MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 224297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_004463	CGA	2	6	557114	557119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375628
14002	NC_004463	GAG	2	6	557172	557177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375628
14003	NC_004463	CGG	2	6	557204	557209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375628
14004	NC_004463	AGC	2	6	557215	557220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375628
14005	NC_004463	CG	3	6	557231	557236	0 %	0 %	50 %	50 %	27375628
14006	NC_004463	CTG	2	6	557241	557246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375628
14007	NC_004463	TCG	2	6	557260	557265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375628
14008	NC_004463	CGA	2	6	557291	557296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375628
14009	NC_004463	GAT	2	6	557312	557317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375628
14010	NC_004463	GCG	2	6	557414	557419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375628
14011	NC_004463	GCG	2	6	557425	557430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375628
14012	NC_004463	GCT	2	6	557480	557485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375628
14013	NC_004463	GCG	2	6	557526	557531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375628
14014	NC_004463	TC	4	8	557541	557548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14015	NC_004463	TCG	2	6	557551	557556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_004463	GA	3	6	557610	557615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_004463	CTC	2	6	557653	557658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14018	NC_004463	GAC	2	6	557697	557702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14019	NC_004463	ATGC	2	8	557742	557749	25 %	25 %	25 %	25 %	27375629
14020	NC_004463	ACC	2	6	557766	557771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375629
14021	NC_004463	GAC	2	6	557777	557782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375629
14022	NC_004463	GCG	2	6	557829	557834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375629
14023	NC_004463	GCGCG	2	10	557876	557885	0 %	0 %	60 %	40 %	27375629
14024	NC_004463	CTG	2	6	557916	557921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375629
14025	NC_004463	CGG	2	6	557924	557929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375629
14026	NC_004463	ACC	2	6	557971	557976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375629
14027	NC_004463	GCGCG	2	10	557993	558002	0 %	0 %	60 %	40 %	27375629
14028	NC_004463	CGA	2	6	558026	558031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375629
14029	NC_004463	CGG	2	6	558058	558063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375629
14030	NC_004463	GCG	2	6	558064	558069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375629
14031	NC_004463	TC	3	6	558182	558187	0 %	50 %	0 %	50 %	27375629
14032	NC_004463	CGC	2	6	558197	558202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375629
14033	NC_004463	GCA	2	6	558237	558242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375629
14034	NC_004463	TGA	2	6	558262	558267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375629
14035	NC_004463	GCG	3	9	558274	558282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375629
14036	NC_004463	CCAC	2	8	558295	558302	25 %	0 %	0 %	75 %	27375629
14037	NC_004463	GTC	2	6	558303	558308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375629
14038	NC_004463	CGA	2	6	558368	558373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375629
14039	NC_004463	CTT	2	6	558443	558448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375629
14040	NC_004463	CGC	2	6	558457	558462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375629
14041	NC_004463	CG	3	6	558477	558482	0 %	0 %	50 %	50 %	27375629
14042	NC_004463	GTG	2	6	558483	558488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375629
14043	NC_004463	GCA	2	6	558515	558520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375629
14044	NC_004463	CG	4	8	558542	558549	0 %	0 %	50 %	50 %	27375629
14045	NC_004463	CGCA	2	8	558560	558567	25 %	0 %	25 %	50 %	27375629
14046	NC_004463	AAC	2	6	558608	558613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14047	NC_004463	GAT	2	6	558623	558628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375630
14048	NC_004463	TCTCCG	2	12	558643	558654	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	27375630
14049	NC_004463	GC	3	6	558662	558667	0 %	0 %	50 %	50 %	27375630
14050	NC_004463	TCA	2	6	558712	558717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375630
14051	NC_004463	CGG	2	6	558727	558732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375630
14052	NC_004463	GCC	2	6	558753	558758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375630
14053	NC_004463	GGC	2	6	558795	558800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375630
14054	NC_004463	GGC	2	6	558875	558880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375630
14055	NC_004463	GGT	2	6	558891	558896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375630
14056	NC_004463	TCCG	2	8	558919	558926	0 %	25 %	25 %	50 %	27375630
14057	NC_004463	ATC	2	6	558931	558936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375630
14058	NC_004463	GC	3	6	559011	559016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14059	NC_004463	CGA	2	6	559021	559026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14060	NC_004463	GTT	2	6	559057	559062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_004463	GAT	2	6	559084	559089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375631
14062	NC_004463	GCCGAT	2	12	559090	559101	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	27375631
