MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 224297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_004463	CAC	2	6	537071	537076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375612
13503	NC_004463	CGG	2	6	537141	537146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375612
13504	NC_004463	GGCGT	2	10	537155	537164	0 %	20 %	60 %	20 %	27375612
13505	NC_004463	GCC	2	6	537166	537171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375612
13506	NC_004463	GC	3	6	537223	537228	0 %	0 %	50 %	50 %	27375612
13507	NC_004463	TCG	2	6	537230	537235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375612
13508	NC_004463	CGA	2	6	537282	537287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375612
13509	NC_004463	GCACGC	2	12	537294	537305	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	27375612
13510	NC_004463	TCT	2	6	537339	537344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375612
13511	NC_004463	CAT	3	9	537352	537360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375612
13512	NC_004463	TCC	2	6	537386	537391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375612
13513	NC_004463	ATG	2	6	537413	537418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375612
13514	NC_004463	GC	3	6	537430	537435	0 %	0 %	50 %	50 %	27375612
13515	NC_004463	CTT	2	6	537442	537447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375612
13516	NC_004463	ACG	2	6	537548	537553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375612
13517	NC_004463	GAT	2	6	537628	537633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375612
13518	NC_004463	TTC	2	6	537635	537640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375612
13519	NC_004463	CGG	2	6	537741	537746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375612
13520	NC_004463	GCC	2	6	537781	537786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375612
13521	NC_004463	CGACGC	2	12	537873	537884	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	27375612
13522	NC_004463	GCG	2	6	537886	537891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375612
13523	NC_004463	CGA	2	6	537978	537983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375612
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13526	NC_004463	CGA	2	6	538187	538192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375613
13527	NC_004463	GTC	2	6	538194	538199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375613
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13529	NC_004463	CGA	3	9	538292	538300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375613
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13540	NC_004463	GC	3	6	538724	538729	0 %	0 %	50 %	50 %	27375613
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13548	NC_004463	TGA	2	6	539053	539058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13550	NC_004463	GGCG	2	8	539102	539109	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13551	NC_004463	AGC	2	6	539161	539166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13552	NC_004463	CGGC	2	8	539180	539187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13553	NC_004463	CAG	2	6	539223	539228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13554	NC_004463	CGG	2	6	539270	539275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13555	NC_004463	CGG	2	6	539326	539331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13556	NC_004463	CGAT	2	8	539371	539378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13557	NC_004463	CCG	2	6	539394	539399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13558	NC_004463	CGG	2	6	539408	539413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13563	NC_004463	GC	3	6	539705	539710	0 %	0 %	50 %	50 %	27375614
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13733	NC_004463	GACC	2	8	546546	546553	25 %	0 %	25 %	50 %	27375620
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13746	NC_004463	GTC	2	6	547103	547108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13869	NC_004463	GAA	2	6	552416	552421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375626
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13875	NC_004463	ACG	2	6	552709	552714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375626
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13987	NC_004463	GC	4	8	556720	556727	0 %	0 %	50 %	50 %	27375628
13988	NC_004463	TGA	2	6	556741	556746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375628
13989	NC_004463	GC	3	6	556766	556771	0 %	0 %	50 %	50 %	27375628
13990	NC_004463	GCG	2	6	556804	556809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375628
13991	NC_004463	CGA	2	6	556859	556864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375628
13992	NC_004463	CCG	2	6	556870	556875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375628
13993	NC_004463	GGT	2	6	556892	556897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375628
13994	NC_004463	CTG	2	6	556917	556922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375628
13995	NC_004463	CCGGCA	2	12	556936	556947	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	27375628
13996	NC_004463	GC	3	6	556961	556966	0 %	0 %	50 %	50 %	27375628
13997	NC_004463	GCG	2	6	556990	556995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375628
13998	NC_004463	TGC	2	6	557032	557037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375628
13999	NC_004463	GCGCC	2	10	557069	557078	0 %	0 %	40 %	60 %	27375628
14000	NC_004463	GAC	2	6	557100	557105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375628

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