MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 153496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_002927	AAC	2	6	548506	548511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33599509
15002	NC_002927	TGA	2	6	548544	548549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599509
15003	NC_002927	GTG	2	6	548628	548633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599509
15004	NC_002927	GCG	2	6	548688	548693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15005	NC_002927	GAA	2	6	548709	548714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33599510
15006	NC_002927	TTC	2	6	548744	548749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33599510
15007	NC_002927	TGA	2	6	548768	548773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599510
15008	NC_002927	ACCT	2	8	548779	548786	25 %	25 %	0 %	50 %	33599510
15009	NC_002927	TCTG	2	8	548795	548802	0 %	50 %	25 %	25 %	33599510
15010	NC_002927	GA	3	6	548810	548815	50 %	0 %	50 %	0 %	33599510
15011	NC_002927	AGCA	2	8	548840	548847	50 %	0 %	25 %	25 %	33599510
15012	NC_002927	AACC	2	8	548925	548932	50 %	0 %	0 %	50 %	33599510
15013	NC_002927	AGA	2	6	548974	548979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33599510
15014	NC_002927	TGGC	2	8	549007	549014	0 %	25 %	50 %	25 %	33599510
15015	NC_002927	ATC	2	6	549109	549114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599510
15016	NC_002927	TAA	2	6	549216	549221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33599510
15017	NC_002927	AATTT	2	10	549246	549255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_002927	TGA	2	6	549383	549388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599511
15019	NC_002927	TTTA	2	8	549444	549451	25 %	75 %	0 %	0 %	33599511
15020	NC_002927	GCGG	2	8	549475	549482	0 %	0 %	75 %	25 %	33599511
15021	NC_002927	CAA	2	6	549490	549495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33599511
15022	NC_002927	CG	4	8	549509	549516	0 %	0 %	50 %	50 %	33599511
15023	NC_002927	CCGTG	2	10	549522	549531	0 %	20 %	40 %	40 %	33599511
15024	NC_002927	CGA	2	6	549664	549669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599511
15025	NC_002927	CAT	4	12	549726	549737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599511
15026	NC_002927	CTG	2	6	549808	549813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599511
15027	NC_002927	T	6	6	549820	549825	0 %	100 %	0 %	0 %	33599511
15028	NC_002927	AAG	2	6	549887	549892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33599511
15029	NC_002927	TATCGC	2	12	549927	549938	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	33599511
15030	NC_002927	TTTG	2	8	549942	549949	0 %	75 %	25 %	0 %	33599511
15031	NC_002927	CGT	2	6	549993	549998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599511
15032	NC_002927	ATC	2	6	550096	550101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599511
15033	NC_002927	GTT	2	6	550111	550116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33599511
15034	NC_002927	T	6	6	550115	550120	0 %	100 %	0 %	0 %	33599511
15035	NC_002927	CAA	2	6	550132	550137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33599511
15036	NC_002927	TCT	2	6	550192	550197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33599511
15037	NC_002927	ATG	2	6	550228	550233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599511
15038	NC_002927	TCA	2	6	550355	550360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599511
15039	NC_002927	TCA	2	6	550379	550384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599511
15040	NC_002927	CAATGA	2	12	550418	550429	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	33599511
15041	NC_002927	AT	3	6	550515	550520	50 %	50 %	0 %	0 %	33599511
15042	NC_002927	AGATG	2	10	550538	550547	40 %	20 %	40 %	0 %	33599511
15043	NC_002927	GCA	2	6	550576	550581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599512
15044	NC_002927	ATT	2	6	550594	550599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33599512
15045	NC_002927	AGC	2	6	550630	550635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599512
15046	NC_002927	GAA	2	6	550640	550645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33599512
15047	NC_002927	TGG	2	6	550965	550970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599512
15048	NC_002927	G	6	6	551029	551034	0 %	0 %	100 %	0 %	33599512
15049	NC_002927	GC	4	8	551039	551046	0 %	0 %	50 %	50 %	33599512
15050	NC_002927	CGC	2	6	551124	551129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599512
15051	NC_002927	CAA	2	6	551143	551148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33599512
15052	NC_002927	TAAAGA	2	12	551206	551217	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	33599512
15053	NC_002927	CGG	2	6	551233	551238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599512
15054	NC_002927	TTC	2	6	551281	551286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33599512
15055	NC_002927	GAT	2	6	551297	551302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599512
15056	NC_002927	GCG	2	6	551375	551380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599512
15057	NC_002927	AT	3	6	551415	551420	50 %	50 %	0 %	0 %	33599512
15058	NC_002927	ACAGG	2	10	551431	551440	40 %	0 %	40 %	20 %	33599512
15059	NC_002927	T	6	6	551462	551467	0 %	100 %	0 %	0 %	33599512
