MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 137474

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_002928	GCGA	2	8	553546	553553	25 %	0 %	50 %	25 %	33595229
15002	NC_002928	GC	3	6	553588	553593	0 %	0 %	50 %	50 %	33595229
15003	NC_002928	TGT	2	6	553636	553641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33595229
15004	NC_002928	AGT	2	6	553667	553672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595229
15005	NC_002928	TCGC	2	8	553709	553716	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15006	NC_002928	GCGT	2	8	553949	553956	0 %	25 %	50 %	25 %	33595230
15007	NC_002928	GGACA	2	10	553968	553977	40 %	0 %	40 %	20 %	33595230
15008	NC_002928	CG	3	6	553985	553990	0 %	0 %	50 %	50 %	33595230
15009	NC_002928	GTC	2	6	554122	554127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595230
15010	NC_002928	TGC	2	6	554137	554142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595230
15011	NC_002928	GCA	2	6	554224	554229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595230
15012	NC_002928	GCC	2	6	554253	554258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595230
15013	NC_002928	AAG	2	6	554260	554265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33595230
15014	NC_002928	TGA	2	6	554273	554278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595230
15015	NC_002928	ACG	2	6	554412	554417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595231
15016	NC_002928	GTTG	2	8	554421	554428	0 %	50 %	50 %	0 %	33595231
15017	NC_002928	AAG	2	6	554493	554498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33595231
15018	NC_002928	CG	3	6	554507	554512	0 %	0 %	50 %	50 %	33595231
15019	NC_002928	GGA	2	6	554515	554520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33595231
15020	NC_002928	CAG	2	6	554579	554584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595231
15021	NC_002928	GA	3	6	554589	554594	50 %	0 %	50 %	0 %	33595231
15022	NC_002928	CCT	2	6	554597	554602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33595231
15023	NC_002928	GC	3	6	554652	554657	0 %	0 %	50 %	50 %	33595231
15024	NC_002928	GCC	2	6	554719	554724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595231
15025	NC_002928	TGG	2	6	554727	554732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595231
15026	NC_002928	CG	4	8	554785	554792	0 %	0 %	50 %	50 %	33595231
15027	NC_002928	GCC	2	6	554868	554873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595231
15028	NC_002928	CCAG	2	8	554892	554899	25 %	0 %	25 %	50 %	33595231
15029	NC_002928	TGC	2	6	554947	554952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595231
15030	NC_002928	GCG	2	6	554975	554980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595231
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15032	NC_002928	CGG	2	6	555003	555008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595231
15033	NC_002928	CAT	2	6	555013	555018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595231
15034	NC_002928	CGG	2	6	555020	555025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595231
15035	NC_002928	CGA	2	6	555037	555042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595231
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15037	NC_002928	CGA	2	6	555072	555077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595231
15038	NC_002928	TGC	2	6	555078	555083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595231
15039	NC_002928	CTG	2	6	555134	555139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595231
15040	NC_002928	ACAT	2	8	555165	555172	50 %	25 %	0 %	25 %	33595231
15041	NC_002928	CG	3	6	555253	555258	0 %	0 %	50 %	50 %	33595231
15042	NC_002928	TGGC	2	8	555265	555272	0 %	25 %	50 %	25 %	33595231
15043	NC_002928	CGC	2	6	555314	555319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595231
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15046	NC_002928	CGT	2	6	555463	555468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595231
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15049	NC_002928	GATG	2	8	555610	555617	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_002928	GCC	2	6	555686	555691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595232
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15052	NC_002928	G	6	6	555793	555798	0 %	0 %	100 %	0 %	33595232
15053	NC_002928	TGG	3	9	555864	555872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595232
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15055	NC_002928	GCA	2	6	555903	555908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595232
15056	NC_002928	CGGCG	2	10	555912	555921	0 %	0 %	60 %	40 %	33595232
15057	NC_002928	GCA	2	6	555945	555950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595232
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15065	NC_002928	GGC	2	6	556227	556232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595232
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15070	NC_002928	GCG	2	6	556370	556375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595232
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15076	NC_002928	GAG	2	6	556591	556596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33595232
