MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 224297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_004463	TGC	2	6	441829	441834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375520
11002	NC_004463	GCC	2	6	441850	441855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375520
11003	NC_004463	GC	4	8	441868	441875	0 %	0 %	50 %	50 %	27375520
11004	NC_004463	CG	3	6	441884	441889	0 %	0 %	50 %	50 %	27375520
11005	NC_004463	GTC	2	6	441894	441899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375520
11006	NC_004463	CGC	3	9	441917	441925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375520
11007	NC_004463	CAT	2	6	441933	441938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375520
11008	NC_004463	GCC	2	6	442045	442050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375520
11009	NC_004463	CAG	2	6	442057	442062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375520
11010	NC_004463	GCG	2	6	442126	442131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375520
11011	NC_004463	TCG	2	6	442228	442233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375520
11012	NC_004463	TCG	2	6	442288	442293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375520
11013	NC_004463	GAT	2	6	442301	442306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375520
11014	NC_004463	CAGC	2	8	442314	442321	25 %	0 %	25 %	50 %	27375520
11015	NC_004463	CGT	2	6	442344	442349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375520
11016	NC_004463	GC	3	6	442397	442402	0 %	0 %	50 %	50 %	27375520
11017	NC_004463	CGAT	2	8	442484	442491	25 %	25 %	25 %	25 %	27375520
11018	NC_004463	CG	3	6	442571	442576	0 %	0 %	50 %	50 %	27375520
11019	NC_004463	GTC	2	6	442593	442598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375520
11020	NC_004463	GC	3	6	442626	442631	0 %	0 %	50 %	50 %	27375520
11021	NC_004463	GC	3	6	442644	442649	0 %	0 %	50 %	50 %	27375520
11022	NC_004463	GCG	2	6	442706	442711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375520
11023	NC_004463	CCA	2	6	442725	442730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375520
11024	NC_004463	CCG	2	6	442741	442746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375520
11025	NC_004463	GC	4	8	442761	442768	0 %	0 %	50 %	50 %	27375520
11026	NC_004463	GGGA	2	8	442769	442776	25 %	0 %	75 %	0 %	27375520
11027	NC_004463	CCG	2	6	442841	442846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375520
11028	NC_004463	GCG	2	6	442870	442875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375520
11029	NC_004463	CGG	2	6	442885	442890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375520
11030	NC_004463	GC	3	6	442905	442910	0 %	0 %	50 %	50 %	27375520
11031	NC_004463	CGA	3	9	442964	442972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375520
11032	NC_004463	CG	3	6	442982	442987	0 %	0 %	50 %	50 %	27375520
11033	NC_004463	CGC	2	6	443001	443006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375520
11034	NC_004463	CGG	2	6	443080	443085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375520
11035	NC_004463	CG	3	6	443096	443101	0 %	0 %	50 %	50 %	27375520
11036	NC_004463	GCAT	2	8	443102	443109	25 %	25 %	25 %	25 %	27375520
11037	NC_004463	AGAA	2	8	443140	443147	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_004463	TCA	2	6	443149	443154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_004463	GCA	2	6	443224	443229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375521
11040	NC_004463	CG	4	8	443240	443247	0 %	0 %	50 %	50 %	27375521
11041	NC_004463	CGG	2	6	443266	443271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375521
11042	NC_004463	CAG	2	6	443286	443291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375521
11043	NC_004463	GGC	2	6	443354	443359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375521
11044	NC_004463	CGA	2	6	443360	443365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375521
11045	NC_004463	CCG	2	6	443377	443382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375521
11046	NC_004463	GC	4	8	443439	443446	0 %	0 %	50 %	50 %	27375521
11047	NC_004463	CGCGT	2	10	443451	443460	0 %	20 %	40 %	40 %	27375521
11048	NC_004463	CGGC	2	8	443470	443477	0 %	0 %	50 %	50 %	27375521
11049	NC_004463	GCC	2	6	443478	443483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375521
11050	NC_004463	GCT	2	6	443489	443494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375521
11051	NC_004463	CGC	2	6	443558	443563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375521
11052	NC_004463	CGA	2	6	443564	443569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375521
11053	NC_004463	CGC	2	6	443702	443707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375521
11054	NC_004463	GCG	2	6	443708	443713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375521
11055	NC_004463	CG	3	6	443712	443717	0 %	0 %	50 %	50 %	27375521
11056	NC_004463	CGA	2	6	443746	443751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375521
11057	NC_004463	GCG	2	6	443759	443764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375521
11058	NC_004463	GATC	2	8	443786	443793	25 %	25 %	25 %	25 %	27375521
11059	NC_004463	GC	3	6	443803	443808	0 %	0 %	50 %	50 %	27375521
11060	NC_004463	GCCTCG	2	12	443878	443889	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	27375521
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11062	NC_004463	CGA	2	6	443902	443907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375521
11063	NC_004463	TGC	2	6	443908	443913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375521
11064	NC_004463	CCGG	2	8	443969	443976	0 %	0 %	50 %	50 %	27375521
11065	NC_004463	GCT	2	6	443981	443986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375521
11066	NC_004463	CGG	2	6	444013	444018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375521
11067	NC_004463	TGC	3	9	444103	444111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375522
11068	NC_004463	GCA	2	6	444116	444121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375522
11069	NC_004463	CAT	2	6	444192	444197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375522