15060	NC_002927	ATG	2	6	551496	551501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599512
15061	NC_002927	TA	3	6	551529	551534	50 %	50 %	0 %	0 %	33599512
15062	NC_002927	CCG	2	6	551546	551551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599512
15063	NC_002927	TGG	2	6	551553	551558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599512
15064	NC_002927	TGA	2	6	551577	551582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599512
15065	NC_002927	TTTG	2	8	551624	551631	0 %	75 %	25 %	0 %	33599512
15066	NC_002927	T	6	6	551681	551686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15067	NC_002927	A	6	6	551699	551704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15068	NC_002927	TAA	2	6	551718	551723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_002927	GAA	2	6	551763	551768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33599513
15070	NC_002927	TTC	2	6	551847	551852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33599513
15071	NC_002927	A	7	7	551907	551913	100 %	0 %	0 %	0 %	33599513
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15073	NC_002927	GTC	2	6	552024	552029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599513
15074	NC_002927	TAAT	2	8	552044	552051	50 %	50 %	0 %	0 %	33599513
15075	NC_002927	TG	3	6	552164	552169	0 %	50 %	50 %	0 %	33599514
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15078	NC_002927	TGG	2	6	552310	552315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599514
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15080	NC_002927	GT	3	6	552445	552450	0 %	50 %	50 %	0 %	33599514
15081	NC_002927	GCG	2	6	552501	552506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599514
15082	NC_002927	ACGT	2	8	552513	552520	25 %	25 %	25 %	25 %	33599514
15083	NC_002927	GGCC	2	8	552649	552656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15084	NC_002927	GCG	2	6	552731	552736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599515
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15089	NC_002927	AAT	2	6	552950	552955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33599515
15090	NC_002927	GCT	2	6	553075	553080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599515
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15093	NC_002927	AAAG	2	8	553148	553155	75 %	0 %	25 %	0 %	33599515
15094	NC_002927	GGCA	2	8	553222	553229	25 %	0 %	50 %	25 %	33599515
15095	NC_002927	TGC	2	6	553236	553241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599515
15096	NC_002927	CTG	2	6	553280	553285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599515
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15099	NC_002927	ATG	3	9	553434	553442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599515
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15101	NC_002927	CAG	2	6	553467	553472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599515
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15104	NC_002927	TCC	2	6	553925	553930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15105	NC_002927	GCA	2	6	553971	553976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15106	NC_002927	CTG	2	6	554023	554028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599516
15107	NC_002927	TGG	2	6	554040	554045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599516
15108	NC_002927	CTGG	2	8	554085	554092	0 %	25 %	50 %	25 %	33599516
15109	NC_002927	GTCGGT	2	12	554117	554128	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	33599516
15110	NC_002927	CGT	2	6	554264	554269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599516
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15112	NC_002927	TCG	2	6	554292	554297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599516
15113	NC_002927	CGA	2	6	554322	554327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599516
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15115	NC_002927	GCT	2	6	554404	554409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599516
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15118	NC_002927	CG	3	6	554516	554521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15119	NC_002927	AG	4	8	554523	554530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_002927	AGC	2	6	554554	554559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599517
15121	NC_002927	CATC	2	8	554570	554577	25 %	25 %	0 %	50 %	33599517
15122	NC_002927	GCC	2	6	554593	554598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599517
15123	NC_002927	GTC	2	6	554604	554609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599517
15124	NC_002927	GC	3	6	554620	554625	0 %	0 %	50 %	50 %	33599517
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15147	NC_002927	GCC	2	6	555854	555859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599518
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15154	NC_002927	CG	3	6	556127	556132	0 %	0 %	50 %	50 %	33599518
15155	NC_002927	GGA	2	6	556152	556157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33599518
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15228	NC_002927	GC	3	6	558571	558576	0 %	0 %	50 %	50 %	33599521
15229	NC_002927	ATG	2	6	558597	558602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599521
15230	NC_002927	G	6	6	558602	558607	0 %	0 %	100 %	0 %	33599522
15231	NC_002927	TTGA	2	8	558624	558631	25 %	50 %	25 %	0 %	33599522
