MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 113957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18004	NC_002929	CG	3	6	645711	645716	0 %	0 %	50 %	50 %	33591831
18005	NC_002929	CG	3	6	645740	645745	0 %	0 %	50 %	50 %	33591831
18006	NC_002929	CGGC	2	8	645762	645769	0 %	0 %	50 %	50 %	33591831
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18018	NC_002929	TGA	2	6	646151	646156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591832
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18124	NC_002929	GGC	2	6	649859	649864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591836
18125	NC_002929	GCG	2	6	649865	649870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591836
18126	NC_002929	CGG	2	6	649984	649989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591836
18127	NC_002929	CGC	3	9	650032	650040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591836
18128	NC_002929	CGG	2	6	650059	650064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591836
18129	NC_002929	TGC	2	6	650065	650070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591836
18130	NC_002929	GCCC	2	8	650086	650093	0 %	0 %	25 %	75 %	33591836
18131	NC_002929	CCG	2	6	650095	650100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591836
18132	NC_002929	ACGCC	2	10	650101	650110	20 %	0 %	20 %	60 %	33591836
18133	NC_002929	GGCGC	2	10	650114	650123	0 %	0 %	60 %	40 %	33591836
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18137	NC_002929	CCA	2	6	650275	650280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591837
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18139	NC_002929	CGAC	2	8	650356	650363	25 %	0 %	25 %	50 %	33591837
18140	NC_002929	CCA	2	6	650419	650424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591837
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18143	NC_002929	GCG	2	6	650602	650607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591837
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18149	NC_002929	GC	3	6	650810	650815	0 %	0 %	50 %	50 %	33591837
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18156	NC_002929	GCC	2	6	651122	651127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18157	NC_002929	AAT	2	6	651143	651148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18158	NC_002929	CCG	2	6	651160	651165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18159	NC_002929	CG	3	6	651164	651169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18160	NC_002929	AGCC	2	8	651213	651220	25 %	0 %	25 %	50 %	33591838
18161	NC_002929	GC	4	8	651224	651231	0 %	0 %	50 %	50 %	33591838
18162	NC_002929	CGA	2	6	651234	651239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591838
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18187	NC_002929	CG	3	6	652119	652124	0 %	0 %	50 %	50 %	33591838
18188	NC_002929	GCC	2	6	652147	652152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591838
18189	NC_002929	C	7	7	652223	652229	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18190	NC_002929	CCGG	2	8	652246	652253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18205	NC_002929	CCGG	2	8	653295	653302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18230	NC_002929	CCG	2	6	654692	654697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18231	NC_002929	GCG	2	6	654699	654704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18232	NC_002929	CGG	2	6	654848	654853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18233	NC_002929	TGGT	2	8	654904	654911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18234	NC_002929	CGC	2	6	655022	655027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18235	NC_002929	CGG	2	6	655091	655096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18236	NC_002929	CGC	2	6	655103	655108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18237	NC_002929	GGC	2	6	655113	655118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18238	NC_002929	TCG	2	6	655210	655215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18239	NC_002929	GAT	2	6	655281	655286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18240	NC_002929	GC	3	6	655295	655300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18241	NC_002929	CCGCG	2	10	655351	655360	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18242	NC_002929	GC	4	8	655438	655445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18243	NC_002929	TTCCTC	2	12	655597	655608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18244	NC_002929	ATGC	2	8	655642	655649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18245	NC_002929	GGCAC	2	10	655670	655679	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18246	NC_002929	GGTC	2	8	655692	655699	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18247	NC_002929	TGC	2	6	655712	655717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18248	NC_002929	CATGGG	2	12	655755	655766	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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18464	NC_002929	G	7	7	663477	663483	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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18493	NC_002929	CAG	2	6	664940	664945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591849
18494	NC_002929	CGG	2	6	664963	664968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591849
18495	NC_002929	CGG	2	6	665002	665007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591849
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18497	NC_002929	CGA	2	6	665050	665055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591849
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