MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 137474

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_002928	TGC	2	6	571948	571953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595244
15503	NC_002928	GGCCC	2	10	571973	571982	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15504	NC_002928	GCC	2	6	572071	572076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595245
15505	NC_002928	GC	3	6	572096	572101	0 %	0 %	50 %	50 %	33595245
15506	NC_002928	CGG	2	6	572192	572197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595245
15507	NC_002928	GC	4	8	572303	572310	0 %	0 %	50 %	50 %	33595245
15508	NC_002928	GCC	2	6	572335	572340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595245
15509	NC_002928	GCC	2	6	572373	572378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595245
15510	NC_002928	CAG	2	6	572379	572384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595245
15511	NC_002928	CGG	2	6	572393	572398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595245
15512	NC_002928	TGC	2	6	572470	572475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595245
15513	NC_002928	CGA	2	6	572490	572495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595245
15514	NC_002928	TTC	2	6	572535	572540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33595245
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15517	NC_002928	CGG	2	6	572702	572707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595245
15518	NC_002928	GC	4	8	572710	572717	0 %	0 %	50 %	50 %	33595245
15519	NC_002928	CGC	3	9	572741	572749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595245
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15521	NC_002928	TGC	2	6	572797	572802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595245
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15529	NC_002928	TCG	2	6	573166	573171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15530	NC_002928	GGCG	2	8	573195	573202	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15531	NC_002928	GCA	3	9	573294	573302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15533	NC_002928	CAG	2	6	573399	573404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595246
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15545	NC_002928	CG	4	8	573762	573769	0 %	0 %	50 %	50 %	33595246
15546	NC_002928	CGG	2	6	573779	573784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595246
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15557	NC_002928	GCA	2	6	574004	574009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595246
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15560	NC_002928	CAG	2	6	574107	574112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595246
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15605	NC_002928	GCC	2	6	575863	575868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595247
15606	NC_002928	GC	3	6	575869	575874	0 %	0 %	50 %	50 %	33595247
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15608	NC_002928	GC	3	6	575905	575910	0 %	0 %	50 %	50 %	33595247
15609	NC_002928	GC	3	6	576023	576028	0 %	0 %	50 %	50 %	33595247
15610	NC_002928	GCGAT	2	10	576038	576047	20 %	20 %	40 %	20 %	33595247
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15619	NC_002928	GC	3	6	576487	576492	0 %	0 %	50 %	50 %	33595248
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15621	NC_002928	TCG	2	6	576554	576559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595248
15622	NC_002928	GGC	2	6	576594	576599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595248
15623	NC_002928	CTG	2	6	576610	576615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595248
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15652	NC_002928	TCGCA	2	10	577475	577484	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15653	NC_002928	AAC	2	6	577505	577510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15671	NC_002928	GCGCC	2	10	578005	578014	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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15691	NC_002928	GC	3	6	578994	578999	0 %	0 %	50 %	50 %	33595250
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15728	NC_002928	GCC	2	6	580571	580576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595251
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15731	NC_002928	GCGCG	2	10	580739	580748	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15732	NC_002928	GGA	2	6	580768	580773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15733	NC_002928	A	7	7	580773	580779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15734	NC_002928	GCG	2	6	580796	580801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15735	NC_002928	CGACA	2	10	580821	580830	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15736	NC_002928	GGCAC	2	10	580850	580859	20 %	0 %	40 %	40 %	33595252
15737	NC_002928	GGCT	2	8	580880	580887	0 %	25 %	50 %	25 %	33595252
15738	NC_002928	CGG	2	6	580903	580908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595252
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15740	NC_002928	CGCGGA	2	12	581081	581092	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	33595252
15741	NC_002928	GC	3	6	581144	581149	0 %	0 %	50 %	50 %	33595252
15742	NC_002928	GCG	2	6	581154	581159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595252
15743	NC_002928	GGA	2	6	581171	581176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33595252
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15994	NC_002928	GAT	2	6	590779	590784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595261
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