15232	NC_002927	GGTC	2	8	558642	558649	0 %	25 %	50 %	25 %	33599522
15233	NC_002927	GTC	2	6	558657	558662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599522
15234	NC_002927	TGA	2	6	558667	558672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599522
15235	NC_002927	GGT	2	6	558689	558694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599522
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15237	NC_002927	CGG	2	6	558722	558727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599522
15238	NC_002927	AAC	2	6	558747	558752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33599522
15239	NC_002927	TTC	2	6	558772	558777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33599522
15240	NC_002927	GC	3	6	558791	558796	0 %	0 %	50 %	50 %	33599522
15241	NC_002927	CAT	2	6	558827	558832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599522
15242	NC_002927	GCG	2	6	558907	558912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599522
15243	NC_002927	AGC	3	9	558985	558993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599522
15244	NC_002927	CG	4	8	559004	559011	0 %	0 %	50 %	50 %	33599522
15245	NC_002927	CAT	2	6	559025	559030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599522
15246	NC_002927	GCGTGG	2	12	559042	559053	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	33599522
15247	NC_002927	TGG	2	6	559096	559101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599522
15248	NC_002927	TCA	2	6	559132	559137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599522
15249	NC_002927	GAT	2	6	559163	559168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599522
15250	NC_002927	TCG	2	6	559249	559254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599522
15251	NC_002927	CGA	2	6	559265	559270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599522
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15253	NC_002927	GC	3	6	559331	559336	0 %	0 %	50 %	50 %	33599522
15254	NC_002927	GC	3	6	559343	559348	0 %	0 %	50 %	50 %	33599522
15255	NC_002927	GGC	2	6	559352	559357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599522
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15260	NC_002927	GGC	3	9	559584	559592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599522
15261	NC_002927	CGC	2	6	559601	559606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599522
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15277	NC_002927	GC	4	8	560186	560193	0 %	0 %	50 %	50 %	33599522
15278	NC_002927	GTC	2	6	560199	560204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599522
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15291	NC_002927	GC	3	6	560736	560741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15292	NC_002927	CGG	2	6	560856	560861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599523
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15307	NC_002927	GC	4	8	561533	561540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15339	NC_002927	CGGG	2	8	562570	562577	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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15348	NC_002927	GC	3	6	562867	562872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15349	NC_002927	ATG	2	6	562887	562892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15350	NC_002927	ATTG	2	8	562894	562901	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15351	NC_002927	GGCA	2	8	562925	562932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15352	NC_002927	AAT	2	6	562949	562954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15353	NC_002927	TGTTT	2	10	562992	563001	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15354	NC_002927	T	6	6	562999	563004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15355	NC_002927	TGG	2	6	563050	563055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599525
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15359	NC_002927	GCTGGC	2	12	563159	563170	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33599525
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15365	NC_002927	CCCAAT	2	12	563601	563612	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	33599525
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15367	NC_002927	AAT	2	6	563678	563683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15491	NC_002927	GCG	2	6	568051	568056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599529
15492	NC_002927	GCATG	2	10	568057	568066	20 %	20 %	40 %	20 %	33599529
15493	NC_002927	CTG	2	6	568104	568109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599529
15494	NC_002927	TCGGCG	2	12	568111	568122	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33599529
15495	NC_002927	CGC	2	6	568145	568150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599529
15496	NC_002927	GCG	2	6	568166	568171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599529
15497	NC_002927	TGC	2	6	568255	568260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599529
15498	NC_002927	GAT	2	6	568265	568270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599529
15499	NC_002927	CG	3	6	568319	568324	0 %	0 %	50 %	50 %	33599529
15500	NC_002927	GGC	2	6	568329	568334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599529

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