MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 113957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24124	NC_002929	TAC	2	6	871289	871294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33592008
24125	NC_002929	ACT	2	6	871296	871301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33592008
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24127	NC_002929	CTG	2	6	871394	871399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592008
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24244	NC_002929	GTG	2	6	876050	876055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33592013
24245	NC_002929	GCGACC	2	12	876093	876104	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33592013
24246	NC_002929	CGA	2	6	876130	876135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33592013
24247	NC_002929	CG	3	6	876228	876233	0 %	0 %	50 %	50 %	33592013
24248	NC_002929	GC	3	6	876264	876269	0 %	0 %	50 %	50 %	33592013
24249	NC_002929	CCA	2	6	876285	876290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33592013
24250	NC_002929	CTG	2	6	876305	876310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592013
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24253	NC_002929	GCG	2	6	876393	876398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33592013
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24260	NC_002929	TGGCGC	2	12	876633	876644	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33592013
24261	NC_002929	GCCG	2	8	876664	876671	0 %	0 %	50 %	50 %	33592013
24262	NC_002929	CGC	2	6	876676	876681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33592013
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24273	NC_002929	GGC	2	6	876902	876907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33592013
24274	NC_002929	GCC	3	9	876914	876922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33592013
24275	NC_002929	TGC	2	6	876954	876959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592013
24276	NC_002929	CGC	2	6	876990	876995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33592013
24277	NC_002929	GCGCG	2	10	877012	877021	0 %	0 %	60 %	40 %	33592013
24278	NC_002929	CGG	2	6	877053	877058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33592013
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24280	NC_002929	TGC	2	6	877197	877202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592013
24281	NC_002929	TGC	2	6	877218	877223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592013
24282	NC_002929	CGTG	2	8	877258	877265	0 %	25 %	50 %	25 %	33592013
24283	NC_002929	GGCG	2	8	877276	877283	0 %	0 %	75 %	25 %	33592013
24284	NC_002929	GC	3	6	877292	877297	0 %	0 %	50 %	50 %	33592013
24285	NC_002929	CTGGGC	2	12	877322	877333	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33592013
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24287	NC_002929	GC	3	6	877445	877450	0 %	0 %	50 %	50 %	33592013
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24296	NC_002929	TGG	2	6	877709	877714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33592014
24297	NC_002929	TCG	2	6	877733	877738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592014
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24300	NC_002929	CTG	2	6	877849	877854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592014
24301	NC_002929	GCT	2	6	877878	877883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592014
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24309	NC_002929	CTG	2	6	878026	878031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592014
24310	NC_002929	CAT	2	6	878034	878039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33592014
24311	NC_002929	GC	3	6	878114	878119	0 %	0 %	50 %	50 %	33592014
24312	NC_002929	GC	3	6	878121	878126	0 %	0 %	50 %	50 %	33592014
24313	NC_002929	TGC	2	6	878180	878185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592014
24314	NC_002929	TCCTG	2	10	878264	878273	0 %	40 %	20 %	40 %	33592014
24315	NC_002929	TCA	2	6	878300	878305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33592014
24316	NC_002929	AACC	2	8	878331	878338	50 %	0 %	0 %	50 %	33592014
24317	NC_002929	GGCC	2	8	878379	878386	0 %	0 %	50 %	50 %	33592014
24318	NC_002929	TTC	2	6	878422	878427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33592014
24319	NC_002929	CTG	2	6	878452	878457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592014
24320	NC_002929	GGC	2	6	878485	878490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33592014
24321	NC_002929	CGC	2	6	878513	878518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33592014
24322	NC_002929	CTGG	2	8	878541	878548	0 %	25 %	50 %	25 %	33592014
24323	NC_002929	CG	3	6	878590	878595	0 %	0 %	50 %	50 %	33592014
24324	NC_002929	CGCTAC	2	12	878605	878616	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	33592014
24325	NC_002929	GTC	2	6	878674	878679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592014
24326	NC_002929	AGGCTG	2	12	878728	878739	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24327	NC_002929	T	6	6	878760	878765	0 %	100 %	0 %	0 %	33592015
24328	NC_002929	CTG	3	9	878773	878781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592015
24329	NC_002929	GTT	2	6	878787	878792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33592015
24330	NC_002929	T	6	6	878820	878825	0 %	100 %	0 %	0 %	33592015
24331	NC_002929	TGCGC	2	10	878895	878904	0 %	20 %	40 %	40 %	33592015
24332	NC_002929	GAG	2	6	878920	878925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33592015
24333	NC_002929	AGC	2	6	878990	878995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33592015
24334	NC_002929	CGA	2	6	878997	879002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33592015
24335	NC_002929	CCG	2	6	879009	879014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33592015
24336	NC_002929	AG	3	6	879069	879074	50 %	0 %	50 %	0 %	33592015
24337	NC_002929	GCG	2	6	879131	879136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33592015
24338	NC_002929	TGC	2	6	879158	879163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592015
24339	NC_002929	CGCC	2	8	879195	879202	0 %	0 %	25 %	75 %	33592015
24340	NC_002929	TAC	2	6	879257	879262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33592016
24341	NC_002929	CGC	2	6	879299	879304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33592016
24342	NC_002929	GC	3	6	879321	879326	0 %	0 %	50 %	50 %	33592016
24343	NC_002929	CCG	2	6	879337	879342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33592016
24344	NC_002929	CGC	2	6	879371	879376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33592016
24345	NC_002929	TGC	2	6	879388	879393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592016
24346	NC_002929	TGCTGG	2	12	879418	879429	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	33592016
24347	NC_002929	CTGTTC	2	12	879453	879464	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	33592016
24348	NC_002929	TGA	2	6	879469	879474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33592016
24349	NC_002929	GTG	2	6	879546	879551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33592016
24350	NC_002929	ACA	2	6	879628	879633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33592016
24351	NC_002929	CG	3	6	879639	879644	0 %	0 %	50 %	50 %	33592016
24352	NC_002929	GCG	2	6	879693	879698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33592016
24353	NC_002929	CTG	3	9	879699	879707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592016
24354	NC_002929	TGG	2	6	879715	879720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33592016
24355	NC_002929	GCC	2	6	879742	879747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33592016
24356	NC_002929	CGC	2	6	879776	879781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33592016
24357	NC_002929	CGTGCG	2	12	879782	879793	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33592016
24358	NC_002929	CG	3	6	879792	879797	0 %	0 %	50 %	50 %	33592016
24359	NC_002929	AAC	2	6	879886	879891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33592016
24360	NC_002929	TGACGC	2	12	879894	879905	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33592016
24361	NC_002929	CCG	2	6	879970	879975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33592017
24362	NC_002929	CTG	2	6	879989	879994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592017
24363	NC_002929	GTGTTC	2	12	880076	880087	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	33592017
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24365	NC_002929	GCC	2	6	880115	880120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33592017
24366	NC_002929	CTG	2	6	880142	880147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592017
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24485	NC_002929	GGC	2	6	884553	884558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33592020
24486	NC_002929	TGC	2	6	884684	884689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592020
24487	NC_002929	CGG	2	6	884729	884734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33592020
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24489	NC_002929	CTG	3	9	884809	884817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33592020
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