MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 113957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25003	NC_002929	CGT	2	6	904920	904925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592035
25004	NC_002929	TGACGC	2	12	904935	904946	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33592035
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25123	NC_002929	CAT	2	6	909710	909715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33592038
25124	NC_002929	TCAGCG	2	12	909718	909729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33592038
25125	NC_002929	GAT	2	6	909731	909736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33592038
25126	NC_002929	GCA	2	6	909757	909762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33592038
25127	NC_002929	CAG	2	6	909788	909793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33592038
25128	NC_002929	GCG	2	6	909810	909815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33592038
25129	NC_002929	GC	3	6	909818	909823	0 %	0 %	50 %	50 %	33592038
25130	NC_002929	CGG	2	6	909832	909837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33592038
25131	NC_002929	GC	3	6	909838	909843	0 %	0 %	50 %	50 %	33592038
25132	NC_002929	GCCG	2	8	909865	909872	0 %	0 %	50 %	50 %	33592038
25133	NC_002929	AGC	2	6	909909	909914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33592038
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25135	NC_002929	GCCA	2	8	910080	910087	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25136	NC_002929	GCC	2	6	910094	910099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25137	NC_002929	G	6	6	910103	910108	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25138	NC_002929	CGGCG	2	10	910180	910189	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25139	NC_002929	CG	3	6	910196	910201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25140	NC_002929	GTGA	2	8	910240	910247	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25141	NC_002929	AGC	2	6	910296	910301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25142	NC_002929	CG	3	6	910312	910317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25143	NC_002929	CGC	3	9	910325	910333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25144	NC_002929	GCCGG	2	10	910365	910374	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25145	NC_002929	GC	3	6	910375	910380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25146	NC_002929	GGA	2	6	910414	910419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25147	NC_002929	CTGG	2	8	910440	910447	0 %	25 %	50 %	25 %	33592039
25148	NC_002929	CGC	2	6	910493	910498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33592039
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25151	NC_002929	TGGC	2	8	910585	910592	0 %	25 %	50 %	25 %	33592039
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25164	NC_002929	GCG	2	6	911088	911093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25165	NC_002929	TGC	2	6	911095	911100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25167	NC_002929	TTGC	2	8	911200	911207	0 %	50 %	25 %	25 %	33592040
25168	NC_002929	GCT	2	6	911214	911219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592040
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25175	NC_002929	GCG	2	6	911358	911363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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25177	NC_002929	AGG	2	6	911423	911428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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25180	NC_002929	GCCCG	2	10	911511	911520	0 %	0 %	40 %	60 %	33592041
25181	NC_002929	CAG	2	6	911547	911552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33592041
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25185	NC_002929	TGC	2	6	911618	911623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592042
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25204	NC_002929	C	6	6	912360	912365	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25205	NC_002929	CG	3	6	912379	912384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25206	NC_002929	ATA	2	6	912472	912477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25216	NC_002929	CGGC	2	8	912875	912882	0 %	0 %	50 %	50 %	33592043
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25224	NC_002929	CGC	2	6	913294	913299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25225	NC_002929	CAG	2	6	913363	913368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33592044
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25227	NC_002929	CCAG	2	8	913419	913426	25 %	0 %	25 %	50 %	33592044
25228	NC_002929	GTG	2	6	913460	913465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33592044
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25230	NC_002929	ACC	2	6	913502	913507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33592044
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25232	NC_002929	CG	3	6	913578	913583	0 %	0 %	50 %	50 %	33592044
25233	NC_002929	TGC	2	6	913626	913631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592044
25234	NC_002929	CGT	2	6	913671	913676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592044
25235	NC_002929	GAGC	2	8	913678	913685	25 %	0 %	50 %	25 %	33592044
25236	NC_002929	CTGG	2	8	913753	913760	0 %	25 %	50 %	25 %	33592044
25237	NC_002929	GAC	2	6	913763	913768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33592044
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25240	NC_002929	GGT	2	6	913954	913959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33592044
25241	NC_002929	CG	3	6	913965	913970	0 %	0 %	50 %	50 %	33592044
25242	NC_002929	GCGCCG	2	12	914067	914078	0 %	0 %	50 %	50 %	33592044
25243	NC_002929	GCCG	2	8	914098	914105	0 %	0 %	50 %	50 %	33592044
25244	NC_002929	GCC	2	6	914114	914119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33592044
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25381	NC_002929	CGA	2	6	918905	918910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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