MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 137474

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13004	NC_002928	GGC	2	6	471577	471582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595155
13005	NC_002928	CGCC	2	8	471600	471607	0 %	0 %	25 %	75 %	33595155
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13009	NC_002928	GC	3	6	471708	471713	0 %	0 %	50 %	50 %	33595155
13010	NC_002928	GC	3	6	471747	471752	0 %	0 %	50 %	50 %	33595155
13011	NC_002928	TGC	2	6	471759	471764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595155
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13015	NC_002928	CCG	2	6	471947	471952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595156
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13017	NC_002928	GCC	2	6	471982	471987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595156
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13239	NC_002928	AGGCA	2	10	480279	480288	40 %	0 %	40 %	20 %	33595160
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13243	NC_002928	GC	3	6	480403	480408	0 %	0 %	50 %	50 %	33595160
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13245	NC_002928	CAAG	2	8	480479	480486	50 %	0 %	25 %	25 %	33595160
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13324	NC_002928	GTCG	2	8	483293	483300	0 %	25 %	50 %	25 %	33595160
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13333	NC_002928	CTG	2	6	483657	483662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595161
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13347	NC_002928	TAT	2	6	484196	484201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13353	NC_002928	GC	3	6	484474	484479	0 %	0 %	50 %	50 %	33595162
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13357	NC_002928	GCT	2	6	484582	484587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595162
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13363	NC_002928	TGA	2	6	484914	484919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595162
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13370	NC_002928	AGGCCA	2	12	485166	485177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595162
13371	NC_002928	GGC	2	6	485188	485193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595162
13372	NC_002928	TCG	2	6	485256	485261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595162
13373	NC_002928	GCC	2	6	485324	485329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595163
13374	NC_002928	TGG	2	6	485340	485345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595163
13375	NC_002928	CAT	2	6	485348	485353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595163
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13378	NC_002928	GCG	2	6	485441	485446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595163
13379	NC_002928	GCC	2	6	485451	485456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595163
13380	NC_002928	GCT	2	6	485498	485503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595163
13381	NC_002928	CTGC	2	8	485531	485538	0 %	25 %	25 %	50 %	33595163
13382	NC_002928	CGCGG	2	10	485543	485552	0 %	0 %	60 %	40 %	33595163
13383	NC_002928	GC	3	6	485592	485597	0 %	0 %	50 %	50 %	33595163
13384	NC_002928	GC	3	6	485661	485666	0 %	0 %	50 %	50 %	33595163
13385	NC_002928	GCG	2	6	485688	485693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595163
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13389	NC_002928	TGC	2	6	485770	485775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595163
13390	NC_002928	TGC	2	6	485798	485803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595163
13391	NC_002928	CGA	2	6	485819	485824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595163
13392	NC_002928	GCC	2	6	485826	485831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595163
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13394	NC_002928	CTG	2	6	485886	485891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595163
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13397	NC_002928	CGG	2	6	486029	486034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595163
13398	NC_002928	CAT	2	6	486038	486043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595163
13399	NC_002928	CCGG	2	8	486059	486066	0 %	0 %	50 %	50 %	33595163
13400	NC_002928	ATGCTG	2	12	486105	486116	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	33595163
13401	NC_002928	TGC	2	6	486127	486132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595163
13402	NC_002928	CAT	2	6	486167	486172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595163
13403	NC_002928	GGTC	2	8	486289	486296	0 %	25 %	50 %	25 %	33595163
13404	NC_002928	TCG	2	6	486304	486309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595163
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13407	NC_002928	CGA	2	6	486380	486385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595163
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13411	NC_002928	GGCT	2	8	486501	486508	0 %	25 %	50 %	25 %	33595163
13412	NC_002928	GAC	2	6	486537	486542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595163
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13414	NC_002928	CG	3	6	486607	486612	0 %	0 %	50 %	50 %	33595163
13415	NC_002928	AGC	2	6	486631	486636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595163
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13417	NC_002928	CAG	2	6	486687	486692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595163
13418	NC_002928	GTG	2	6	486755	486760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595163
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13423	NC_002928	CGG	2	6	486936	486941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595164
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13432	NC_002928	ACG	2	6	487193	487198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595164
