MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 137474

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_002928	CTG	2	6	628787	628792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17002	NC_002928	GC	3	6	628807	628812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17003	NC_002928	TGA	2	6	628815	628820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17004	NC_002928	CAC	2	6	628847	628852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17005	NC_002928	ATC	2	6	628859	628864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17006	NC_002928	CAT	2	6	628994	628999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595300
17007	NC_002928	GCA	2	6	629026	629031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595300
17008	NC_002928	GGC	2	6	629127	629132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595300
17009	NC_002928	GCA	2	6	629212	629217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595300
17010	NC_002928	CGA	2	6	629258	629263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595300
17011	NC_002928	CG	3	6	629264	629269	0 %	0 %	50 %	50 %	33595300
17012	NC_002928	AGG	2	6	629271	629276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33595300
17013	NC_002928	GCT	2	6	629282	629287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595300
17014	NC_002928	CCTG	2	8	629293	629300	0 %	25 %	25 %	50 %	33595300
17015	NC_002928	ATT	2	6	629302	629307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33595300
17016	NC_002928	CGG	2	6	629354	629359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595300
17017	NC_002928	CAG	3	9	629361	629369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595300
17018	NC_002928	TGG	2	6	629371	629376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595300
17019	NC_002928	CG	3	6	629385	629390	0 %	0 %	50 %	50 %	33595300
17020	NC_002928	TGA	2	6	629392	629397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595300
17021	NC_002928	GC	3	6	629398	629403	0 %	0 %	50 %	50 %	33595300
17022	NC_002928	TGC	3	9	629410	629418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595300
17023	NC_002928	TCA	2	6	629461	629466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595300
17024	NC_002928	GTG	2	6	629472	629477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595300
17025	NC_002928	CAG	2	6	629490	629495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595300
17026	NC_002928	TGG	2	6	629512	629517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595300
17027	NC_002928	GTC	2	6	629580	629585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595300
17028	NC_002928	CCG	2	6	629596	629601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595300
17029	NC_002928	AAG	2	6	629628	629633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33595300
17030	NC_002928	GTG	3	9	629655	629663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17031	NC_002928	CCGCG	2	10	629678	629687	0 %	0 %	40 %	60 %	33595301
17032	NC_002928	CG	3	6	629719	629724	0 %	0 %	50 %	50 %	33595301
17033	NC_002928	CGG	2	6	629827	629832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595301
17034	NC_002928	GC	3	6	629872	629877	0 %	0 %	50 %	50 %	33595301
17035	NC_002928	TCGA	2	8	629886	629893	25 %	25 %	25 %	25 %	33595301
17036	NC_002928	GCC	2	6	629952	629957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595301
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17040	NC_002928	CGC	2	6	630109	630114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595301
17041	NC_002928	CG	3	6	630148	630153	0 %	0 %	50 %	50 %	33595301
17042	NC_002928	GGTCG	2	10	630179	630188	0 %	20 %	60 %	20 %	33595301
17043	NC_002928	CGA	2	6	630235	630240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595301
17044	NC_002928	GAC	2	6	630242	630247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595301
17045	NC_002928	TCG	2	6	630270	630275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595301
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17047	NC_002928	AGC	2	6	630390	630395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595301
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17049	NC_002928	CGC	3	9	630478	630486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595301
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17051	NC_002928	CGA	2	6	630520	630525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595301
17052	NC_002928	TCG	2	6	630549	630554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595301
17053	NC_002928	CGC	2	6	630598	630603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595301
17054	NC_002928	ATC	2	6	630711	630716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595301
17055	NC_002928	CCTT	2	8	630726	630733	0 %	50 %	0 %	50 %	33595301
17056	NC_002928	TCG	2	6	630750	630755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595301