11070	NC_004463	CG	4	8	444210	444217	0 %	0 %	50 %	50 %	27375522
11071	NC_004463	GAT	2	6	444228	444233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375522
11072	NC_004463	CGA	2	6	444272	444277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375522
11073	NC_004463	ACC	2	6	444349	444354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375522
11074	NC_004463	AGC	2	6	444385	444390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375522
11075	NC_004463	CGC	2	6	444393	444398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375522
11076	NC_004463	TCG	2	6	444412	444417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375522
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11078	NC_004463	GAA	2	6	444444	444449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375522
11079	NC_004463	GAC	2	6	444459	444464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375522
11080	NC_004463	ACG	2	6	444473	444478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375522
11081	NC_004463	GAT	2	6	444519	444524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375522
11082	NC_004463	TGA	2	6	444563	444568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375522
11083	NC_004463	GCT	2	6	444630	444635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375522
11084	NC_004463	GAA	2	6	444654	444659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375522
11085	NC_004463	TTC	2	6	444664	444669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375522
11086	NC_004463	CGG	2	6	444677	444682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375522
11087	NC_004463	TCAGGA	2	12	444779	444790	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	27375522
11088	NC_004463	CCAG	2	8	444848	444855	25 %	0 %	25 %	50 %	27375522
11089	NC_004463	GCCG	2	8	444860	444867	0 %	0 %	50 %	50 %	27375522
11090	NC_004463	GCCAG	2	10	444923	444932	20 %	0 %	40 %	40 %	27375522
11091	NC_004463	GC	4	8	444948	444955	0 %	0 %	50 %	50 %	27375522
11092	NC_004463	TGA	2	6	444976	444981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375523
11093	NC_004463	CGAG	2	8	444991	444998	25 %	0 %	50 %	25 %	27375523
11094	NC_004463	GGGC	2	8	445062	445069	0 %	0 %	75 %	25 %	27375523
11095	NC_004463	CCGG	2	8	445097	445104	0 %	0 %	50 %	50 %	27375523
11096	NC_004463	CG	3	6	445107	445112	0 %	0 %	50 %	50 %	27375523
11097	NC_004463	ATG	2	6	445122	445127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375523
11098	NC_004463	CTG	2	6	445181	445186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375523
11099	NC_004463	AGC	2	6	445206	445211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375523
11100	NC_004463	CGT	2	6	445213	445218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375523
11101	NC_004463	GC	3	6	445246	445251	0 %	0 %	50 %	50 %	27375523
11102	NC_004463	CAG	2	6	445268	445273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375523
11103	NC_004463	GCG	2	6	445308	445313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375523
11104	NC_004463	GCC	2	6	445325	445330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375523
11105	NC_004463	CAGG	2	8	445382	445389	25 %	0 %	50 %	25 %	27375523
11106	NC_004463	CGCC	2	8	445423	445430	0 %	0 %	25 %	75 %	27375523
11107	NC_004463	TGT	2	6	445450	445455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27375523
11108	NC_004463	CGC	2	6	445514	445519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375523
11109	NC_004463	ACA	2	6	445530	445535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375523
11110	NC_004463	GCCGGA	2	12	445610	445621	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	27375523
11111	NC_004463	CGA	2	6	445636	445641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375523
11112	NC_004463	CGC	2	6	445645	445650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375523
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11114	NC_004463	GCG	2	6	445765	445770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375523
11115	NC_004463	TGG	2	6	445827	445832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375524
11116	NC_004463	GAC	2	6	445834	445839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375524
11117	NC_004463	CTT	2	6	445942	445947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375524
11118	NC_004463	CG	3	6	445977	445982	0 %	0 %	50 %	50 %	27375524
11119	NC_004463	CG	3	6	446053	446058	0 %	0 %	50 %	50 %	27375524
11120	NC_004463	TCT	2	6	446085	446090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375524
11121	NC_004463	GCC	2	6	446146	446151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375524
11122	NC_004463	TCG	2	6	446174	446179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375524
11123	NC_004463	AAC	2	6	446189	446194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375524
11124	NC_004463	GC	3	6	446196	446201	0 %	0 %	50 %	50 %	27375524
11125	NC_004463	TCGA	2	8	446213	446220	25 %	25 %	25 %	25 %	27375524
11126	NC_004463	TGA	2	6	446244	446249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375524
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11139	NC_004463	GCCGAT	2	12	446575	446586	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	27375524
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11142	NC_004463	GGCC	2	8	446658	446665	0 %	0 %	50 %	50 %	27375524
11143	NC_004463	GAA	2	6	446671	446676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375524
11144	NC_004463	CGA	2	6	446691	446696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375524
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11146	NC_004463	CCG	2	6	446769	446774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375524
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11153	NC_004463	CGG	2	6	447144	447149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375525
11154	NC_004463	CGAG	2	8	447152	447159	25 %	0 %	50 %	25 %	27375525
11155	NC_004463	GCA	2	6	447167	447172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375525
11156	NC_004463	CGAG	2	8	447176	447183	25 %	0 %	50 %	25 %	27375525
11157	NC_004463	CGC	2	6	447195	447200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375525
