MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 113957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_002929	GAGC	2	8	1119178	1119185	25 %	0 %	50 %	25 %	33592212
31003	NC_002929	CGG	2	6	1119249	1119254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33592212
31004	NC_002929	CAG	2	6	1119256	1119261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33592212
31005	NC_002929	GCG	2	6	1119325	1119330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33592212
31006	NC_002929	GCC	2	6	1119333	1119338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33592212
31007	NC_002929	GCA	2	6	1119351	1119356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33592212
31008	NC_002929	GCGT	2	8	1119371	1119378	0 %	25 %	50 %	25 %	33592212
31009	NC_002929	GC	3	6	1119408	1119413	0 %	0 %	50 %	50 %	33592212
31010	NC_002929	TCC	2	6	1119419	1119424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33592212
31011	NC_002929	GC	3	6	1119427	1119432	0 %	0 %	50 %	50 %	33592212
31012	NC_002929	GC	3	6	1119463	1119468	0 %	0 %	50 %	50 %	33592212
31013	NC_002929	CCA	3	9	1119477	1119485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33592212
31014	NC_002929	CGC	3	9	1119508	1119516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33592212
31015	NC_002929	CAG	2	6	1119517	1119522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33592212
31016	NC_002929	CGG	2	6	1119600	1119605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33592212
31017	NC_002929	GCA	2	6	1119648	1119653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33592212
31018	NC_002929	CGG	2	6	1119672	1119677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33592212
31019	NC_002929	CGGC	2	8	1119687	1119694	0 %	0 %	50 %	50 %	33592212
31020	NC_002929	CAG	2	6	1119748	1119753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33592212
31021	NC_002929	CCGG	2	8	1119756	1119763	0 %	0 %	50 %	50 %	33592212
31022	NC_002929	CGGG	2	8	1119873	1119880	0 %	0 %	75 %	25 %	33592212
31023	NC_002929	TCG	2	6	1119974	1119979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592212
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31027	NC_002929	GC	4	8	1120140	1120147	0 %	0 %	50 %	50 %	33592212
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31029	NC_002929	GGC	2	6	1120176	1120181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33592212
31030	NC_002929	TTG	2	6	1120226	1120231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33592212
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31032	NC_002929	CAG	2	6	1120276	1120281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33592212
31033	NC_002929	CG	3	6	1120308	1120313	0 %	0 %	50 %	50 %	33592212
31034	NC_002929	CTG	3	9	1120321	1120329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592212
31035	NC_002929	GCA	2	6	1120353	1120358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33592212
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31041	NC_002929	CAG	2	6	1120645	1120650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33592212
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31044	NC_002929	CG	3	6	1120771	1120776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31045	NC_002929	CGC	2	6	1120866	1120871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31046	NC_002929	ACTG	2	8	1120912	1120919	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31047	NC_002929	TCT	2	6	1120945	1120950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33592213
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31052	NC_002929	GC	4	8	1121111	1121118	0 %	0 %	50 %	50 %	33592213
31053	NC_002929	GC	3	6	1121176	1121181	0 %	0 %	50 %	50 %	33592213
31054	NC_002929	CCA	2	6	1121187	1121192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33592213
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31063	NC_002929	CCA	2	6	1121479	1121484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33592213
31064	NC_002929	GCGCG	2	10	1121507	1121516	0 %	0 %	60 %	40 %	33592213
31065	NC_002929	GGAA	2	8	1121556	1121563	50 %	0 %	50 %	0 %	33592213
31066	NC_002929	TCG	2	6	1121573	1121578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592213
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31075	NC_002929	CTG	2	6	1121840	1121845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592213
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31083	NC_002929	GCTGG	2	10	1122013	1122022	0 %	20 %	60 %	20 %	33592213
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31089	NC_002929	CCGCTG	2	12	1122275	1122286	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	33592213
31090	NC_002929	CATC	2	8	1122306	1122313	25 %	25 %	0 %	50 %	33592213
31091	NC_002929	GTG	2	6	1122314	1122319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33592213
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31093	NC_002929	GC	3	6	1122370	1122375	0 %	0 %	50 %	50 %	33592213
31094	NC_002929	AGGTC	2	10	1122557	1122566	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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31098	NC_002929	GGC	2	6	1122693	1122698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33592214
31099	NC_002929	CAG	2	6	1122727	1122732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33592214
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31101	NC_002929	CGC	2	6	1122777	1122782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33592214
31102	NC_002929	GCG	2	6	1122819	1122824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33592214
31103	NC_002929	CG	3	6	1122828	1122833	0 %	0 %	50 %	50 %	33592214
31104	NC_002929	CG	3	6	1122885	1122890	0 %	0 %	50 %	50 %	33592214
31105	NC_002929	GGCG	2	8	1122912	1122919	0 %	0 %	75 %	25 %	33592214
31106	NC_002929	CGG	3	9	1122936	1122944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33592214
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31109	NC_002929	GCG	2	6	1123003	1123008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33592214
31110	NC_002929	CAG	2	6	1123033	1123038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33592214
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31112	NC_002929	GCGT	2	8	1123067	1123074	0 %	25 %	50 %	25 %	33592214
31113	NC_002929	CCA	2	6	1123092	1123097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33592214
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31116	NC_002929	GCC	2	6	1123153	1123158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33592214
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31118	NC_002929	CAC	2	6	1123201	1123206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33592214
31119	NC_002929	CAC	2	6	1123244	1123249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33592214
31120	NC_002929	CGT	2	6	1123320	1123325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592214
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31123	NC_002929	GCGCG	2	10	1123387	1123396	0 %	0 %	60 %	40 %	33592214
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31126	NC_002929	CGC	2	6	1123541	1123546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31127	NC_002929	CAA	2	6	1123625	1123630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31131	NC_002929	TCCAG	2	10	1123855	1123864	20 %	20 %	20 %	40 %	33592215
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31230	NC_002929	TCG	2	6	1127297	1127302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592217
31231	NC_002929	TGGT	2	8	1127330	1127337	0 %	50 %	50 %	0 %	33592217
31232	NC_002929	TCG	2	6	1127342	1127347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592217
31233	NC_002929	GC	5	10	1127353	1127362	0 %	0 %	50 %	50 %	33592217
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