MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 113957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_002929	G	6	6	523015	523020	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_002929	GGC	2	6	523092	523097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591722
14503	NC_002929	GCA	2	6	523193	523198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591722
14504	NC_002929	GC	3	6	523216	523221	0 %	0 %	50 %	50 %	33591722
14505	NC_002929	GGC	2	6	523278	523283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591722
14506	NC_002929	TCAA	2	8	523312	523319	50 %	25 %	0 %	25 %	33591722
14507	NC_002929	TTTC	2	8	523331	523338	0 %	75 %	0 %	25 %	33591722
14508	NC_002929	CCG	2	6	523352	523357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14509	NC_002929	GGCG	2	8	523361	523368	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14510	NC_002929	A	6	6	523454	523459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14511	NC_002929	CGT	2	6	523503	523508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14512	NC_002929	AGGT	2	8	523558	523565	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_002929	CAT	2	6	523596	523601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14514	NC_002929	AGT	2	6	523680	523685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14515	NC_002929	AT	3	6	523708	523713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14516	NC_002929	CAG	2	6	523755	523760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14517	NC_002929	CGG	2	6	523800	523805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14518	NC_002929	GCA	2	6	523886	523891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14519	NC_002929	GTC	3	9	523933	523941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14520	NC_002929	GAA	2	6	523945	523950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14521	NC_002929	CTT	2	6	524004	524009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14522	NC_002929	TG	3	6	524036	524041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_002929	GCA	2	6	524081	524086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14524	NC_002929	AGG	2	6	524096	524101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_002929	CAA	2	6	524121	524126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14526	NC_002929	GC	3	6	524208	524213	0 %	0 %	50 %	50 %	33591724
14527	NC_002929	TGG	2	6	524223	524228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591724
14528	NC_002929	GTA	2	6	524243	524248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591724
14529	NC_002929	GCG	2	6	524415	524420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591724
14530	NC_002929	GTA	2	6	524489	524494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591724
14531	NC_002929	TCG	2	6	524538	524543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591724
14532	NC_002929	ACGAAG	2	12	524589	524600	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	33591724
14533	NC_002929	CTT	2	6	524675	524680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33591724
14534	NC_002929	GCA	2	6	524692	524697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591724
14535	NC_002929	CAC	2	6	524726	524731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591724
14536	NC_002929	CGGC	2	8	524737	524744	0 %	0 %	50 %	50 %	33591724
14537	NC_002929	GCTG	2	8	524798	524805	0 %	25 %	50 %	25 %	33591724
14538	NC_002929	GC	3	6	524828	524833	0 %	0 %	50 %	50 %	33591724
14539	NC_002929	GCG	2	6	524849	524854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591724
14540	NC_002929	CA	3	6	525017	525022	50 %	0 %	0 %	50 %	33591724
14541	NC_002929	CCGG	2	8	525101	525108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14542	NC_002929	G	6	6	525125	525130	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_002929	CTTCCA	2	12	525227	525238	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	33591725
14544	NC_002929	CAC	2	6	525270	525275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591725
14545	NC_002929	CG	3	6	525276	525281	0 %	0 %	50 %	50 %	33591725
14546	NC_002929	GC	3	6	525288	525293	0 %	0 %	50 %	50 %	33591725
14547	NC_002929	CGCC	2	8	525296	525303	0 %	0 %	25 %	75 %	33591725
14548	NC_002929	GGCC	2	8	525327	525334	0 %	0 %	50 %	50 %	33591725
14549	NC_002929	GCCG	2	8	525390	525397	0 %	0 %	50 %	50 %	33591725
14550	NC_002929	GCC	2	6	525409	525414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591725
14551	NC_002929	GC	3	6	525432	525437	0 %	0 %	50 %	50 %	33591725
14552	NC_002929	GCC	2	6	525543	525548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591725
14553	NC_002929	AGGC	2	8	525596	525603	25 %	0 %	50 %	25 %	33591725
14554	NC_002929	GCG	2	6	525652	525657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14555	NC_002929	CGG	2	6	525658	525663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14556	NC_002929	GGCG	2	8	525703	525710	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14557	NC_002929	GCGCC	2	10	525724	525733	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14558	NC_002929	ACA	2	6	525741	525746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14559	NC_002929	GCG	2	6	525906	525911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591726
14560	NC_002929	GCC	2	6	525936	525941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591726