17057	NC_002928	GAT	2	6	630776	630781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595301
17058	NC_002928	CGGTA	2	10	630785	630794	20 %	20 %	40 %	20 %	33595301
17059	NC_002928	AGT	3	9	630874	630882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595301
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17064	NC_002928	GC	3	6	631035	631040	0 %	0 %	50 %	50 %	33595301
17065	NC_002928	GCC	2	6	631079	631084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595301
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17087	NC_002928	CAG	2	6	631807	631812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17089	NC_002928	GCC	2	6	631909	631914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17090	NC_002928	GCC	2	6	631987	631992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17091	NC_002928	TGT	2	6	632001	632006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17094	NC_002928	GTT	2	6	632153	632158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17095	NC_002928	GGC	2	6	632186	632191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17099	NC_002928	GCGG	2	8	632300	632307	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17100	NC_002928	CATGTC	2	12	632408	632419	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17102	NC_002928	CGC	2	6	632453	632458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17103	NC_002928	GCG	2	6	632519	632524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17104	NC_002928	GCC	2	6	632578	632583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17105	NC_002928	CCGG	2	8	632630	632637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17106	NC_002928	CGG	2	6	632655	632660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17107	NC_002928	GAT	2	6	632702	632707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595302
17108	NC_002928	CCG	2	6	632711	632716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595302
17109	NC_002928	T	6	6	632717	632722	0 %	100 %	0 %	0 %	33595302
17110	NC_002928	CGGCAC	2	12	632816	632827	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33595302
17111	NC_002928	GGT	2	6	632885	632890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595302
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17113	NC_002928	GC	3	6	632980	632985	0 %	0 %	50 %	50 %	33595302
17114	NC_002928	TGC	2	6	632992	632997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595302
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17118	NC_002928	TGA	2	6	633202	633207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595302
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17121	NC_002928	GC	3	6	633464	633469	0 %	0 %	50 %	50 %	33595302
17122	NC_002928	CGG	4	12	633514	633525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595302
17123	NC_002928	GCCG	2	8	633584	633591	0 %	0 %	50 %	50 %	33595302
17124	NC_002928	GATC	2	8	633697	633704	25 %	25 %	25 %	25 %	33595303
17125	NC_002928	CTG	2	6	633716	633721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595303
17126	NC_002928	TGG	2	6	633740	633745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595303
17127	NC_002928	GAC	2	6	633751	633756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595303
17128	NC_002928	CGG	2	6	633814	633819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595303
17129	NC_002928	TCG	2	6	633834	633839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595303
17130	NC_002928	CGAT	2	8	633882	633889	25 %	25 %	25 %	25 %	33595303
17131	NC_002928	TTC	2	6	633890	633895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33595303
17132	NC_002928	GGCG	2	8	633934	633941	0 %	0 %	75 %	25 %	33595303
17133	NC_002928	GCCG	2	8	634003	634010	0 %	0 %	50 %	50 %	33595303
17134	NC_002928	GTG	2	6	634013	634018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595303
17135	NC_002928	TGC	2	6	634020	634025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595303
17136	NC_002928	CGC	2	6	634032	634037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595303
17137	NC_002928	GCCTGG	2	12	634059	634070	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33595303
17138	NC_002928	CCG	2	6	634086	634091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595303
17139	NC_002928	GC	5	10	634099	634108	0 %	0 %	50 %	50 %	33595303
17140	NC_002928	GTG	2	6	634109	634114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595303
17141	NC_002928	TGG	2	6	634188	634193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595303
17142	NC_002928	C	7	7	634205	634211	0 %	0 %	0 %	100 %	33595303
17143	NC_002928	GCC	2	6	634217	634222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595303
17144	NC_002928	CGGC	2	8	634377	634384	0 %	0 %	50 %	50 %	33595303
17145	NC_002928	GGCG	2	8	634408	634415	0 %	0 %	75 %	25 %	33595303
17146	NC_002928	GC	3	6	634427	634432	0 %	0 %	50 %	50 %	33595303
