MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 113957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_002929	TGGG	2	8	541104	541111	0 %	25 %	75 %	0 %	33591737
15003	NC_002929	CG	3	6	541132	541137	0 %	0 %	50 %	50 %	33591737
15004	NC_002929	GC	3	6	541200	541205	0 %	0 %	50 %	50 %	33591737
15005	NC_002929	CGA	2	6	541214	541219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591737
15006	NC_002929	CTG	2	6	541269	541274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591737
15007	NC_002929	TGC	2	6	541309	541314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591737
15008	NC_002929	GCC	2	6	541365	541370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591737
15009	NC_002929	CAC	2	6	541400	541405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591737
15010	NC_002929	GGT	2	6	541496	541501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591737
15011	NC_002929	CGG	2	6	541529	541534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591737
15012	NC_002929	CGG	2	6	541568	541573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591737
15013	NC_002929	CAT	2	6	541577	541582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591737
15014	NC_002929	CCGG	2	8	541598	541605	0 %	0 %	50 %	50 %	33591737
15015	NC_002929	ATGCTG	2	12	541644	541655	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	33591737
15016	NC_002929	TGC	2	6	541666	541671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591737
15017	NC_002929	CAT	2	6	541706	541711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591737
15018	NC_002929	GGTC	2	8	541828	541835	0 %	25 %	50 %	25 %	33591737
15019	NC_002929	TCG	2	6	541843	541848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591737
15020	NC_002929	GGC	2	6	541865	541870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591737
15021	NC_002929	GC	3	6	541886	541891	0 %	0 %	50 %	50 %	33591737
15022	NC_002929	CGA	2	6	541919	541924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591737
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15025	NC_002929	CGGC	2	8	542017	542024	0 %	0 %	50 %	50 %	33591737
15026	NC_002929	GGCT	2	8	542040	542047	0 %	25 %	50 %	25 %	33591737
15027	NC_002929	CGA	3	9	542072	542080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591737
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15029	NC_002929	AGC	2	6	542170	542175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591737
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15037	NC_002929	CGG	2	6	542475	542480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591738
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15050	NC_002929	CGA	2	6	542985	542990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591738
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15053	NC_002929	CGC	2	6	543066	543071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591738
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15091	NC_002929	CGCCGG	2	12	544440	544451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15092	NC_002929	GGCC	3	12	544457	544468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15093	NC_002929	CCGG	2	8	544492	544499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15101	NC_002929	ACCA	2	8	544867	544874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15102	NC_002929	GCT	2	6	544887	544892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15104	NC_002929	GC	4	8	545034	545041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15105	NC_002929	CCA	2	6	545087	545092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15106	NC_002929	TGG	2	6	545140	545145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_002929	CAT	2	6	545148	545153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15109	NC_002929	GCG	2	6	545197	545202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15110	NC_002929	CAA	2	6	545205	545210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15111	NC_002929	GC	3	6	545328	545333	0 %	0 %	50 %	50 %	33591741
15112	NC_002929	TGG	2	6	545343	545348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591741
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15248	NC_002929	GC	3	6	551438	551443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15249	NC_002929	CGG	2	6	551496	551501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15372	NC_002929	CGGC	2	8	556554	556561	0 %	0 %	50 %	50 %	33591752
15373	NC_002929	GGCT	2	8	556571	556578	0 %	25 %	50 %	25 %	33591752
15374	NC_002929	GTG	2	6	556616	556621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591752
15375	NC_002929	GC	3	6	556626	556631	0 %	0 %	50 %	50 %	33591752
15376	NC_002929	GCGCC	2	10	556681	556690	0 %	0 %	40 %	60 %	33591752
15377	NC_002929	CGG	2	6	556699	556704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591752
15378	NC_002929	TTCGAT	2	12	556732	556743	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	33591753
15379	NC_002929	CCCTG	2	10	556760	556769	0 %	20 %	20 %	60 %	33591753
15380	NC_002929	GCC	2	6	556825	556830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591753
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15389	NC_002929	GC	3	6	557075	557080	0 %	0 %	50 %	50 %	33591753
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15393	NC_002929	CGA	2	6	557187	557192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591753
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15473	NC_002929	TCATA	2	10	559564	559573	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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15492	NC_002929	CGG	2	6	560323	560328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591757
15493	NC_002929	AGC	2	6	560370	560375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591757
15494	NC_002929	CGT	3	9	560386	560394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591757
15495	NC_002929	GCA	2	6	560452	560457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591757
15496	NC_002929	GGTC	2	8	560485	560492	0 %	25 %	50 %	25 %	33591757
15497	NC_002929	GCG	2	6	560530	560535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591757
15498	NC_002929	GC	3	6	560538	560543	0 %	0 %	50 %	50 %	33591757
15499	NC_002929	GGC	3	9	560558	560566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591757
15500	NC_002929	GAC	2	6	560606	560611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591757

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