14561	NC_002929	CTG	2	6	525988	525993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591726
14562	NC_002929	GCC	2	6	526020	526025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591726
14563	NC_002929	GCCG	2	8	526033	526040	0 %	0 %	50 %	50 %	33591726
14564	NC_002929	ACG	2	6	526094	526099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591726
14565	NC_002929	CGC	2	6	526113	526118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591726
14566	NC_002929	CTA	2	6	526125	526130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591726
14567	NC_002929	CAG	2	6	526138	526143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591726
14568	NC_002929	GCC	2	6	526162	526167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591726
14569	NC_002929	GGCT	2	8	526234	526241	0 %	25 %	50 %	25 %	33591726
14570	NC_002929	CTG	2	6	526300	526305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591726
14571	NC_002929	TGA	2	6	526355	526360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591726
14572	NC_002929	GC	3	6	526369	526374	0 %	0 %	50 %	50 %	33591726
14573	NC_002929	CCG	2	6	526416	526421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591726
14574	NC_002929	GCC	2	6	526481	526486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14575	NC_002929	GCG	2	6	526512	526517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14576	NC_002929	G	6	6	526523	526528	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14577	NC_002929	TTG	2	6	526541	526546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14578	NC_002929	GT	3	6	526566	526571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_002929	TGG	2	6	526643	526648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14580	NC_002929	TGG	2	6	526658	526663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14581	NC_002929	CTAT	2	8	526665	526672	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14582	NC_002929	GC	3	6	526675	526680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14583	NC_002929	CGC	2	6	526686	526691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14584	NC_002929	GA	3	6	526728	526733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14585	NC_002929	GCC	2	6	526764	526769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591727
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14588	NC_002929	GCCG	2	8	527030	527037	0 %	0 %	50 %	50 %	33591727
14589	NC_002929	GC	3	6	527153	527158	0 %	0 %	50 %	50 %	33591727
14590	NC_002929	GCG	2	6	527196	527201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591727
14591	NC_002929	GC	3	6	527221	527226	0 %	0 %	50 %	50 %	33591727
14592	NC_002929	TCG	2	6	527236	527241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591727
14593	NC_002929	TCGA	2	8	527286	527293	25 %	25 %	25 %	25 %	33591727
14594	NC_002929	ACC	2	6	527325	527330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591727
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14596	NC_002929	CCG	2	6	527359	527364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591727
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14598	NC_002929	CAAGGC	2	12	527378	527389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591727
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14600	NC_002929	CAG	2	6	527409	527414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591727
14601	NC_002929	CCG	2	6	527419	527424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591727
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14604	NC_002929	TGC	2	6	527545	527550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591727
14605	NC_002929	CCG	2	6	527629	527634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14606	NC_002929	CGG	2	6	527668	527673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14607	NC_002929	TGG	2	6	527695	527700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591728
14608	NC_002929	CG	3	6	527743	527748	0 %	0 %	50 %	50 %	33591728
14609	NC_002929	GGT	2	6	527753	527758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591728
14610	NC_002929	CG	3	6	527850	527855	0 %	0 %	50 %	50 %	33591728
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14614	NC_002929	CGG	2	6	528092	528097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14615	NC_002929	CG	3	6	528098	528103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14616	NC_002929	GCG	2	6	528122	528127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14617	NC_002929	GGCG	2	8	528136	528143	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14618	NC_002929	GC	3	6	528162	528167	0 %	0 %	50 %	50 %	33591729
14619	NC_002929	CCG	2	6	528185	528190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591729
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14622	NC_002929	CCG	2	6	528308	528313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591729
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14997	NC_002929	GCC	2	6	540990	540995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591737
14998	NC_002929	GCT	2	6	541037	541042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591737
14999	NC_002929	CCG	2	6	541047	541052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591737
15000	NC_002929	GTCT	2	8	541068	541075	0 %	50 %	25 %	25 %	33591737

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