MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 153496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31503	NC_002927	CGA	2	6	1121730	1121735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33600028
31504	NC_002927	GC	3	6	1121785	1121790	0 %	0 %	50 %	50 %	33600028
31505	NC_002927	GCC	2	6	1121809	1121814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33600028
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31509	NC_002927	GC	3	6	1121889	1121894	0 %	0 %	50 %	50 %	33600028
31510	NC_002927	AGGGCG	2	12	1122056	1122067	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	33600028
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31604	NC_002927	G	6	6	1125270	1125275	0 %	0 %	100 %	0 %	33600031
31605	NC_002927	GC	5	10	1125297	1125306	0 %	0 %	50 %	50 %	33600031
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31612	NC_002927	CCCGG	2	10	1125532	1125541	0 %	0 %	40 %	60 %	33600031
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31668	NC_002927	TCGA	2	8	1127273	1127280	25 %	25 %	25 %	25 %	33600032
31669	NC_002927	TTC	2	6	1127321	1127326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33600032
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31710	NC_002927	CGG	2	6	1128785	1128790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33600033
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31716	NC_002927	GCAC	2	8	1129034	1129041	25 %	0 %	25 %	50 %	33600034
31717	NC_002927	ATG	2	6	1129048	1129053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33600034
31718	NC_002927	CGC	2	6	1129062	1129067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33600034
31719	NC_002927	GTG	2	6	1129135	1129140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33600034
31720	NC_002927	GGA	2	6	1129179	1129184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33600034
31721	NC_002927	GC	3	6	1129212	1129217	0 %	0 %	50 %	50 %	33600034
31722	NC_002927	GCC	2	6	1129223	1129228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33600034
31723	NC_002927	GAG	2	6	1129246	1129251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33600034
31724	NC_002927	CGC	4	12	1129266	1129277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33600034
31725	NC_002927	CG	3	6	1129281	1129286	0 %	0 %	50 %	50 %	33600034
31726	NC_002927	TCG	2	6	1129301	1129306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33600034
31727	NC_002927	CG	3	6	1129311	1129316	0 %	0 %	50 %	50 %	33600034
31728	NC_002927	GGGCCA	2	12	1129335	1129346	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	33600034
31729	NC_002927	GGCCT	2	10	1129366	1129375	0 %	20 %	40 %	40 %	33600034
31730	NC_002927	AGA	2	6	1129418	1129423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33600034
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31732	NC_002927	TCG	2	6	1129445	1129450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33600034
31733	NC_002927	CTGGTG	2	12	1129474	1129485	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	33600034
31734	NC_002927	CGC	2	6	1129521	1129526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33600034
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31736	NC_002927	ATC	2	6	1129666	1129671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33600034
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31980	NC_002927	GGGC	2	8	1137975	1137982	0 %	0 %	75 %	25 %	33600041
31981	NC_002927	CAT	2	6	1138005	1138010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33600041
31982	NC_002927	GC	3	6	1138045	1138050	0 %	0 %	50 %	50 %	33600041
31983	NC_002927	CGGCG	2	10	1138110	1138119	0 %	0 %	60 %	40 %	33600041
31984	NC_002927	GTG	2	6	1138141	1138146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33600041
31985	NC_002927	TCG	2	6	1138238	1138243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33600041
31986	NC_002927	GGC	2	6	1138354	1138359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33600041
31987	NC_002927	GGC	2	6	1138393	1138398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33600041
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31992	NC_002927	CG	4	8	1138639	1138646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31993	NC_002927	GC	3	6	1138657	1138662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31994	NC_002927	CG	3	6	1138667	1138672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31995	NC_002927	TCG	2	6	1138687	1138692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33600042
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32000	NC_002927	GTC	2	6	1138905	1138910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33600042

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