MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 113957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_002929	GCC	2	6	450623	450628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591661
12502	NC_002929	CTG	2	6	450644	450649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591661
12503	NC_002929	CGT	2	6	450667	450672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591661
12504	NC_002929	CGG	2	6	450679	450684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591661
12505	NC_002929	CTG	2	6	450713	450718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591661
12506	NC_002929	GCC	2	6	450726	450731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591661
12507	NC_002929	CCA	2	6	450840	450845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591661
12508	NC_002929	CG	3	6	450858	450863	0 %	0 %	50 %	50 %	33591661
12509	NC_002929	AGC	2	6	450864	450869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591661
12510	NC_002929	CG	5	10	450899	450908	0 %	0 %	50 %	50 %	33591661
12511	NC_002929	GGCC	2	8	450958	450965	0 %	0 %	50 %	50 %	33591661
12512	NC_002929	CGA	2	6	450991	450996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591661
12513	NC_002929	AAG	2	6	451049	451054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33591661
12514	NC_002929	CCG	2	6	451068	451073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591661
12515	NC_002929	TCG	3	9	451079	451087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591661
12516	NC_002929	GC	3	6	451120	451125	0 %	0 %	50 %	50 %	33591661
12517	NC_002929	CCG	2	6	451131	451136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591661
12518	NC_002929	TCG	2	6	451167	451172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591661
12519	NC_002929	CAC	2	6	451207	451212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591661
12520	NC_002929	GC	3	6	451224	451229	0 %	0 %	50 %	50 %	33591661
12521	NC_002929	GAA	2	6	451231	451236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33591661
12522	NC_002929	GGC	2	6	451364	451369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591661
12523	NC_002929	GC	3	6	451406	451411	0 %	0 %	50 %	50 %	33591661
12524	NC_002929	GC	3	6	451431	451436	0 %	0 %	50 %	50 %	33591661
12525	NC_002929	CGG	2	6	451447	451452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591661
12526	NC_002929	GCG	2	6	451458	451463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591661
12527	NC_002929	CGG	3	9	451480	451488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591661
12528	NC_002929	CGG	2	6	451556	451561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12529	NC_002929	CCG	2	6	451589	451594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12530	NC_002929	ATC	2	6	451629	451634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591662
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12532	NC_002929	CGA	2	6	451700	451705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591662
12533	NC_002929	GGC	2	6	451737	451742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591662
12534	NC_002929	CG	4	8	451751	451758	0 %	0 %	50 %	50 %	33591662
12535	NC_002929	TGC	2	6	451783	451788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591662
12536	NC_002929	CG	3	6	451789	451794	0 %	0 %	50 %	50 %	33591662
12537	NC_002929	AAC	2	6	451804	451809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33591662
12538	NC_002929	CGA	2	6	451871	451876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591662
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12540	NC_002929	GGC	2	6	451962	451967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591662
12541	NC_002929	TAC	2	6	451971	451976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591662
12542	NC_002929	AAG	2	6	451989	451994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33591662
12543	NC_002929	GC	3	6	452000	452005	0 %	0 %	50 %	50 %	33591662
12544	NC_002929	CGC	2	6	452015	452020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591662
12545	NC_002929	GCG	2	6	452059	452064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591662
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12550	NC_002929	GCG	2	6	452194	452199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591662
12551	NC_002929	CGA	2	6	452219	452224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591662
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12553	NC_002929	GGGC	2	8	452261	452268	0 %	0 %	75 %	25 %	33591662
12554	NC_002929	GAG	2	6	452295	452300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33591662
12555	NC_002929	CGG	3	9	452318	452326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591662
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12558	NC_002929	ACG	2	6	452473	452478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591662
12559	NC_002929	CAT	2	6	452495	452500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591662
12560	NC_002929	ACG	2	6	452524	452529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591662
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12562	NC_002929	TCG	2	6	452551	452556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591662
12563	NC_002929	CGA	2	6	452570	452575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591662
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12569	NC_002929	GC	3	6	452710	452715	0 %	0 %	50 %	50 %	33591662
12570	NC_002929	TGG	2	6	452761	452766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591662
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12576	NC_002929	CG	3	6	452939	452944	0 %	0 %	50 %	50 %	33591662
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12580	NC_002929	GC	3	6	453019	453024	0 %	0 %	50 %	50 %	33591662
12581	NC_002929	GCG	2	6	453031	453036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591662
12582	NC_002929	AGC	2	6	453055	453060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591662
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12584	NC_002929	CG	3	6	453107	453112	0 %	0 %	50 %	50 %	33591662
12585	NC_002929	GAC	2	6	453120	453125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591662
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12588	NC_002929	CGC	2	6	453150	453155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591662
12589	NC_002929	CGG	2	6	453175	453180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591662
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12591	NC_002929	GCGCC	2	10	453253	453262	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12592	NC_002929	CTG	2	6	453289	453294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591663
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12595	NC_002929	CG	3	6	453390	453395	0 %	0 %	50 %	50 %	33591663
12596	NC_002929	GCC	2	6	453403	453408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591663
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12599	NC_002929	GC	3	6	453459	453464	0 %	0 %	50 %	50 %	33591663
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12601	NC_002929	GC	3	6	453497	453502	0 %	0 %	50 %	50 %	33591663
12602	NC_002929	TCG	2	6	453581	453586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591663
12603	NC_002929	GCCG	2	8	453591	453598	0 %	0 %	50 %	50 %	33591663
12604	NC_002929	CGC	2	6	453606	453611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591663
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12607	NC_002929	GC	3	6	453648	453653	0 %	0 %	50 %	50 %	33591663
12608	NC_002929	TCC	2	6	453704	453709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33591663
12609	NC_002929	GCA	2	6	453711	453716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591663
12610	NC_002929	CGG	4	12	453759	453770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591663
12611	NC_002929	GAG	2	6	453790	453795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33591663
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12613	NC_002929	GCCAGC	2	12	453838	453849	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33591663
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12618	NC_002929	GCG	3	9	454057	454065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591663
12619	NC_002929	CG	4	8	454064	454071	0 %	0 %	50 %	50 %	33591663
12620	NC_002929	GCC	2	6	454222	454227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591663
12621	NC_002929	AGCC	2	8	454228	454235	25 %	0 %	25 %	50 %	33591663
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12623	NC_002929	GCCAT	2	10	454271	454280	20 %	20 %	20 %	40 %	33591663
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12992	NC_002929	GAA	2	6	467837	467842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33591672
12993	NC_002929	CCA	2	6	467878	467883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591672
12994	NC_002929	GCA	2	6	467953	467958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591672
12995	NC_002929	CCGCCA	2	12	467959	467970	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	33591672
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12999	NC_002929	CGA	2	6	468016	468021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591672
13000	NC_002929	CAG	4	12	468041	468052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591672

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