MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 153496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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151002	NC_002927	CTA	2	6	5249142	5249147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33603912
151003	NC_002927	GCT	2	6	5249232	5249237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603912
151004	NC_002927	GCT	2	6	5249259	5249264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603912
151005	NC_002927	GGT	2	6	5249289	5249294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33603912
151006	NC_002927	CAC	2	6	5249323	5249328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33603912
151007	NC_002927	CGA	2	6	5249397	5249402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603912
151008	NC_002927	GC	3	6	5249419	5249424	0 %	0 %	50 %	50 %	33603912
151009	NC_002927	CTG	2	6	5249473	5249478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603912
151010	NC_002927	CCGGA	2	10	5249491	5249500	20 %	0 %	40 %	40 %	33603912
151011	NC_002927	CCA	2	6	5249519	5249524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33603913
151012	NC_002927	GCA	2	6	5249558	5249563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603913
151013	NC_002927	GGCC	2	8	5249580	5249587	0 %	0 %	50 %	50 %	33603913
151014	NC_002927	TCG	2	6	5249603	5249608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603913
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151016	NC_002927	TCG	2	6	5249651	5249656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603913
151017	NC_002927	ACGG	2	8	5249732	5249739	25 %	0 %	50 %	25 %	33603913
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151019	NC_002927	GACC	2	8	5249768	5249775	25 %	0 %	25 %	50 %	33603913
151020	NC_002927	CGC	2	6	5249789	5249794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603913
151021	NC_002927	GC	3	6	5249813	5249818	0 %	0 %	50 %	50 %	33603913
151022	NC_002927	GAC	2	6	5249833	5249838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603913
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151026	NC_002927	GCCG	2	8	5249925	5249932	0 %	0 %	50 %	50 %	33603913
151027	NC_002927	GCCG	2	8	5249952	5249959	0 %	0 %	50 %	50 %	33603913
151028	NC_002927	GC	3	6	5250031	5250036	0 %	0 %	50 %	50 %	33603913
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151033	NC_002927	GAC	2	6	5250130	5250135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603913
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151055	NC_002927	GC	4	8	5250984	5250991	0 %	0 %	50 %	50 %	33603915
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151113	NC_002927	GCA	2	6	5252972	5252977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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151117	NC_002927	GCG	2	6	5253155	5253160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603917
151118	NC_002927	TCG	2	6	5253193	5253198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603917
151119	NC_002927	TGC	2	6	5253208	5253213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603917
151120	NC_002927	CGA	2	6	5253236	5253241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603917
151121	NC_002927	ACGG	2	8	5253242	5253249	25 %	0 %	50 %	25 %	33603917
151122	NC_002927	GCA	2	6	5253260	5253265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603917
151123	NC_002927	CGGC	2	8	5253275	5253282	0 %	0 %	50 %	50 %	33603917
151124	NC_002927	TCG	2	6	5253286	5253291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603917
151125	NC_002927	CGAG	2	8	5253299	5253306	25 %	0 %	50 %	25 %	33603917
151126	NC_002927	CAGCGG	2	12	5253315	5253326	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	33603917
151127	NC_002927	GCA	2	6	5253377	5253382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603917
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151129	NC_002927	TCG	2	6	5253493	5253498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603917
151130	NC_002927	GCA	2	6	5253503	5253508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603917
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151133	NC_002927	GCC	2	6	5253633	5253638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603917
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151139	NC_002927	GTTC	2	8	5253803	5253810	0 %	50 %	25 %	25 %	33603917
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151142	NC_002927	CGA	2	6	5253863	5253868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603917
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151144	NC_002927	GCA	2	6	5253902	5253907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603917
151145	NC_002927	CCA	2	6	5253971	5253976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33603917
151146	NC_002927	TCA	2	6	5254083	5254088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151147	NC_002927	TTTACG	2	12	5254092	5254103	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
151148	NC_002927	CACG	2	8	5254170	5254177	25 %	0 %	25 %	50 %	33603918
151149	NC_002927	CG	3	6	5254245	5254250	0 %	0 %	50 %	50 %	33603918
151150	NC_002927	CG	4	8	5254253	5254260	0 %	0 %	50 %	50 %	33603918
151151	NC_002927	CAG	3	9	5254409	5254417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603918
151152	NC_002927	CAG	2	6	5254451	5254456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603918
151153	NC_002927	CTG	2	6	5254475	5254480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603918
151154	NC_002927	TTTACG	2	12	5254560	5254571	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
151155	NC_002927	CAT	2	6	5254592	5254597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151156	NC_002927	CGG	2	6	5254612	5254617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151157	NC_002927	ATG	2	6	5254621	5254626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151158	NC_002927	TGC	2	6	5254749	5254754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603919
151159	NC_002927	CG	3	6	5254796	5254801	0 %	0 %	50 %	50 %	33603919
151160	NC_002927	CGA	2	6	5254885	5254890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603919
151161	NC_002927	CGG	2	6	5254894	5254899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603919
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151185	NC_002927	AGCC	2	8	5255912	5255919	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151186	NC_002927	GCG	2	6	5255930	5255935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603920
151187	NC_002927	CCGCT	2	10	5255972	5255981	0 %	20 %	20 %	60 %	33603920
151188	NC_002927	GC	3	6	5256041	5256046	0 %	0 %	50 %	50 %	33603920
151189	NC_002927	GC	3	6	5256048	5256053	0 %	0 %	50 %	50 %	33603920