17147	NC_002928	CGA	2	6	634441	634446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595303
17148	NC_002928	CGG	2	6	634474	634479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595303
17149	NC_002928	GC	3	6	634481	634486	0 %	0 %	50 %	50 %	33595303
17150	NC_002928	TGC	2	6	634521	634526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595303
17151	NC_002928	AC	4	8	634539	634546	50 %	0 %	0 %	50 %	33595303
17152	NC_002928	GGCG	2	8	634636	634643	0 %	0 %	75 %	25 %	33595303
17153	NC_002928	GCG	2	6	634665	634670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595303
17154	NC_002928	GCG	2	6	634686	634691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595303
17155	NC_002928	CG	3	6	634693	634698	0 %	0 %	50 %	50 %	33595303
17156	NC_002928	GCG	2	6	634707	634712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595303
17157	NC_002928	CGGCCA	2	12	634731	634742	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33595303
17158	NC_002928	GCA	2	6	634746	634751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595303
17159	NC_002928	CGC	2	6	634788	634793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595303
17160	NC_002928	CGC	2	6	634885	634890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595303
17161	NC_002928	GCG	2	6	634944	634949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595303
17162	NC_002928	GCGG	2	8	634964	634971	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17163	NC_002928	GC	3	6	635054	635059	0 %	0 %	50 %	50 %	33595304
17164	NC_002928	CCGGA	2	10	635073	635082	20 %	0 %	40 %	40 %	33595304
17165	NC_002928	GGC	2	6	635103	635108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595304
17166	NC_002928	GC	3	6	635135	635140	0 %	0 %	50 %	50 %	33595304
17167	NC_002928	GC	3	6	635150	635155	0 %	0 %	50 %	50 %	33595304
17168	NC_002928	TGG	3	9	635170	635178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595304
17169	NC_002928	GCT	2	6	635204	635209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595304
17170	NC_002928	CG	3	6	635252	635257	0 %	0 %	50 %	50 %	33595304
17171	NC_002928	CGC	2	6	635285	635290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595304
17172	NC_002928	CG	3	6	635300	635305	0 %	0 %	50 %	50 %	33595304
17173	NC_002928	CCG	2	6	635320	635325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595304
17174	NC_002928	GCC	2	6	635337	635342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595304
17175	NC_002928	ACG	2	6	635362	635367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595304
17176	NC_002928	GGCG	2	8	635441	635448	0 %	0 %	75 %	25 %	33595304
17177	NC_002928	GGC	2	6	635453	635458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595304
17178	NC_002928	CAT	2	6	635459	635464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595304
17179	NC_002928	ATG	2	6	635502	635507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595304
17180	NC_002928	TGC	2	6	635521	635526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595304
17181	NC_002928	CG	3	6	635551	635556	0 %	0 %	50 %	50 %	33595304
17182	NC_002928	TACGCG	2	12	635580	635591	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33595304
17183	NC_002928	CGG	2	6	635680	635685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595304
17184	NC_002928	CCG	2	6	635733	635738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595304
17185	NC_002928	GCT	2	6	635753	635758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595304
17186	NC_002928	CG	3	6	635783	635788	0 %	0 %	50 %	50 %	33595304
17187	NC_002928	GCT	2	6	635831	635836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595304
17188	NC_002928	AGG	2	6	635854	635859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33595304
17189	NC_002928	CAT	2	6	635886	635891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595304
17190	NC_002928	CG	3	6	635947	635952	0 %	0 %	50 %	50 %	33595304
17191	NC_002928	GC	3	6	635983	635988	0 %	0 %	50 %	50 %	33595304
17192	NC_002928	TCG	2	6	635998	636003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595304
17193	NC_002928	GCC	2	6	636016	636021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595304
17194	NC_002928	GCG	2	6	636040	636045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595304
17195	NC_002928	GCG	2	6	636058	636063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595304
17196	NC_002928	CGG	2	6	636122	636127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595304
17197	NC_002928	GCG	2	6	636139	636144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595304
17198	NC_002928	GCT	2	6	636173	636178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595304
17199	NC_002928	CGT	2	6	636179	636184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595304
17200	NC_002928	ATC	2	6	636204	636209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595304
17201	NC_002928	CCG	2	6	636232	636237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595304
