MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 113957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16122	NC_002929	GCT	2	6	580697	580702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591776
16123	NC_002929	GC	4	8	580717	580724	0 %	0 %	50 %	50 %	33591776
16124	NC_002929	CCA	2	6	580810	580815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591776
16125	NC_002929	GAGC	2	8	580817	580824	25 %	0 %	50 %	25 %	33591776
16126	NC_002929	TGC	2	6	580825	580830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591776
16127	NC_002929	GCG	2	6	580838	580843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591776
16128	NC_002929	GTG	2	6	580851	580856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591776
16129	NC_002929	GGT	2	6	580931	580936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591776
16130	NC_002929	CG	3	6	580941	580946	0 %	0 %	50 %	50 %	33591776
16131	NC_002929	CGA	2	6	581000	581005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591776
16132	NC_002929	ATC	2	6	581007	581012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591776
16133	NC_002929	GAC	2	6	581043	581048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591776
16134	NC_002929	CG	3	6	581086	581091	0 %	0 %	50 %	50 %	33591776
16135	NC_002929	CCT	2	6	581116	581121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33591776
16136	NC_002929	TGG	2	6	581221	581226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591777
16137	NC_002929	CTG	2	6	581310	581315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591777
16138	NC_002929	CTGG	2	8	581339	581346	0 %	25 %	50 %	25 %	33591777
16139	NC_002929	CGC	2	6	581352	581357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591777
16140	NC_002929	CG	4	8	581375	581382	0 %	0 %	50 %	50 %	33591777
16141	NC_002929	CTG	2	6	581391	581396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591777
16142	NC_002929	GGC	2	6	581429	581434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591777
16143	NC_002929	GCT	3	9	581441	581449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591777
16144	NC_002929	CTA	2	6	581450	581455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591777
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16147	NC_002929	GC	3	6	581579	581584	0 %	0 %	50 %	50 %	33591777
16148	NC_002929	CGG	2	6	581600	581605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591777
16149	NC_002929	TGGGCG	2	12	581647	581658	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	33591777
16150	NC_002929	GGT	2	6	581666	581671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591777
16151	NC_002929	CGC	2	6	581713	581718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591777
16152	NC_002929	CTG	2	6	581778	581783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591777
16153	NC_002929	G	7	7	581849	581855	0 %	0 %	100 %	0 %	33591777
16154	NC_002929	GTCG	2	8	581897	581904	0 %	25 %	50 %	25 %	33591777
16155	NC_002929	TGG	2	6	581908	581913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591777
16156	NC_002929	CCAC	2	8	581950	581957	25 %	0 %	0 %	75 %	33591777
16157	NC_002929	GC	3	6	581984	581989	0 %	0 %	50 %	50 %	33591777
16158	NC_002929	GTG	2	6	581994	581999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591777
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16160	NC_002929	CGC	2	6	582187	582192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591777
16161	NC_002929	TGCTGT	2	12	582199	582210	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	33591777
16162	NC_002929	CGGC	2	8	582226	582233	0 %	0 %	50 %	50 %	33591777
16163	NC_002929	CGG	3	9	582239	582247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591777
16164	NC_002929	GAT	2	6	582254	582259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591777
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16166	NC_002929	CTG	2	6	582270	582275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591777
16167	NC_002929	GC	3	6	582285	582290	0 %	0 %	50 %	50 %	33591777
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16170	NC_002929	TGG	2	6	582352	582357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591777
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16175	NC_002929	GGTGCT	2	12	582608	582619	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	33591777
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16178	NC_002929	CG	4	8	582651	582658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16179	NC_002929	CG	3	6	582668	582673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16180	NC_002929	GTG	2	6	582674	582679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16181	NC_002929	TC	3	6	582719	582724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16182	NC_002929	CAAG	2	8	582741	582748	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16183	NC_002929	AAG	2	6	582757	582762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16184	NC_002929	TCC	2	6	582772	582777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16185	NC_002929	GCG	2	6	582843	582848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591778
16186	NC_002929	CTGG	2	8	582948	582955	0 %	25 %	50 %	25 %	33591778
16187	NC_002929	CAC	3	9	582993	583001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591778
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16193	NC_002929	GCT	2	6	583152	583157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591778
16194	NC_002929	GCT	2	6	583197	583202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591778
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16199	NC_002929	CGG	2	6	583351	583356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591779
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16201	NC_002929	TCG	2	6	583434	583439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591779
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16205	NC_002929	CG	4	8	583514	583521	0 %	0 %	50 %	50 %	33591779
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16220	NC_002929	CG	3	6	583936	583941	0 %	0 %	50 %	50 %	33591779
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16224	NC_002929	TCG	2	6	584004	584009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591779
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16227	NC_002929	GC	4	8	584058	584065	0 %	0 %	50 %	50 %	33591779
16228	NC_002929	CG	3	6	584067	584072	0 %	0 %	50 %	50 %	33591779
16229	NC_002929	GTC	2	6	584078	584083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591779
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16231	NC_002929	CGT	2	6	584122	584127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591779
16232	NC_002929	GGCGC	2	10	584155	584164	0 %	0 %	60 %	40 %	33591779
16233	NC_002929	ACG	2	6	584181	584186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591779
16234	NC_002929	GCCG	2	8	584203	584210	0 %	0 %	50 %	50 %	33591779
16235	NC_002929	TGC	2	6	584232	584237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591779
16236	NC_002929	ATCCAG	2	12	584243	584254	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33591779
16237	NC_002929	CTACT	2	10	584268	584277	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16238	NC_002929	GCG	2	6	584287	584292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16239	NC_002929	CCGC	2	8	584382	584389	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16240	NC_002929	GGC	2	6	584415	584420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591780
16241	NC_002929	CGC	3	9	584435	584443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591780
16242	NC_002929	G	6	6	584448	584453	0 %	0 %	100 %	0 %	33591780
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16493	NC_002929	GCC	2	6	593590	593595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591789
16494	NC_002929	GCCGGC	2	12	593602	593613	0 %	0 %	50 %	50 %	33591789
16495	NC_002929	CGA	2	6	593718	593723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591789
16496	NC_002929	CGG	2	6	593781	593786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591789
16497	NC_002929	TTCC	2	8	593795	593802	0 %	50 %	0 %	50 %	33591789
16498	NC_002929	CG	3	6	593922	593927	0 %	0 %	50 %	50 %	33591789
16499	NC_002929	CGG	2	6	593952	593957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591789
16500	NC_002929	GCA	2	6	593964	593969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591789

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