MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 137474

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_002928	TGC	2	6	454702	454707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595141
12502	NC_002928	GCCAC	2	10	454742	454751	20 %	0 %	20 %	60 %	33595141
12503	NC_002928	GCG	4	12	454754	454765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595141
12504	NC_002928	GCG	2	6	454771	454776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595141
12505	NC_002928	GCA	2	6	454796	454801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595141
12506	NC_002928	CTG	2	6	454824	454829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595141
12507	NC_002928	GC	3	6	454849	454854	0 %	0 %	50 %	50 %	33595141
12508	NC_002928	GTC	2	6	454869	454874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595141
12509	NC_002928	GCC	2	6	454882	454887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595141
12510	NC_002928	GCG	2	6	454891	454896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595141
12511	NC_002928	CTG	2	6	454902	454907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595141
12512	NC_002928	GGCC	2	8	454910	454917	0 %	0 %	50 %	50 %	33595141
12513	NC_002928	GGCG	2	8	454931	454938	0 %	0 %	75 %	25 %	33595141
12514	NC_002928	GGC	2	6	454995	455000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595141
12515	NC_002928	CGG	2	6	455009	455014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595141
12516	NC_002928	GGGC	2	8	455018	455025	0 %	0 %	75 %	25 %	33595141
12517	NC_002928	CCG	2	6	455083	455088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595141
12518	NC_002928	GCC	2	6	455107	455112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595141
12519	NC_002928	GCC	2	6	455128	455133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595141
12520	NC_002928	GAA	2	6	455157	455162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33595141
12521	NC_002928	GGCGG	2	10	455165	455174	0 %	0 %	80 %	20 %	33595141
12522	NC_002928	CGC	2	6	455181	455186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595141
12523	NC_002928	GGTG	3	12	455190	455201	0 %	25 %	75 %	0 %	33595141
12524	NC_002928	GCC	3	9	455444	455452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595142
12525	NC_002928	G	6	6	455486	455491	0 %	0 %	100 %	0 %	33595142
12526	NC_002928	GCC	3	9	455506	455514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595142
12527	NC_002928	GC	3	6	455517	455522	0 %	0 %	50 %	50 %	33595142
12528	NC_002928	CGG	2	6	455535	455540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595142
12529	NC_002928	GC	3	6	455546	455551	0 %	0 %	50 %	50 %	33595142
12530	NC_002928	CG	4	8	455665	455672	0 %	0 %	50 %	50 %	33595142
12531	NC_002928	GCG	2	6	455687	455692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595142
12532	NC_002928	CCTGGG	2	12	455694	455705	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33595142
12533	NC_002928	TCC	2	6	455741	455746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33595142
12534	NC_002928	TCT	2	6	455792	455797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33595142
12535	NC_002928	GGCGCG	2	12	455806	455817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595142
12536	NC_002928	CTGGC	2	10	455825	455834	0 %	20 %	40 %	40 %	33595142
12537	NC_002928	GCCG	2	8	455835	455842	0 %	0 %	50 %	50 %	33595142
12538	NC_002928	CCA	2	6	455874	455879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33595142
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12540	NC_002928	CGC	2	6	455947	455952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595142
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12542	NC_002928	CGC	2	6	455980	455985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595142
12543	NC_002928	CCGCG	2	10	455986	455995	0 %	0 %	40 %	60 %	33595142
12544	NC_002928	GC	3	6	456023	456028	0 %	0 %	50 %	50 %	33595142
12545	NC_002928	CGG	3	9	456030	456038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595142
12546	NC_002928	CAG	2	6	456058	456063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595142
12547	NC_002928	CG	3	6	456099	456104	0 %	0 %	50 %	50 %	33595142
12548	NC_002928	CGGC	2	8	456132	456139	0 %	0 %	50 %	50 %	33595142
12549	NC_002928	CAG	2	6	456148	456153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595142
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12551	NC_002928	CGG	2	6	456182	456187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595142
12552	NC_002928	GGCGCG	2	12	456229	456240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595142
12553	NC_002928	CGT	2	6	456270	456275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595142
12554	NC_002928	GCG	2	6	456277	456282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595142
12555	NC_002928	CGC	2	6	456303	456308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595142
12556	NC_002928	CAG	2	6	456397	456402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595142
12557	NC_002928	TGC	2	6	456428	456433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595142
12558	NC_002928	CGG	2	6	456438	456443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595142
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12560	NC_002928	CG	3	6	456606	456611	0 %	0 %	50 %	50 %	33595142
12561	NC_002928	GC	3	6	456616	456621	0 %	0 %	50 %	50 %	33595142
12562	NC_002928	GC	4	8	456644	456651	0 %	0 %	50 %	50 %	33595142
12563	NC_002928	GCCGC	2	10	456660	456669	0 %	0 %	40 %	60 %	33595142
12564	NC_002928	GCC	2	6	456671	456676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595142
12565	NC_002928	GC	3	6	456692	456697	0 %	0 %	50 %	50 %	33595142
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12570	NC_002928	GGC	3	9	456817	456825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595142