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15079	NC_002928	CAAT	2	8	556677	556684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15087	NC_002928	CGG	2	6	556939	556944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595233
15088	NC_002928	GC	3	6	556975	556980	0 %	0 %	50 %	50 %	33595233
15089	NC_002928	GGAT	2	8	556982	556989	25 %	25 %	50 %	0 %	33595233
15090	NC_002928	CTGG	2	8	556994	557001	0 %	25 %	50 %	25 %	33595233
15091	NC_002928	TCG	2	6	557004	557009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595233
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15093	NC_002928	GCCTT	2	10	557046	557055	0 %	40 %	20 %	40 %	33595233
15094	NC_002928	CG	3	6	557076	557081	0 %	0 %	50 %	50 %	33595233
15095	NC_002928	GCG	3	9	557079	557087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595233
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15108	NC_002928	GC	3	6	557526	557531	0 %	0 %	50 %	50 %	33595233
15109	NC_002928	GGT	2	6	557543	557548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595233
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15118	NC_002928	GGTC	2	8	557747	557754	0 %	25 %	50 %	25 %	33595234
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15122	NC_002928	CCG	2	6	557815	557820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595234
15123	NC_002928	CGG	2	6	557827	557832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595234
15124	NC_002928	AAC	2	6	557852	557857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33595234
15125	NC_002928	TTC	2	6	557877	557882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33595234
15126	NC_002928	GC	3	6	557896	557901	0 %	0 %	50 %	50 %	33595234
15127	NC_002928	CAT	2	6	557932	557937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595234
15128	NC_002928	GCG	2	6	558012	558017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595234
15129	NC_002928	AGC	3	9	558090	558098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595234
15130	NC_002928	CG	4	8	558109	558116	0 %	0 %	50 %	50 %	33595234
15131	NC_002928	CAT	2	6	558130	558135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595234
15132	NC_002928	GCGTGG	2	12	558147	558158	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	33595234
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15134	NC_002928	TCA	2	6	558237	558242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595234
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15140	NC_002928	GC	3	6	558448	558453	0 %	0 %	50 %	50 %	33595234
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15146	NC_002928	CGG	3	9	558688	558696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595234
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15151	NC_002928	GTC	2	6	558992	558997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595234
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15164	NC_002928	GC	4	8	559291	559298	0 %	0 %	50 %	50 %	33595234
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15168	NC_002928	GGC	2	6	559408	559413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595234
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15179	NC_002928	CGG	2	6	559961	559966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595235
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15186	NC_002928	TCG	2	6	560204	560209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595235
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15189	NC_002928	GC	3	6	560346	560351	0 %	0 %	50 %	50 %	33595235
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15193	NC_002928	GAG	2	6	560560	560565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33595235
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15196	NC_002928	GC	4	8	560638	560645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15197	NC_002928	ATG	2	6	560692	560697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595236
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15227	NC_002928	CGGG	2	8	561672	561679	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15228	NC_002928	ATT	2	6	561766	561771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15229	NC_002928	AAT	2	6	561807	561812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15230	NC_002928	ATA	2	6	561815	561820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15231	NC_002928	AAG	2	6	561823	561828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15232	NC_002928	TCC	2	6	561840	561845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15233	NC_002928	GGC	2	6	561866	561871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15234	NC_002928	GC	4	8	561928	561935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15235	NC_002928	CGC	3	9	561962	561970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15236	NC_002928	GC	3	6	561969	561974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15237	NC_002928	ATG	2	6	561989	561994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15238	NC_002928	ATTG	2	8	561996	562003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15239	NC_002928	GGCA	2	8	562027	562034	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15240	NC_002928	AAT	2	6	562051	562056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15241	NC_002928	TGTTT	2	10	562094	562103	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15242	NC_002928	T	6	6	562101	562106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15243	NC_002928	TGG	2	6	562152	562157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595237
