MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 224297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_004463	CGC	2	6	499706	499711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375572
12502	NC_004463	GCT	2	6	499712	499717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375572
12503	NC_004463	CGG	2	6	499721	499726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375572
12504	NC_004463	ATCT	2	8	499827	499834	25 %	50 %	0 %	25 %	27375572
12505	NC_004463	CTG	2	6	499848	499853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375572
12506	NC_004463	GCC	2	6	499890	499895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375572
12507	NC_004463	TCG	2	6	499909	499914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375572
12508	NC_004463	TGC	2	6	499930	499935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375572
12509	NC_004463	GGT	2	6	499943	499948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375572
12510	NC_004463	GCCG	2	8	499949	499956	0 %	0 %	50 %	50 %	27375572
12511	NC_004463	CGA	2	6	499964	499969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375572
12512	NC_004463	ACG	2	6	500041	500046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375572
12513	NC_004463	CGC	2	6	500054	500059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375572
12514	NC_004463	CGT	2	6	500126	500131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375572
12515	NC_004463	TCG	2	6	500143	500148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375572
12516	NC_004463	CGG	2	6	500185	500190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375572
12517	NC_004463	CCT	2	6	500200	500205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375572
12518	NC_004463	GTC	2	6	500208	500213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375572
12519	NC_004463	TGC	2	6	500224	500229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375572
12520	NC_004463	CGC	2	6	500237	500242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375572
12521	NC_004463	CTG	2	6	500244	500249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375572
12522	NC_004463	CG	3	6	500258	500263	0 %	0 %	50 %	50 %	27375572
12523	NC_004463	TGC	2	6	500290	500295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375572
12524	NC_004463	CCGG	2	8	500318	500325	0 %	0 %	50 %	50 %	27375572
12525	NC_004463	GC	3	6	500326	500331	0 %	0 %	50 %	50 %	27375572
12526	NC_004463	CGT	2	6	500446	500451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375572
12527	NC_004463	TCT	2	6	500452	500457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375572
12528	NC_004463	GGC	2	6	500480	500485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375572
12529	NC_004463	TGC	2	6	500545	500550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375572
12530	NC_004463	TCG	2	6	500560	500565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375572
12531	NC_004463	CGA	2	6	500599	500604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375572
12532	NC_004463	TGC	2	6	500620	500625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375572
12533	NC_004463	GGT	2	6	500675	500680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375572
12534	NC_004463	GTG	2	6	500690	500695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375572
12535	NC_004463	CGC	2	6	500716	500721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375572
12536	NC_004463	GAA	2	6	500735	500740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375572
12537	NC_004463	CGA	2	6	500771	500776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375572
12538	NC_004463	GC	3	6	500896	500901	0 %	0 %	50 %	50 %	27375572
12539	NC_004463	GCA	2	6	500935	500940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375572
12540	NC_004463	ATC	2	6	500961	500966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375572
12541	NC_004463	GCGTGC	2	12	501001	501012	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	27375572
12542	NC_004463	GGGCG	2	10	501110	501119	0 %	0 %	80 %	20 %	27375572
12543	NC_004463	CGGC	2	8	501124	501131	0 %	0 %	50 %	50 %	27375572
12544	NC_004463	CGGCTG	2	12	501183	501194	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	27375572
12545	NC_004463	CCT	2	6	501218	501223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375572
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12550	NC_004463	CGGC	2	8	501331	501338	0 %	0 %	50 %	50 %	27375572
12551	NC_004463	GCC	2	6	501348	501353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375572
12552	NC_004463	GTC	2	6	501357	501362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375572
12553	NC_004463	GCC	2	6	501451	501456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12554	NC_004463	CG	3	6	501535	501540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12555	NC_004463	CGG	2	6	501655	501660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12556	NC_004463	CCAA	2	8	501686	501693	50 %	0 %	0 %	50 %	27375573
12557	NC_004463	GCC	2	6	501749	501754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375573
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12560	NC_004463	TGC	2	6	501801	501806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375573
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12571	NC_004463	GC	3	6	502425	502430	0 %	0 %	50 %	50 %	27375573
12572	NC_004463	TCA	2	6	502449	502454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375573
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12576	NC_004463	T	6	6	502546	502551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_004463	CGC	2	6	502641	502646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12578	NC_004463	CTC	2	6	502652	502657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12579	NC_004463	GCC	2	6	502697	502702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12580	NC_004463	CAG	2	6	502790	502795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375574
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12585	NC_004463	CGGCCG	2	12	502949	502960	0 %	0 %	50 %	50 %	27375574
12586	NC_004463	ATCT	2	8	502988	502995	25 %	50 %	0 %	25 %	27375574
12587	NC_004463	CCT	2	6	503001	503006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375574
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12593	NC_004463	GAT	2	6	503149	503154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375574
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12597	NC_004463	GAG	2	6	503367	503372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_004463	CGAT	2	8	503396	503403	25 %	25 %	25 %	25 %	27375575
12599	NC_004463	CAG	2	6	503407	503412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375575
12600	NC_004463	GC	3	6	503485	503490	0 %	0 %	50 %	50 %	27375575
12601	NC_004463	GCG	2	6	503536	503541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375575
12602	NC_004463	G	6	6	503689	503694	0 %	0 %	100 %	0 %	27375575
12603	NC_004463	CGC	3	9	503698	503706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375575
12604	NC_004463	GC	3	6	503705	503710	0 %	0 %	50 %	50 %	27375575
12605	NC_004463	GCTC	2	8	503712	503719	0 %	25 %	25 %	50 %	27375575
12606	NC_004463	TCC	2	6	503729	503734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375575
12607	NC_004463	CCT	2	6	503755	503760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12608	NC_004463	AC	3	6	503915	503920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12609	NC_004463	CGA	2	6	503941	503946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12610	NC_004463	CGC	2	6	503981	503986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12611	NC_004463	GCC	2	6	504004	504009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12612	NC_004463	TG	3	6	504028	504033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_004463	C	6	6	504076	504081	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12614	NC_004463	CG	3	6	504106	504111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12615	NC_004463	AGG	2	6	504115	504120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12616	NC_004463	T	6	6	504139	504144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_004463	TTC	2	6	504161	504166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12618	NC_004463	CG	3	6	504186	504191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12619	NC_004463	GC	3	6	504263	504268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12620	NC_004463	CT	3	6	504316	504321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12621	NC_004463	CG	3	6	504334	504339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12622	NC_004463	GCG	2	6	504394	504399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12623	NC_004463	GCA	2	6	504404	504409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12624	NC_004463	CCG	2	6	504414	504419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12625	NC_004463	CG	4	8	504418	504425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12626	NC_004463	GC	3	6	504432	504437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12627	NC_004463	GAG	2	6	504448	504453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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