MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 153496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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150002	NC_002927	GGC	2	6	5214253	5214258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603880
150003	NC_002927	GCT	2	6	5214274	5214279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603880
150004	NC_002927	CGGC	2	8	5214291	5214298	0 %	0 %	50 %	50 %	33603880
150005	NC_002927	GC	3	6	5214329	5214334	0 %	0 %	50 %	50 %	33603880
150006	NC_002927	GGC	2	6	5214358	5214363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603880
150007	NC_002927	CGT	2	6	5214437	5214442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603881
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150009	NC_002927	GC	3	6	5214675	5214680	0 %	0 %	50 %	50 %	33603881
150010	NC_002927	CGC	2	6	5214684	5214689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603881
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150015	NC_002927	CGA	2	6	5214815	5214820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603881
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150045	NC_002927	CCCG	2	8	5215795	5215802	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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150115	NC_002927	TGG	2	6	5218329	5218334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33603883
150116	NC_002927	GCT	2	6	5218343	5218348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603883
150117	NC_002927	GGC	2	6	5218364	5218369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603883
150118	NC_002927	TCA	2	6	5218414	5218419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33603883
150119	NC_002927	GC	3	6	5218430	5218435	0 %	0 %	50 %	50 %	33603883
150120	NC_002927	TGC	2	6	5218450	5218455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603883
150121	NC_002927	TCA	2	6	5218465	5218470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33603883
150122	NC_002927	CG	4	8	5218475	5218482	0 %	0 %	50 %	50 %	33603883
150123	NC_002927	GAA	2	6	5218526	5218531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33603883
150124	NC_002927	GATCAC	2	12	5218547	5218558	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33603883
150125	NC_002927	CAT	2	6	5218577	5218582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33603883
150126	NC_002927	CAT	2	6	5218592	5218597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33603883
150127	NC_002927	CTG	2	6	5218632	5218637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603883
150128	NC_002927	TGG	2	6	5218657	5218662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33603883
150129	NC_002927	GCC	2	6	5218677	5218682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603883
150130	NC_002927	TCG	2	6	5218708	5218713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603883
150131	NC_002927	TCA	2	6	5218714	5218719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33603883
150132	NC_002927	TCG	2	6	5218726	5218731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603883
150133	NC_002927	GCAAA	2	10	5218769	5218778	60 %	0 %	20 %	20 %	33603883
150134	NC_002927	CAGCGA	2	12	5218827	5218838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603884
150135	NC_002927	CAT	2	6	5218872	5218877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33603884
150136	NC_002927	CGT	2	6	5218884	5218889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603884
150137	NC_002927	ATC	2	6	5218897	5218902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33603884
150138	NC_002927	GC	3	6	5218910	5218915	0 %	0 %	50 %	50 %	33603884
150139	NC_002927	GCC	2	6	5218918	5218923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603884
150140	NC_002927	C	6	6	5218922	5218927	0 %	0 %	0 %	100 %	33603884
150141	NC_002927	CAT	2	6	5218968	5218973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33603884
150142	NC_002927	CGC	2	6	5218985	5218990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603884
150143	NC_002927	CGA	2	6	5219034	5219039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603884
150144	NC_002927	CG	3	6	5219078	5219083	0 %	0 %	50 %	50 %	33603884
150145	NC_002927	GCT	2	6	5219088	5219093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603884
150146	NC_002927	GCGG	2	8	5219161	5219168	0 %	0 %	75 %	25 %	33603884
150147	NC_002927	CAT	3	9	5219181	5219189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33603884
150148	NC_002927	TGG	2	6	5219228	5219233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33603884
150149	NC_002927	GCT	2	6	5219235	5219240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603884
150150	NC_002927	GC	3	6	5219254	5219259	0 %	0 %	50 %	50 %	33603884
150151	NC_002927	CTG	2	6	5219263	5219268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603884
150152	NC_002927	CG	3	6	5219343	5219348	0 %	0 %	50 %	50 %	33603884
150153	NC_002927	CAA	2	6	5219379	5219384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33603884
150154	NC_002927	CG	3	6	5219400	5219405	0 %	0 %	50 %	50 %	33603884
150155	NC_002927	ATCGGC	2	12	5219410	5219421	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33603884
150156	NC_002927	GCC	2	6	5219438	5219443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603884
150157	NC_002927	CCA	2	6	5219483	5219488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33603884
150158	NC_002927	GCCATC	2	12	5219497	5219508	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	33603884
150159	NC_002927	GGCGTG	2	12	5219536	5219547	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	33603884
150160	NC_002927	TGG	2	6	5219614	5219619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33603884