17202	NC_002928	CGG	2	6	636280	636285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595304
17203	NC_002928	TGG	2	6	636286	636291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595304
17204	NC_002928	GAAG	2	8	636296	636303	50 %	0 %	50 %	0 %	33595304
17205	NC_002928	GTG	2	6	636333	636338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595304
17206	NC_002928	CCCG	2	8	636353	636360	0 %	0 %	25 %	75 %	33595304
17207	NC_002928	GGC	2	6	636365	636370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595304
17208	NC_002928	GCA	2	6	636377	636382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595304
17209	NC_002928	CG	3	6	636416	636421	0 %	0 %	50 %	50 %	33595304
17210	NC_002928	CAT	2	6	636422	636427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595304
17211	NC_002928	GCG	3	9	636549	636557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595305
17212	NC_002928	GCGTTC	2	12	636581	636592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595305
17213	NC_002928	GGC	2	6	636652	636657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595305
17214	NC_002928	GCG	2	6	636689	636694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595305
17215	NC_002928	GCC	2	6	636701	636706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595305
17216	NC_002928	TCG	2	6	636738	636743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595305
17217	NC_002928	AGG	2	6	636745	636750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33595305
17218	NC_002928	TGGA	2	8	636753	636760	25 %	25 %	50 %	0 %	33595305
17219	NC_002928	GCG	2	6	636771	636776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595305
17220	NC_002928	TCG	2	6	636780	636785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595305
17221	NC_002928	CG	3	6	636851	636856	0 %	0 %	50 %	50 %	33595305
17222	NC_002928	GTG	2	6	636867	636872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595305
17223	NC_002928	GCA	2	6	637009	637014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595305
17224	NC_002928	GCA	2	6	637030	637035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595305
17225	NC_002928	CGC	2	6	637079	637084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595305
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17227	NC_002928	GCG	2	6	637207	637212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595305
17228	NC_002928	GC	3	6	637230	637235	0 %	0 %	50 %	50 %	33595305
17229	NC_002928	TCA	2	6	637261	637266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595305
17230	NC_002928	GCG	2	6	637269	637274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595305
17231	NC_002928	TCG	2	6	637290	637295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595305
17232	NC_002928	CG	3	6	637377	637382	0 %	0 %	50 %	50 %	33595306
17233	NC_002928	TGC	2	6	637383	637388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595306
17234	NC_002928	GGCCG	2	10	637443	637452	0 %	0 %	60 %	40 %	33595306
17235	NC_002928	CCA	2	6	637467	637472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33595306
17236	NC_002928	CGG	2	6	637584	637589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595306
17237	NC_002928	GC	3	6	637604	637609	0 %	0 %	50 %	50 %	33595306
17238	NC_002928	GCAG	2	8	637635	637642	25 %	0 %	50 %	25 %	33595306
17239	NC_002928	CAG	2	6	637645	637650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595306
17240	NC_002928	GCCG	2	8	637657	637664	0 %	0 %	50 %	50 %	33595306
17241	NC_002928	CGA	2	6	637666	637671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595306
17242	NC_002928	GCA	2	6	637704	637709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595306
17243	NC_002928	CAGCT	2	10	637769	637778	20 %	20 %	20 %	40 %	33595306
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17245	NC_002928	TGGT	2	8	637820	637827	0 %	50 %	50 %	0 %	33595306
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17366	NC_002928	CCTT	2	8	642346	642353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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17493	NC_002928	GCA	2	6	646972	646977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595311
17494	NC_002928	CAGGGC	2	12	646994	647005	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	33595311
17495	NC_002928	CAC	2	6	647062	647067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33595311
17496	NC_002928	CGT	2	6	647083	647088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595311
17497	NC_002928	GGCC	2	8	647172	647179	0 %	0 %	50 %	50 %	33595311
17498	NC_002928	TGC	2	6	647223	647228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595311
17499	NC_002928	GCG	2	6	647229	647234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595311
17500	NC_002928	GC	3	6	647256	647261	0 %	0 %	50 %	50 %	33595311

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