428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14534	NC_004463	TCC	2	6	577438	577443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14535	NC_004463	ACCCC	2	10	577473	577482	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
14536	NC_004463	GCC	2	6	577523	577528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14537	NC_004463	CAC	2	6	577539	577544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14538	NC_004463	CCG	2	6	577597	577602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375648
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14540	NC_004463	TGGC	2	8	577662	577669	0 %	25 %	50 %	25 %	27375648
14541	NC_004463	GCG	2	6	577677	577682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375648
14542	NC_004463	CGC	2	6	577745	577750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375648
14543	NC_004463	GC	3	6	577827	577832	0 %	0 %	50 %	50 %	27375648
14544	NC_004463	GC	3	6	577843	577848	0 %	0 %	50 %	50 %	27375648
14545	NC_004463	CGG	2	6	577853	577858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375648
14546	NC_004463	GC	3	6	577912	577917	0 %	0 %	50 %	50 %	27375648
14547	NC_004463	CGGCT	2	10	577956	577965	0 %	20 %	40 %	40 %	27375648
14548	NC_004463	CGA	2	6	577982	577987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375648
14549	NC_004463	GCT	2	6	578096	578101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375648
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14551	NC_004463	AGCGC	2	10	578177	578186	20 %	0 %	40 %	40 %	27375648
14552	NC_004463	CTG	2	6	578247	578252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375648
14553	NC_004463	TCC	2	6	578263	578268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375648
14554	NC_004463	CGC	2	6	578273	578278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375648
14555	NC_004463	TCT	2	6	578351	578356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375649
14556	NC_004463	CCTG	2	8	578384	578391	0 %	25 %	25 %	50 %	27375649
14557	NC_004463	AGATCC	2	12	578408	578419	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	27375649
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14559	NC_004463	CCGC	2	8	578535	578542	0 %	0 %	25 %	75 %	27375649
14560	NC_004463	GCACC	2	10	578553	578562	20 %	0 %	20 %	60 %	27375649
14561	NC_004463	AGC	2	6	578606	578611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375649
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14564	NC_004463	GC	3	6	578832	578837	0 %	0 %	50 %	50 %	27375649
14565	NC_004463	CAG	2	6	579013	579018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375649
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14567	NC_004463	ATG	2	6	579086	579091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375649
14568	NC_004463	TGCG	2	8	579133	579140	0 %	25 %	50 %	25 %	27375649
14569	NC_004463	GCCG	2	8	579169	579176	0 %	0 %	50 %	50 %	27375649
14570	NC_004463	ACCG	2	8	579199	579206	25 %	0 %	25 %	50 %	27375649
14571	NC_004463	CAT	2	6	579207	579212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375649
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14581	NC_004463	CGC	2	6	579793	579798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14582	NC_004463	GCC	2	6	579821	579826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14584	NC_004463	CGG	2	6	579908	579913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14585	NC_004463	GATTG	2	10	579935	579944	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14586	NC_004463	CG	3	6	579978	579983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14587	NC_004463	CCT	2	6	580016	580021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14588	NC_004463	C	7	7	580036	580042	0 %	0 %	0 %	100 %	27375650
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14596	NC_004463	GTC	2	6	580221	580226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375650
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14600	NC_004463	T	6	6	580359	580364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_004463	AT	3	6	580377	580382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14602	NC_004463	GTT	2	6	580465	580470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_004463	CTCA	2	8	580535	580542	25 %	25 %	0 %	50 %	27375651
14604	NC_004463	CAT	2	6	580562	580567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375651
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14614	NC_004463	TGG	2	6	580828	580833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375651
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14619	NC_004463	TCA	2	6	580954	580959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375651
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14621	NC_004463	CGC	2	6	581122	581127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375651
14622	NC_004463	CAT	2	6	581195	581200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375651
14623	NC_004463	CAG	2	6	581238	581243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375651
14624	NC_004463	TGG	2	6	581272	581277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375651
14625	NC_004463	CGC	2	6	581326	581331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375651
14626	NC_004463	TCG	2	6	581356	581361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375651
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14628	NC_004463	CCG	2	6	581448	581453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375651
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14652	NC_004463	TGG	2	6	582441	582446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14654	NC_004463	TGA	2	6	582546	582551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14656	NC_004463	GCCC	2	8	582597	582604	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14657	NC_004463	TCCCT	2	10	582611	582620	0 %	40 %	0 %	60 %	27375652
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14661	NC_004463	CGG	2	6	582730	582735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375652
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14732	NC_004463	GC	4	8	586029	586036	0 %	0 %	50 %	50 %	27375655
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14735	NC_004463	GCGGT	2	10	586154	586163	0 %	20 %	60 %	20 %	27375655
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14740	NC_004463	TCT	2	6	586398	586403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375655
14741	NC_004463	GC	3	6	586420	586425	0 %	0 %	50 %	50 %	27375655
14742	NC_004463	CG	4	8	586448	586455	0 %	0 %	50 %	50 %	27375655
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14865	NC_004463	CTTGA	2	10	591179	591188	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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14991	NC_004463	CGG	2	6	596364	596369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375667
14992	NC_004463	GAC	2	6	596508	596513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375668
14993	NC_004463	GCCAGC	2	12	596575	596586	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	27375668
14994	NC_004463	GC	3	6	596609	596614	0 %	0 %	50 %	50 %	27375668
14995	NC_004463	CG	3	6	596624	596629	0 %	0 %	50 %	50 %	27375668
14996	NC_004463	GAAC	2	8	596693	596700	50 %	0 %	25 %	25 %	27375668
14997	NC_004463	GCA	2	6	596735	596740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375668
14998	NC_004463	ATG	3	9	596755	596763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375668
14999	NC_004463	CG	5	10	596802	596811	0 %	0 %	50 %	50 %	27375668
15000	NC_004463	CG	3	6	596815	596820	0 %	0 %	50 %	50 %	27375668

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