151190	NC_002927	TGGCA	2	10	5256079	5256088	20 %	20 %	40 %	20 %	33603920
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151192	NC_002927	TAC	2	6	5256118	5256123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33603920
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151195	NC_002927	CG	3	6	5256180	5256185	0 %	0 %	50 %	50 %	33603920
151196	NC_002927	CG	3	6	5256200	5256205	0 %	0 %	50 %	50 %	33603920
151197	NC_002927	GCG	2	6	5256217	5256222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603920
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151201	NC_002927	GCCA	2	8	5256384	5256391	25 %	0 %	25 %	50 %	33603920
151202	NC_002927	CGT	2	6	5256422	5256427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603920
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151206	NC_002927	CG	3	6	5256528	5256533	0 %	0 %	50 %	50 %	33603920
151207	NC_002927	CTG	2	6	5256535	5256540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603920
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151210	NC_002927	TCG	2	6	5256662	5256667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603920
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151214	NC_002927	GCT	3	9	5256750	5256758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603920
151215	NC_002927	CGA	2	6	5256765	5256770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603920
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151217	NC_002927	CTG	2	6	5256856	5256861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603920
151218	NC_002927	CAC	2	6	5256943	5256948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33603920
151219	NC_002927	CG	3	6	5256959	5256964	0 %	0 %	50 %	50 %	33603920
151220	NC_002927	CCACG	2	10	5257080	5257089	20 %	0 %	20 %	60 %	33603920
151221	NC_002927	GCG	2	6	5257092	5257097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603920
151222	NC_002927	C	6	6	5257190	5257195	0 %	0 %	0 %	100 %	33603920
151223	NC_002927	GAA	2	6	5257204	5257209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33603920
151224	NC_002927	GGT	2	6	5257254	5257259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33603920
151225	NC_002927	GCG	2	6	5257281	5257286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603920
151226	NC_002927	ATG	2	6	5257288	5257293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33603920
151227	NC_002927	GCT	2	6	5257329	5257334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603920
151228	NC_002927	CTACGA	2	12	5257452	5257463	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33603920
151229	NC_002927	CCG	2	6	5257504	5257509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603920
151230	NC_002927	GAA	2	6	5257519	5257524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33603920
151231	NC_002927	ATG	2	6	5257565	5257570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33603920
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151351	NC_002927	CG	4	8	5260956	5260963	0 %	0 %	50 %	50 %	33603923
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151448	NC_002927	GCCC	2	8	5264415	5264422	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
151449	NC_002927	GCC	3	9	5264492	5264500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603926
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151452	NC_002927	CG	3	6	5264588	5264593	0 %	0 %	50 %	50 %	33603926
151453	NC_002927	CGCCGG	2	12	5264647	5264658	0 %	0 %	50 %	50 %	33603926
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151467	NC_002927	GCT	2	6	5265241	5265246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603926
151468	NC_002927	GCC	2	6	5265249	5265254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603926
151469	NC_002927	GCG	2	6	5265306	5265311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603926
151470	NC_002927	ACC	2	6	5265326	5265331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33603926
151471	NC_002927	CCAG	2	8	5265342	5265349	25 %	0 %	25 %	50 %	33603926
151472	NC_002927	CGC	2	6	5265355	5265360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603926
151473	NC_002927	CGC	2	6	5265389	5265394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603926
151474	NC_002927	GC	3	6	5265399	5265404	0 %	0 %	50 %	50 %	33603926
151475	NC_002927	GCG	2	6	5265422	5265427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151476	NC_002927	GCG	2	6	5265457	5265462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603927
151477	NC_002927	ACC	2	6	5265499	5265504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33603927
151478	NC_002927	TCG	2	6	5265613	5265618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603927
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151480	NC_002927	CGG	2	6	5265660	5265665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603927
151481	NC_002927	ACG	2	6	5265706	5265711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603927
151482	NC_002927	CGGC	2	8	5265712	5265719	0 %	0 %	50 %	50 %	33603927
151483	NC_002927	TCA	2	6	5265731	5265736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33603927
151484	NC_002927	ATAC	2	8	5265746	5265753	50 %	25 %	0 %	25 %	33603927
151485	NC_002927	CGC	2	6	5265848	5265853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603927
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151487	NC_002927	GC	3	6	5265869	5265874	0 %	0 %	50 %	50 %	33603927
151488	NC_002927	TGCCCG	2	12	5265875	5265886	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	33603927
151489	NC_002927	CGG	2	6	5265914	5265919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603927
151490	NC_002927	GCC	2	6	5265940	5265945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603927
151491	NC_002927	GCG	2	6	5265946	5265951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603927
151492	NC_002927	CG	3	6	5265950	5265955	0 %	0 %	50 %	50 %	33603927
151493	NC_002927	TGC	2	6	5266000	5266005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603927
151494	NC_002927	GCC	2	6	5266029	5266034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603927
151495	NC_002927	CGC	3	9	5266047	5266055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603927
151496	NC_002927	GC	3	6	5266060	5266065	0 %	0 %	50 %	50 %	33603927
151497	NC_002927	CGCCAG	2	12	5266068	5266079	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33603927
151498	NC_002927	CAC	2	6	5266080	5266085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33603927
151499	NC_002927	GGTC	2	8	5266091	5266098	0 %	25 %	50 %	25 %	33603927
151500	NC_002927	CG	3	6	5266155	5266160	0 %	0 %	50 %	50 %	33603927

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