12571	NC_002928	GCC	2	6	456836	456841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595142
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12575	NC_002928	GCG	2	6	456974	456979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595143
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12578	NC_002928	GC	4	8	457031	457038	0 %	0 %	50 %	50 %	33595143
12579	NC_002928	AGC	2	6	457039	457044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595143
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12582	NC_002928	CGGCGC	2	12	457133	457144	0 %	0 %	50 %	50 %	33595143
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12586	NC_002928	GGCT	2	8	457220	457227	0 %	25 %	50 %	25 %	33595143
12587	NC_002928	GCC	2	6	457234	457239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595143
12588	NC_002928	CG	3	6	457241	457246	0 %	0 %	50 %	50 %	33595143
12589	NC_002928	CAGCTC	2	12	457260	457271	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	33595143
12590	NC_002928	TGT	3	9	457349	457357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33595143
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12592	NC_002928	CAG	2	6	457473	457478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595143
12593	NC_002928	CTG	2	6	457524	457529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595143
12594	NC_002928	AGGTC	2	10	457532	457541	20 %	20 %	40 %	20 %	33595143
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12596	NC_002928	GCC	2	6	457579	457584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595143
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12601	NC_002928	GTC	2	6	457770	457775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595143
12602	NC_002928	GC	4	8	457805	457812	0 %	0 %	50 %	50 %	33595143
12603	NC_002928	GCT	2	6	457910	457915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595143
12604	NC_002928	GGTCCA	2	12	457928	457939	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33595143
12605	NC_002928	GCC	2	6	458002	458007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595143
12606	NC_002928	GCC	2	6	458026	458031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595143
12607	NC_002928	GCGCG	2	10	458054	458063	0 %	0 %	60 %	40 %	33595143
12608	NC_002928	TCC	2	6	458065	458070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33595143
12609	NC_002928	GCC	2	6	458085	458090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595143
12610	NC_002928	CGG	3	9	458112	458120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595143
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12612	NC_002928	GCC	2	6	458197	458202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595143
12613	NC_002928	TCG	2	6	458212	458217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595143
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12617	NC_002928	GCG	2	6	458508	458513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595143
12618	NC_002928	CGC	2	6	458519	458524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595143
12619	NC_002928	GC	3	6	458551	458556	0 %	0 %	50 %	50 %	33595143
12620	NC_002928	GAA	2	6	458580	458585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33595143
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12622	NC_002928	CAGC	2	8	458592	458599	25 %	0 %	25 %	50 %	33595143
12623	NC_002928	CG	3	6	458609	458614	0 %	0 %	50 %	50 %	33595143
12624	NC_002928	GTG	2	6	458634	458639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33595143
12625	NC_002928	AGC	2	6	458647	458652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595143
12626	NC_002928	GCGATG	2	12	458800	458811	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	33595143
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12701	NC_002928	AGCGC	2	10	461379	461388	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12702	NC_002928	GACG	2	8	461400	461407	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12703	NC_002928	CGG	2	6	461418	461423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12705	NC_002928	TGTT	2	8	461490	461497	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12706	NC_002928	CA	3	6	461539	461544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12708	NC_002928	GCC	2	6	461626	461631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595145
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12713	NC_002928	CTA	2	6	461754	461759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595145
12714	NC_002928	CGC	2	6	461817	461822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595145
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12737	NC_002928	AG	3	6	462775	462780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12738	NC_002928	GCTG	2	8	462831	462838	0 %	25 %	50 %	25 %	33595146
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12854	NC_002928	CGG	2	6	466516	466521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12856	NC_002928	GCGCC	2	10	466582	466591	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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12993	NC_002928	GCC	2	6	471198	471203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595155
12994	NC_002928	CGC	2	6	471223	471228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595155
12995	NC_002928	GCC	2	6	471243	471248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595155
12996	NC_002928	GACGCC	2	12	471344	471355	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33595155
12997	NC_002928	GCTG	2	8	471420	471427	0 %	25 %	50 %	25 %	33595155
12998	NC_002928	CG	3	6	471465	471470	0 %	0 %	50 %	50 %	33595155
12999	NC_002928	CG	3	6	471474	471479	0 %	0 %	50 %	50 %	33595155
13000	NC_002928	CAT	2	6	471488	471493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595155

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