MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 113957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14124	NC_002929	GC	3	6	507724	507729	0 %	0 %	50 %	50 %	33591704
14125	NC_002929	CACC	2	8	507749	507756	25 %	0 %	0 %	75 %	33591704
14126	NC_002929	AGCG	2	8	507780	507787	25 %	0 %	50 %	25 %	33591704
14127	NC_002929	CGG	2	6	507833	507838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591704
14128	NC_002929	ACG	2	6	507880	507885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591704
14129	NC_002929	CGG	2	6	507914	507919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591704
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14131	NC_002929	CGGC	2	8	507973	507980	0 %	0 %	50 %	50 %	33591704
14132	NC_002929	GAA	3	9	508067	508075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33591704
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14139	NC_002929	CAT	2	6	508355	508360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591704
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14145	NC_002929	TGG	2	6	508630	508635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591704
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14160	NC_002929	T	7	7	509026	509032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14161	NC_002929	GTTGC	2	10	509051	509060	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14162	NC_002929	AAG	2	6	509061	509066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14163	NC_002929	TATT	2	8	509093	509100	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14164	NC_002929	CGG	2	6	509129	509134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14168	NC_002929	CGT	2	6	509210	509215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14185	NC_002929	G	7	7	510194	510200	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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14189	NC_002929	CGG	2	6	510319	510324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14191	NC_002929	CCG	2	6	510402	510407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14195	NC_002929	CTA	2	6	510647	510652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591706
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14221	NC_002929	ATG	2	6	511464	511469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591706
14222	NC_002929	GC	3	6	511478	511483	0 %	0 %	50 %	50 %	33591706
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14224	NC_002929	GGCC	2	8	511551	511558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14225	NC_002929	CGGC	2	8	511569	511576	0 %	0 %	50 %	50 %	33591707
14226	NC_002929	GCG	2	6	511594	511599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591707
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14229	NC_002929	GC	4	8	511635	511642	0 %	0 %	50 %	50 %	33591707
14230	NC_002929	GGC	2	6	511684	511689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591707
14231	NC_002929	CG	3	6	511699	511704	0 %	0 %	50 %	50 %	33591707
14232	NC_002929	CAG	2	6	511739	511744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591707
14233	NC_002929	GGC	2	6	511749	511754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591707
14234	NC_002929	GCGCC	2	10	511777	511786	0 %	0 %	40 %	60 %	33591707
14235	NC_002929	GCA	3	9	511816	511824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591707
14236	NC_002929	GTC	2	6	511835	511840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591707
14237	NC_002929	TCG	2	6	511896	511901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591707
14238	NC_002929	CAG	2	6	511919	511924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591707
14239	NC_002929	TACG	2	8	511973	511980	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14240	NC_002929	GAA	2	6	512095	512100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14241	NC_002929	CGG	2	6	512134	512139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14242	NC_002929	GCTG	2	8	512140	512147	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14243	NC_002929	CGC	2	6	512155	512160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14244	NC_002929	CGC	2	6	512171	512176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14245	NC_002929	GGA	2	6	512186	512191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14246	NC_002929	CAA	2	6	512207	512212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33591708
14247	NC_002929	GTC	2	6	512223	512228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591708
14248	NC_002929	CGC	2	6	512257	512262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591708
14249	NC_002929	GCC	2	6	512274	512279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591708
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14267	NC_002929	TGC	2	6	512824	512829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591708
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14322	NC_002929	GC	3	6	514850	514855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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14340	NC_002929	TGC	2	6	515340	515345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14344	NC_002929	CAA	2	6	515519	515524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14495	NC_002929	CGGC	2	8	522627	522634	0 %	0 %	50 %	50 %	33591721
14496	NC_002929	GCTG	2	8	522688	522695	0 %	25 %	50 %	25 %	33591721
14497	NC_002929	GC	3	6	522718	522723	0 %	0 %	50 %	50 %	33591721
14498	NC_002929	GCG	2	6	522739	522744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591721
14499	NC_002929	CA	3	6	522907	522912	50 %	0 %	0 %	50 %	33591721
14500	NC_002929	CCGG	2	8	522991	522998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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