15244	NC_002928	GC	3	6	562198	562203	0 %	0 %	50 %	50 %	33595237
15245	NC_002928	AGC	2	6	562212	562217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595237
15246	NC_002928	GAAT	2	8	562252	562259	50 %	25 %	25 %	0 %	33595237
15247	NC_002928	GCTGGC	2	12	562261	562272	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33595237
15248	NC_002928	GGGC	2	8	562373	562380	0 %	0 %	75 %	25 %	33595237
15249	NC_002928	CGC	2	6	562419	562424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595237
15250	NC_002928	CGA	2	6	562549	562554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595237
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15253	NC_002928	AAT	2	6	562729	562734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15254	NC_002928	ACGT	2	8	562864	562871	25 %	25 %	25 %	25 %	33595238
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15278	NC_002928	GGGC	2	8	563758	563765	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15279	NC_002928	GCAT	3	12	563767	563778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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15333	NC_002928	GGA	2	6	565406	565411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15351	NC_002928	AC	3	6	566407	566412	50 %	0 %	0 %	50 %	33595241
15352	NC_002928	GCT	2	6	566416	566421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595241
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15357	NC_002928	GC	4	8	566528	566535	0 %	0 %	50 %	50 %	33595241
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15359	NC_002928	TGC	2	6	566643	566648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595241
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15361	NC_002928	GC	3	6	566732	566737	0 %	0 %	50 %	50 %	33595241
15362	NC_002928	GAT	2	6	566764	566769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595241
15363	NC_002928	GCG	2	6	566770	566775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595241
15364	NC_002928	CGGC	2	8	566797	566804	0 %	0 %	50 %	50 %	33595241
15365	NC_002928	AGC	2	6	566844	566849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595241
15366	NC_002928	CCAG	2	8	566880	566887	25 %	0 %	25 %	50 %	33595241
15367	NC_002928	GC	3	6	566920	566925	0 %	0 %	50 %	50 %	33595241
15368	NC_002928	GCT	3	9	566935	566943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595241
15369	NC_002928	GGC	2	6	566944	566949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595241
15370	NC_002928	TGC	2	6	566961	566966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595241
15371	NC_002928	CGGGGG	2	12	566970	566981	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	33595241
15372	NC_002928	TGG	2	6	567009	567014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595241
15373	NC_002928	CGA	2	6	567039	567044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595241
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15405	NC_002928	GGCC	2	8	568230	568237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15411	NC_002928	GC	4	8	568505	568512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15412	NC_002928	CGA	2	6	568551	568556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15415	NC_002928	CCG	2	6	568631	568636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15420	NC_002928	CGG	2	6	568889	568894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15430	NC_002928	TGG	2	6	569316	569321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15431	NC_002928	GAGC	2	8	569348	569355	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15432	NC_002928	CGGTGG	2	12	569387	569398	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	33595242
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15483	NC_002928	AAGTG	2	10	571151	571160	40 %	20 %	40 %	0 %	33595243
15484	NC_002928	GC	3	6	571173	571178	0 %	0 %	50 %	50 %	33595244
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15487	NC_002928	GGCT	2	8	571234	571241	0 %	25 %	50 %	25 %	33595244
15488	NC_002928	CTG	2	6	571335	571340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595244
15489	NC_002928	GAC	2	6	571377	571382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595244
15490	NC_002928	GCG	2	6	571385	571390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595244
15491	NC_002928	GC	3	6	571398	571403	0 %	0 %	50 %	50 %	33595244
15492	NC_002928	GCG	2	6	571408	571413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595244
15493	NC_002928	GC	5	10	571446	571455	0 %	0 %	50 %	50 %	33595244
15494	NC_002928	CGCT	2	8	571458	571465	0 %	25 %	25 %	50 %	33595244
15495	NC_002928	GCG	2	6	571490	571495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595244
15496	NC_002928	CGG	2	6	571541	571546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595244
15497	NC_002928	GGT	2	6	571592	571597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595244
15498	NC_002928	GGC	2	6	571658	571663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595244
15499	NC_002928	GCCGGC	2	12	571667	571678	0 %	0 %	50 %	50 %	33595244
15500	NC_002928	CTG	2	6	571746	571751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595244

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