MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 224297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_004463	CGC	2	6	461266	461271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375538
11502	NC_004463	GAT	2	6	461281	461286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375538
11503	NC_004463	CGCC	2	8	461316	461323	0 %	0 %	25 %	75 %	27375538
11504	NC_004463	CAG	2	6	461329	461334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375538
11505	NC_004463	CCT	2	6	461348	461353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375538
11506	NC_004463	GCG	2	6	461377	461382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375538
11507	NC_004463	GCC	2	6	461490	461495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11508	NC_004463	CTG	2	6	461513	461518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_004463	CCG	2	6	461553	461558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11510	NC_004463	AC	3	6	461598	461603	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11511	NC_004463	CCG	2	6	461630	461635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375539
11512	NC_004463	TCG	2	6	461638	461643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375539
11513	NC_004463	CTG	2	6	461661	461666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375539
11514	NC_004463	CGC	2	6	461705	461710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375539
11515	NC_004463	CGA	2	6	461717	461722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375539
11516	NC_004463	AGG	2	6	461740	461745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375539
11517	NC_004463	TCG	2	6	461758	461763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375539
11518	NC_004463	CG	3	6	461809	461814	0 %	0 %	50 %	50 %	27375539
11519	NC_004463	GGA	2	6	461828	461833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375539
11520	NC_004463	GCC	2	6	461841	461846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375539
11521	NC_004463	GC	3	6	461896	461901	0 %	0 %	50 %	50 %	27375539
11522	NC_004463	GAG	2	6	461946	461951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375539
11523	NC_004463	CGC	3	9	461952	461960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375539
11524	NC_004463	GC	3	6	461970	461975	0 %	0 %	50 %	50 %	27375539
11525	NC_004463	CCA	2	6	461977	461982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375539
11526	NC_004463	GC	3	6	462002	462007	0 %	0 %	50 %	50 %	27375539
11527	NC_004463	CCA	2	6	462040	462045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375539
11528	NC_004463	CGC	2	6	462077	462082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375539
11529	NC_004463	GC	3	6	462081	462086	0 %	0 %	50 %	50 %	27375539
11530	NC_004463	TGC	2	6	462118	462123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375539
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11533	NC_004463	CGT	2	6	462188	462193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375539
11534	NC_004463	CG	3	6	462250	462255	0 %	0 %	50 %	50 %	27375539
11535	NC_004463	GGC	2	6	462278	462283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375539
11536	NC_004463	CGG	2	6	462299	462304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375539
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11538	NC_004463	CTG	2	6	462501	462506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375539
11539	NC_004463	CCGG	2	8	462507	462514	0 %	0 %	50 %	50 %	27375539
11540	NC_004463	CGAG	2	8	462577	462584	25 %	0 %	50 %	25 %	27375539
11541	NC_004463	CGA	2	6	462614	462619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375539
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11543	NC_004463	TGATG	2	10	462650	462659	20 %	40 %	40 %	0 %	27375539
11544	NC_004463	CG	3	6	462681	462686	0 %	0 %	50 %	50 %	27375539
11545	NC_004463	GAT	2	6	462689	462694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375539
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11547	NC_004463	CG	3	6	462879	462884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11548	NC_004463	GCC	2	6	462977	462982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375540
11549	NC_004463	C	6	6	462981	462986	0 %	0 %	0 %	100 %	27375540
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11552	NC_004463	GCTGGC	2	12	463078	463089	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	27375540
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11555	NC_004463	GCA	2	6	463140	463145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375540
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11558	NC_004463	GCGCGT	2	12	463354	463365	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	27375540
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11563	NC_004463	CG	3	6	463569	463574	0 %	0 %	50 %	50 %	27375540
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11565	NC_004463	ATG	2	6	463592	463597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375540
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11587	NC_004463	TCG	2	6	464318	464323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375541
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11602	NC_004463	CT	3	6	464971	464976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11603	NC_004463	ATG	2	6	465002	465007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11610	NC_004463	GC	3	6	465565	465570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11611	NC_004463	CGA	2	6	465677	465682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375543
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11743	NC_004463	TCGA	2	8	470088	470095	25 %	25 %	25 %	25 %	27375546
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11989	NC_004463	GCCG	2	8	480161	480168	0 %	0 %	50 %	50 %	27375556
11990	NC_004463	CGG	2	6	480171	480176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375556
11991	NC_004463	GATC	2	8	480197	480204	25 %	25 %	25 %	25 %	27375556
11992	NC_004463	TCA	2	6	480248	480253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375556
11993	NC_004463	GAT	2	6	480257	480262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375556
11994	NC_004463	TGG	2	6	480268	480273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375556
11995	NC_004463	CGC	2	6	480290	480295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375556
11996	NC_004463	CCG	2	6	480353	480358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375556
11997	NC_004463	CG	4	8	480357	480364	0 %	0 %	50 %	50 %	27375556
11998	NC_004463	ACG	2	6	480397	480402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375556
11999	NC_004463	CGA	2	6	480440	480445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375556
12000	NC_004463	GAT	3	9	480456	480464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375556

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