MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 137474

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_002928	CGG	2	6	591009	591014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16003	NC_002928	CG	3	6	591061	591066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16004	NC_002928	CCG	2	6	591067	591072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16005	NC_002928	CGA	2	6	591078	591083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_002928	CCG	2	6	591105	591110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16007	NC_002928	ACG	2	6	591189	591194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16008	NC_002928	CGA	2	6	591236	591241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595262
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16011	NC_002928	CG	3	6	591275	591280	0 %	0 %	50 %	50 %	33595262
16012	NC_002928	CGA	2	6	591302	591307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595262
16013	NC_002928	CAG	2	6	591486	591491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595262
16014	NC_002928	CTG	2	6	591494	591499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595262
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16021	NC_002928	CGA	2	6	591665	591670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595262
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16025	NC_002928	CGGT	2	8	591811	591818	0 %	25 %	50 %	25 %	33595262
16026	NC_002928	GCGG	2	8	591842	591849	0 %	0 %	75 %	25 %	33595262
16027	NC_002928	CG	3	6	591856	591861	0 %	0 %	50 %	50 %	33595262
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16042	NC_002928	G	7	7	592491	592497	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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16118	NC_002928	GGCC	2	8	595460	595467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16124	NC_002928	GCAT	2	8	595955	595962	25 %	25 %	25 %	25 %	33595266
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16240	NC_002928	AGC	2	6	600116	600121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595271
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16244	NC_002928	ACCTG	2	10	600254	600263	20 %	20 %	20 %	40 %	33595271
16245	NC_002928	CGT	2	6	600306	600311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595271
16246	NC_002928	GAT	2	6	600333	600338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595271
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16251	NC_002928	CAG	2	6	600529	600534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595272
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16253	NC_002928	ACG	2	6	600641	600646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595272
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16255	NC_002928	CCATGA	2	12	600696	600707	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33595272
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16333	NC_002928	CT	4	8	603682	603689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16334	NC_002928	CATT	3	12	603719	603730	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16335	NC_002928	GGCCGT	2	12	603882	603893	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33595275
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16351	NC_002928	GCT	2	6	604422	604427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595275
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16354	NC_002928	CTG	3	9	604543	604551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595275
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16358	NC_002928	GCCGC	2	10	604685	604694	0 %	0 %	40 %	60 %	33595275
16359	NC_002928	GCGG	2	8	604706	604713	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16360	NC_002928	GC	3	6	604721	604726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16361	NC_002928	GCC	2	6	604730	604735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595276
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16364	NC_002928	CGG	2	6	604813	604818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595276
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16366	NC_002928	GCA	2	6	604935	604940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595276
16367	NC_002928	GTG	2	6	604946	604951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595276
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16369	NC_002928	CCG	2	6	605215	605220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595277
16370	NC_002928	CGCC	2	8	605235	605242	0 %	0 %	25 %	75 %	33595277
16371	NC_002928	GCC	2	6	605265	605270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595277
16372	NC_002928	CG	3	6	605271	605276	0 %	0 %	50 %	50 %	33595277
16373	NC_002928	GCT	2	6	605285	605290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595277
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16375	NC_002928	GCC	2	6	605352	605357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595277
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16384	NC_002928	CG	3	6	605660	605665	0 %	0 %	50 %	50 %	33595277
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16394	NC_002928	CGA	2	6	606132	606137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595277
16395	NC_002928	TGG	2	6	606167	606172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595277
16396	NC_002928	GCA	2	6	606180	606185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595277
16397	NC_002928	CCA	2	6	606200	606205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33595277
16398	NC_002928	GAC	2	6	606225	606230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595277
16399	NC_002928	GC	3	6	606255	606260	0 %	0 %	50 %	50 %	33595277
16400	NC_002928	GCC	2	6	606271	606276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595277
16401	NC_002928	ATA	2	6	606300	606305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33595277
16402	NC_002928	CGC	2	6	606403	606408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16403	NC_002928	GGT	2	6	606490	606495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595278
16404	NC_002928	TGA	2	6	606501	606506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595278
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16407	NC_002928	CAG	2	6	606529	606534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595278
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16411	NC_002928	GC	3	6	606628	606633	0 %	0 %	50 %	50 %	33595278
16412	NC_002928	GCC	2	6	606641	606646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595278
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16415	NC_002928	GATC	2	8	606729	606736	25 %	25 %	25 %	25 %	33595278
16416	NC_002928	GGCGAT	2	12	606754	606765	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	33595278
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16418	NC_002928	GAT	2	6	606796	606801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595278
16419	NC_002928	GCA	2	6	606901	606906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595278
16420	NC_002928	GCGCC	2	10	606940	606949	0 %	0 %	40 %	60 %	33595278
16421	NC_002928	CAG	2	6	607009	607014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595278
16422	NC_002928	GC	3	6	607114	607119	0 %	0 %	50 %	50 %	33595278
16423	NC_002928	GC	4	8	607128	607135	0 %	0 %	50 %	50 %	33595278
16424	NC_002928	AGC	2	6	607136	607141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595278
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16428	NC_002928	CCG	2	6	607283	607288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595279
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16430	NC_002928	TCG	2	6	607369	607374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595279
16431	NC_002928	TTC	2	6	607375	607380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33595279
16432	NC_002928	GTC	2	6	607386	607391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595279
16433	NC_002928	GTCG	2	8	607404	607411	0 %	25 %	50 %	25 %	33595279
16434	NC_002928	ACG	2	6	607423	607428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595279
16435	NC_002928	CG	4	8	607457	607464	0 %	0 %	50 %	50 %	33595279
16436	NC_002928	CGC	2	6	607490	607495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595279
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16438	NC_002928	CGC	2	6	607517	607522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595279
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16442	NC_002928	CAG	2	6	607797	607802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595279
16443	NC_002928	TCG	2	6	607810	607815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595279
16444	NC_002928	GCG	2	6	607825	607830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595279
16445	NC_002928	TCG	2	6	607843	607848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595279
16446	NC_002928	CAT	2	6	607893	607898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595279
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16449	NC_002928	CAC	2	6	607944	607949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33595279
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16452	NC_002928	ATC	2	6	608214	608219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595280
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16471	NC_002928	CGC	2	6	608821	608826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595280
16472	NC_002928	GC	3	6	608846	608851	0 %	0 %	50 %	50 %	33595280
16473	NC_002928	CTG	2	6	608855	608860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595280
16474	NC_002928	GCG	2	6	608884	608889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595280
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16476	NC_002928	TGC	2	6	608938	608943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595280
16477	NC_002928	TCGGCG	2	12	608982	608993	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33595280
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16479	NC_002928	GCG	2	6	609044	609049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595280
16480	NC_002928	CGGG	2	8	609056	609063	0 %	0 %	75 %	25 %	33595280
16481	NC_002928	CGA	2	6	609115	609120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595280
16482	NC_002928	GCA	2	6	609139	609144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595280
16483	NC_002928	CTTC	2	8	609154	609161	0 %	50 %	0 %	50 %	33595280
16484	NC_002928	CCG	2	6	609221	609226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595281
16485	NC_002928	GTC	2	6	609248	609253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595281
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16487	NC_002928	GCG	2	6	609316	609321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595281
16488	NC_002928	CG	3	6	609346	609351	0 %	0 %	50 %	50 %	33595281
16489	NC_002928	GGTC	2	8	609384	609391	0 %	25 %	50 %	25 %	33595281
16490	NC_002928	GCA	2	6	609468	609473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595281
16491	NC_002928	GCC	2	6	609475	609480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595281
16492	NC_002928	TGT	2	6	609501	609506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33595281
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