11158	NC_004463	GA	3	6	447208	447213	50 %	0 %	50 %	0 %	27375525
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11161	NC_004463	CTGG	2	8	447459	447466	0 %	25 %	50 %	25 %	27375525
11162	NC_004463	CG	3	6	447524	447529	0 %	0 %	50 %	50 %	27375525
11163	NC_004463	GAT	3	9	447564	447572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375525
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11165	NC_004463	CGA	2	6	447635	447640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375525
11166	NC_004463	TGC	2	6	447671	447676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375525
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11174	NC_004463	CGC	2	6	448053	448058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375526
11175	NC_004463	TCG	2	6	448074	448079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375526
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11178	NC_004463	GAT	2	6	448226	448231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375526
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11181	NC_004463	GAT	2	6	448307	448312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375526
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11186	NC_004463	GAGC	2	8	448466	448473	25 %	0 %	50 %	25 %	27375526
11187	NC_004463	CGGA	2	8	448500	448507	25 %	0 %	50 %	25 %	27375526
11188	NC_004463	TGA	3	9	448531	448539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375526
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11190	NC_004463	GCCG	2	8	448708	448715	0 %	0 %	50 %	50 %	27375527
11191	NC_004463	GGC	2	6	448755	448760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375527
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11194	NC_004463	GC	3	6	448944	448949	0 %	0 %	50 %	50 %	27375527
11195	NC_004463	GC	3	6	449017	449022	0 %	0 %	50 %	50 %	27375527
11196	NC_004463	CGC	2	6	449062	449067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375527
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11198	NC_004463	GAT	2	6	449159	449164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375527
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11200	NC_004463	GTCGCT	2	12	449204	449215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375527
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11204	NC_004463	GCC	2	6	449365	449370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375527
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11210	NC_004463	CGC	2	6	449632	449637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375527
11211	NC_004463	TGCCC	2	10	449695	449704	0 %	20 %	20 %	60 %	27375527
11212	NC_004463	CGC	2	6	449759	449764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375527
11213	NC_004463	CAG	2	6	449765	449770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375527
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11215	NC_004463	GCC	2	6	449900	449905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375527
11216	NC_004463	GCA	2	6	449914	449919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375527
11217	NC_004463	CAG	2	6	449993	449998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375527
11218	NC_004463	TCC	2	6	450026	450031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375527
11219	NC_004463	GCC	2	6	450059	450064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375527
11220	NC_004463	CCGA	2	8	450072	450079	25 %	0 %	25 %	50 %	27375527
11221	NC_004463	CGGC	2	8	450151	450158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11222	NC_004463	CTG	2	6	450192	450197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375528
11223	NC_004463	GAC	2	6	450200	450205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375528
11224	NC_004463	GCT	2	6	450224	450229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375528
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11227	NC_004463	CCA	2	6	450268	450273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375528
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11229	NC_004463	TCGCG	2	10	450327	450336	0 %	20 %	40 %	40 %	27375528
11230	NC_004463	CGACCC	2	12	450409	450420	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	27375528
11231	NC_004463	GCT	2	6	450458	450463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375528
11232	NC_004463	TGC	2	6	450486	450491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375528
11233	NC_004463	GCC	3	9	450501	450509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375528
11234	NC_004463	AC	3	6	450513	450518	50 %	0 %	0 %	50 %	27375528
11235	NC_004463	TCGA	2	8	450525	450532	25 %	25 %	25 %	25 %	27375528
11236	NC_004463	GCT	2	6	450587	450592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375528
11237	NC_004463	CG	3	6	450613	450618	0 %	0 %	50 %	50 %	27375528
11238	NC_004463	CAG	2	6	450653	450658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375528
11239	NC_004463	GCC	2	6	450683	450688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375528
11240	NC_004463	CG	3	6	450722	450727	0 %	0 %	50 %	50 %	27375528
11241	NC_004463	TCC	2	6	450747	450752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375528
11242	NC_004463	TCG	2	6	450801	450806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375528
11243	NC_004463	TTG	2	6	450831	450836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27375528
11244	NC_004463	GCCG	2	8	450944	450951	0 %	0 %	50 %	50 %	27375528
11245	NC_004463	GCA	2	6	450982	450987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375528
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11252	NC_004463	CCG	2	6	451195	451200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11253	NC_004463	GCT	2	6	451245	451250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11489	NC_004463	GCA	2	6	460973	460978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375538
11490	NC_004463	ACG	2	6	460997	461002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375538
11491	NC_004463	CAG	2	6	461020	461025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375538
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