14063	NC_004463	GCC	3	9	559147	559155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375631
14064	NC_004463	CCG	2	6	559163	559168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375631
14065	NC_004463	CGC	2	6	559191	559196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375631
14066	NC_004463	CGA	2	6	559228	559233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375631
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14068	NC_004463	GACG	2	8	559303	559310	25 %	0 %	50 %	25 %	27375631
14069	NC_004463	CGG	2	6	559319	559324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375631
14070	NC_004463	AAAT	2	8	559420	559427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_004463	CAC	2	6	559483	559488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14072	NC_004463	CAC	2	6	559516	559521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14073	NC_004463	TTCGT	2	10	559533	559542	0 %	60 %	20 %	20 %	27375632
14074	NC_004463	GCT	2	6	559543	559548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375632
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14077	NC_004463	CGC	2	6	559611	559616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375632
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14080	NC_004463	TGC	2	6	559705	559710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375632
14081	NC_004463	CG	3	6	559714	559719	0 %	0 %	50 %	50 %	27375632
14082	NC_004463	CCG	2	6	559730	559735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375632
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14086	NC_004463	CCG	2	6	559772	559777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375632
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14093	NC_004463	AGC	2	6	559878	559883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375632
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14098	NC_004463	CGC	3	9	559977	559985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375632
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14102	NC_004463	TCCGAC	2	12	560038	560049	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	27375632
14103	NC_004463	CCG	3	9	560054	560062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375632
14104	NC_004463	CCT	2	6	560063	560068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375632
14105	NC_004463	CGCGG	2	10	560077	560086	0 %	0 %	60 %	40 %	27375632
14106	NC_004463	CAACGC	2	12	560106	560117	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	27375632
14107	NC_004463	CTC	2	6	560124	560129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375632
14108	NC_004463	GCCC	2	8	560147	560154	0 %	0 %	25 %	75 %	27375632
14109	NC_004463	GCA	2	6	560244	560249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375632
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14112	NC_004463	CGG	2	6	560377	560382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375632
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14120	NC_004463	GC	3	6	560553	560558	0 %	0 %	50 %	50 %	27375632
14121	NC_004463	CTG	2	6	560559	560564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375632
14122	NC_004463	GCC	2	6	560581	560586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375632
14123	NC_004463	CGG	2	6	560593	560598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375632
14124	NC_004463	CCCGG	2	10	560602	560611	0 %	0 %	40 %	60 %	27375632
14125	NC_004463	CGG	2	6	560658	560663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375632
14126	NC_004463	CGC	3	9	560670	560678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375632
14127	NC_004463	CCG	2	6	560699	560704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375632
14128	NC_004463	GCCT	2	8	560713	560720	0 %	25 %	25 %	50 %	27375632
14129	NC_004463	GTC	2	6	560738	560743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375632
14130	NC_004463	CCG	2	6	560759	560764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375632
14131	NC_004463	CCG	2	6	560768	560773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375632
14132	NC_004463	CGC	2	6	560787	560792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375632
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14135	NC_004463	CAT	3	9	560911	560919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375632
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14141	NC_004463	TGC	2	6	561084	561089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375632
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14146	NC_004463	CGC	3	9	561183	561191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375632
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14151	NC_004463	GGC	2	6	561412	561417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375632
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14153	NC_004463	CTGTCG	2	12	561527	561538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375632
14154	NC_004463	CCG	2	6	561541	561546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375632
14155	NC_004463	CG	3	6	561545	561550	0 %	0 %	50 %	50 %	27375632
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14159	NC_004463	GCC	3	9	561724	561732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375632
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14161	NC_004463	CGC	3	9	561747	561755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375632
14162	NC_004463	CA	4	8	561764	561771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14163	NC_004463	GTT	2	6	561814	561819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14164	NC_004463	GC	3	6	561820	561825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14165	NC_004463	GC	3	6	561865	561870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14166	NC_004463	CAC	2	6	561883	561888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14167	NC_004463	TGG	2	6	561908	561913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14168	NC_004463	CGCTT	2	10	561917	561926	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14169	NC_004463	CGGC	2	8	562089	562096	0 %	0 %	50 %	50 %	27375633