13433	NC_002928	CGGC	2	8	487266	487273	0 %	0 %	50 %	50 %	33595164
13434	NC_002928	TCG	2	6	487288	487293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595164
13435	NC_002928	GCT	2	6	487338	487343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595164
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13437	NC_002928	CGA	2	6	487446	487451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595164
13438	NC_002928	TGA	2	6	487478	487483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595164
13439	NC_002928	GC	3	6	487492	487497	0 %	0 %	50 %	50 %	33595164
13440	NC_002928	CGC	2	6	487527	487532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595164
13441	NC_002928	TCG	2	6	487562	487567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595164
13442	NC_002928	GCC	2	6	487582	487587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595164
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13446	NC_002928	TGC	2	6	487738	487743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595165
13447	NC_002928	GCTGCA	2	12	487760	487771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33595165
13448	NC_002928	CGGC	2	8	487825	487832	0 %	0 %	50 %	50 %	33595165
13449	NC_002928	GAC	2	6	487866	487871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595165
13450	NC_002928	GCG	2	6	487886	487891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595165
13451	NC_002928	TCG	2	6	487954	487959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595165
13452	NC_002928	GCG	2	6	487981	487986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595165
13453	NC_002928	GC	4	8	488118	488125	0 %	0 %	50 %	50 %	33595165
13454	NC_002928	TGC	2	6	488137	488142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595165
13455	NC_002928	TCG	2	6	488194	488199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595165
13456	NC_002928	GC	3	6	488241	488246	0 %	0 %	50 %	50 %	33595165
13457	NC_002928	AAGCA	2	10	488283	488292	60 %	0 %	20 %	20 %	33595165
13458	NC_002928	ACC	2	6	488317	488322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33595165
13459	NC_002928	CGCCGT	2	12	488375	488386	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	33595165
13460	NC_002928	CGG	2	6	488409	488414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13461	NC_002928	TCAC	2	8	488429	488436	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13462	NC_002928	ATCA	2	8	488446	488453	50 %	25 %	0 %	25 %	33595166
13463	NC_002928	CTGGA	2	10	488456	488465	20 %	20 %	40 %	20 %	33595166
13464	NC_002928	TGA	2	6	488484	488489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595166
13465	NC_002928	CGG	2	6	488550	488555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595166
13466	NC_002928	CG	3	6	488589	488594	0 %	0 %	50 %	50 %	33595166
13467	NC_002928	CAC	2	6	488620	488625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33595166
13468	NC_002928	GGC	2	6	488659	488664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595166
13469	NC_002928	CCA	2	6	488679	488684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33595166
13470	NC_002928	CGTGGC	2	12	488710	488721	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33595166
13471	NC_002928	CGC	2	6	488776	488781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595166
13472	NC_002928	CCG	2	6	488789	488794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13473	NC_002928	TGC	2	6	488861	488866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595167
13474	NC_002928	GCT	2	6	488873	488878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595167
13475	NC_002928	GC	3	6	488879	488884	0 %	0 %	50 %	50 %	33595167
13476	NC_002928	CGCCGG	2	12	488901	488912	0 %	0 %	50 %	50 %	33595167
13477	NC_002928	GGCC	3	12	488918	488929	0 %	0 %	50 %	50 %	33595167
13478	NC_002928	CCGG	2	8	488953	488960	0 %	0 %	50 %	50 %	33595167
13479	NC_002928	CGT	2	6	489024	489029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595167
13480	NC_002928	GCGG	2	8	489049	489056	0 %	0 %	75 %	25 %	33595167
13481	NC_002928	CGC	2	6	489069	489074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595167
13482	NC_002928	CGCGC	2	10	489082	489091	0 %	0 %	40 %	60 %	33595167
13483	NC_002928	TGG	2	6	489224	489229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595167
13484	NC_002928	AAG	2	6	489283	489288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33595167
13485	NC_002928	GCA	2	6	489293	489298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595167
13486	NC_002928	CGGC	2	8	489311	489318	0 %	0 %	50 %	50 %	33595167
13487	NC_002928	ACCA	2	8	489328	489335	50 %	0 %	0 %	50 %	33595167
13488	NC_002928	GCT	2	6	489348	489353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595167
13489	NC_002928	AGC	2	6	489356	489361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595167
13490	NC_002928	GC	4	8	489495	489502	0 %	0 %	50 %	50 %	33595167
13491	NC_002928	CCA	2	6	489548	489553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33595167
13492	NC_002928	TGG	2	6	489601	489606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595167
13493	NC_002928	CAT	2	6	489609	489614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595167
13494	NC_002928	GCCG	2	8	489630	489637	0 %	0 %	50 %	50 %	33595167
13495	NC_002928	GCG	2	6	489658	489663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595167
13496	NC_002928	CAA	2	6	489666	489671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33595167
13497	NC_002928	CGA	2	6	489765	489770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595167
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13499	NC_002928	GC	4	8	489827	489834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13500	NC_002928	GC	5	10	489843	489852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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