MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A plasmid pDOJH10S

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004253	AGC	2	6	23	28	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_004253	ACGA	2	8	55	62	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_004253	CGA	2	6	168	173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_004253	CG	3	6	184	189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_004253	TGC	2	6	215	220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_004253	GCC	2	6	277	282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_004253	CG	3	6	303	308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_004253	CGG	2	6	332	337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_004253	TGA	2	6	389	394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004253	GGA	2	6	477	482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004253	GCC	2	6	495	500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_004253	GC	3	6	571	576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_004253	CCA	2	6	600	605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_004253	TCA	2	6	788	793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_004253	CGAG	2	8	857	864	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_004253	AAG	2	6	897	902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004253	CG	3	6	914	919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_004253	CAT	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_004253	GCA	2	6	969	974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_004253	GATTG	2	10	987	996	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004253	GGC	2	6	1004	1009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_004253	GAT	3	9	1038	1046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004253	GCC	2	6	1134	1139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_004253	AGGCCG	2	12	1269	1280	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	23307866
25	NC_004253	GCC	2	6	1292	1297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307866
26	NC_004253	CTG	2	6	1367	1372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307866
27	NC_004253	CCT	2	6	1399	1404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23307866
28	NC_004253	GCG	2	6	1413	1418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307866
29	NC_004253	GCT	3	9	1438	1446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307866
30	NC_004253	GACGG	2	10	1469	1478	20 %	0 %	60 %	20 %	23307866
31	NC_004253	CG	3	6	1507	1512	0 %	0 %	50 %	50 %	23307866
32	NC_004253	GGGC	2	8	1546	1553	0 %	0 %	75 %	25 %	23307866
33	NC_004253	GGC	2	6	1580	1585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307866
34	NC_004253	GGC	2	6	1622	1627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307866
35	NC_004253	TCCC	2	8	1652	1659	0 %	25 %	0 %	75 %	23307866
36	NC_004253	GGGA	2	8	1669	1676	25 %	0 %	75 %	0 %	23307866
37	NC_004253	GCC	2	6	1680	1685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307866
38	NC_004253	GACGG	2	10	1718	1727	20 %	0 %	60 %	20 %	23307866
39	NC_004253	GTCCCG	2	12	1769	1780	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	23307866
40	NC_004253	CGG	2	6	1881	1886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307866
41	NC_004253	GC	4	8	1900	1907	0 %	0 %	50 %	50 %	23307866
42	NC_004253	GTC	2	6	1910	1915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307866
43	NC_004253	TGG	2	6	2035	2040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23307866
44	NC_004253	GGT	2	6	2074	2079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23307866
45	NC_004253	GCA	2	6	2098	2103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307866
46	NC_004253	CAG	2	6	2141	2146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307866
47	NC_004253	TCT	2	6	2287	2292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23307866
48	NC_004253	CGA	2	6	2341	2346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307866
49	NC_004253	TCC	2	6	2365	2370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23307866
50	NC_004253	CGC	2	6	2399	2404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307866
51	NC_004253	CGG	2	6	2413	2418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307866
52	NC_004253	CG	3	6	2476	2481	0 %	0 %	50 %	50 %	23307866
53	NC_004253	CCA	2	6	2488	2493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23307866
54	NC_004253	TCT	2	6	2497	2502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23307866
55	NC_004253	CCG	2	6	2527	2532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307866
56	NC_004253	GCG	2	6	2538	2543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307866
57	NC_004253	GC	3	6	2578	2583	0 %	0 %	50 %	50 %	23307866
58	NC_004253	CGT	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307866
59	NC_004253	CCT	2	6	2749	2754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_004253	GGCC	2	8	2786	2793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_004253	CCG	2	6	2809	2814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_004253	ACG	2	6	3010	3015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_004253	TCC	2	6	3027	3032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_004253	GAT	2	6	3075	3080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004253	GGA	2	6	3091	3096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004253	GCA	2	6	3120	3125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307867
67	NC_004253	GAC	2	6	3133	3138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307867
68	NC_004253	CGG	2	6	3261	3266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307867
69	NC_004253	ACG	3	9	3272	3280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307867
70	NC_004253	CAT	2	6	3315	3320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23307867
71	NC_004253	CGG	2	6	3342	3347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307867
72	NC_004253	GCG	2	6	3430	3435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307867
73	NC_004253	CAC	2	6	3461	3466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23307867
74	NC_004253	AGCC	2	8	3467	3474	25 %	0 %	25 %	50 %	23307867
75	NC_004253	CAG	2	6	3535	3540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307867
76	NC_004253	ATC	2	6	3644	3649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.