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14191	NC_004463	AGC	2	6	563204	563209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375633
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14227	NC_004463	CAG	2	6	564721	564726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375635
14228	NC_004463	CGA	4	12	564729	564740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375635
14229	NC_004463	GCC	2	6	564745	564750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375635
14230	NC_004463	GGC	2	6	564760	564765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375635
14231	NC_004463	GAC	2	6	564784	564789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375635
14232	NC_004463	GGC	2	6	564792	564797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375635
14233	NC_004463	GCA	2	6	564853	564858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14234	NC_004463	CG	3	6	564895	564900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14235	NC_004463	GC	3	6	564996	565001	0 %	0 %	50 %	50 %	27375636
14236	NC_004463	GGC	2	6	565058	565063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375636
14237	NC_004463	CG	3	6	565078	565083	0 %	0 %	50 %	50 %	27375636
14238	NC_004463	AGC	2	6	565224	565229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375636
14239	NC_004463	CAG	2	6	565235	565240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375636
14240	NC_004463	TCG	2	6	565248	565253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375636
14241	NC_004463	GCG	2	6	565298	565303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375636
14242	NC_004463	GCA	2	6	565339	565344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375636
14243	NC_004463	TCG	2	6	565395	565400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375636
14244	NC_004463	CG	3	6	565448	565453	0 %	0 %	50 %	50 %	27375636
14245	NC_004463	CAC	2	6	565466	565471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375636
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14247	NC_004463	GATGCC	2	12	565505	565516	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	27375636
14248	NC_004463	CGA	2	6	565528	565533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375636
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14250	NC_004463	GCCCAT	2	12	565577	565588	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	27375636
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14254	NC_004463	GCA	2	6	565849	565854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375636
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14263	NC_004463	ATGGA	2	10	566178	566187	40 %	20 %	40 %	0 %	27375636
14264	NC_004463	CG	3	6	566260	566265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14265	NC_004463	TA	3	6	566299	566304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14266	NC_004463	GTCG	2	8	566437	566444	0 %	25 %	50 %	25 %	27375637
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14366	NC_004463	TCG	2	6	570845	570850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375641
14367	NC_004463	CGT	2	6	570909	570914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375641
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14382	NC_004463	CGT	2	6	571750	571755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14384	NC_004463	GGA	2	6	571779	571784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14385	NC_004463	CGA	2	6	571790	571795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14457	NC_004463	GC	3	6	574245	574250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14458	NC_004463	GGTCC	2	10	574281	574290	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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14479	NC_004463	CAA	2	6	575089	575094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375645
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14482	NC_004463	CGA	2	6	575269	575274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375645
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14484	NC_004463	TCG	2	6	575430	575435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375645
14485	NC_004463	TCA	2	6	575529	575534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375645
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14487	NC_004463	TAC	2	6	575597	575602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375645
14488	NC_004463	ACA	2	6	575697	575702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375645
14489	NC_004463	GCC	2	6	575758	575763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375645
14490	NC_004463	CGGC	2	8	575766	575773	0 %	0 %	50 %	50 %	27375645
14491	NC_004463	TTC	2	6	575780	575785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375645
14492	NC_004463	CGA	2	6	575862	575867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375645
14493	NC_004463	CG	3	6	575922	575927	0 %	0 %	50 %	50 %	27375646
14494	NC_004463	GACGAA	2	12	576028	576039	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	27375646
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14496	NC_004463	AGC	2	6	576107	576112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375646
14497	NC_004463	GC	5	10	576123	576132	0 %	0 %	50 %	50 %	27375646
14498	NC_004463	CAG	2	6	576196	576201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375646
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14500	NC_004463	CGA	2	6	576240	576245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375646

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