150161	NC_002927	TGG	2	6	5219645	5219650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33603884
150162	NC_002927	CTG	2	6	5219671	5219676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603884
150163	NC_002927	TTG	2	6	5219732	5219737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33603885
150164	NC_002927	TGG	2	6	5219784	5219789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33603885
150165	NC_002927	TCGCTG	2	12	5219804	5219815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603885
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150169	NC_002927	TGGC	2	8	5219913	5219920	0 %	25 %	50 %	25 %	33603885
150170	NC_002927	CTG	2	6	5219930	5219935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603885
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150176	NC_002927	GC	3	6	5220112	5220117	0 %	0 %	50 %	50 %	33603885
150177	NC_002927	CTG	2	6	5220125	5220130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603885
150178	NC_002927	CGA	2	6	5220145	5220150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603885
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150182	NC_002927	CGA	2	6	5220256	5220261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603885
150183	NC_002927	ACC	2	6	5220266	5220271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33603885
150184	NC_002927	GAT	2	6	5220343	5220348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33603885
150185	NC_002927	CAT	2	6	5220349	5220354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33603885
150186	NC_002927	CACG	2	8	5220355	5220362	25 %	0 %	25 %	50 %	33603885
150187	NC_002927	ACCG	2	8	5220386	5220393	25 %	0 %	25 %	50 %	33603885
150188	NC_002927	ACC	2	6	5220462	5220467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33603885
150189	NC_002927	CCG	2	6	5220489	5220494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603885
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150192	NC_002927	CCAC	2	8	5220582	5220589	25 %	0 %	0 %	75 %	33603885
150193	NC_002927	GCG	2	6	5220601	5220606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603885
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150195	NC_002927	TGG	2	6	5220636	5220641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33603885
150196	NC_002927	TGC	2	6	5220669	5220674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603885
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150198	NC_002927	TGG	2	6	5220762	5220767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33603885
150199	NC_002927	CCAGAT	2	12	5220904	5220915	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33603885
150200	NC_002927	TCG	2	6	5220935	5220940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603885
150201	NC_002927	GCCGA	2	10	5220974	5220983	20 %	0 %	40 %	40 %	33603885
150202	NC_002927	AGGCG	2	10	5221006	5221015	20 %	0 %	60 %	20 %	33603885
150203	NC_002927	CGC	2	6	5221022	5221027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603885
150204	NC_002927	GTG	2	6	5221028	5221033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33603885
150205	NC_002927	CCG	2	6	5221068	5221073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603885
150206	NC_002927	CGG	2	6	5221099	5221104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603885
150207	NC_002927	CCAGCG	2	12	5221105	5221116	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33603885
150208	NC_002927	CG	5	10	5221126	5221135	0 %	0 %	50 %	50 %	33603885
150209	NC_002927	CGA	2	6	5221165	5221170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603885
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150211	NC_002927	TGC	2	6	5221314	5221319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603885
150212	NC_002927	CTG	2	6	5221328	5221333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603885
150213	NC_002927	CGG	2	6	5221338	5221343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603885
150214	NC_002927	GGCC	2	8	5221447	5221454	0 %	0 %	50 %	50 %	33603885
150215	NC_002927	GCC	2	6	5221472	5221477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603886
150216	NC_002927	CCG	2	6	5221479	5221484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603886
150217	NC_002927	CGC	2	6	5221492	5221497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603886
150218	NC_002927	GCC	2	6	5221511	5221516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603886
150219	NC_002927	GCC	2	6	5221520	5221525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603886
150220	NC_002927	CGC	2	6	5221537	5221542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603886
150221	NC_002927	CCG	2	6	5221548	5221553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603886
150222	NC_002927	GCC	2	6	5221559	5221564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603886
150223	NC_002927	CGC	2	6	5221576	5221581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603886
150224	NC_002927	GCC	3	9	5221583	5221591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603886
150225	NC_002927	CCACCT	2	12	5221596	5221607	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	33603886
150226	NC_002927	CCG	2	6	5221611	5221616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603886
150227	NC_002927	TGA	3	9	5221630	5221638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33603886
150228	NC_002927	CAG	2	6	5221655	5221660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603886
150229	NC_002927	CGG	2	6	5221675	5221680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603886
150230	NC_002927	CCACGC	2	12	5221702	5221713	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	33603886
150231	NC_002927	GCC	2	6	5221722	5221727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603886
150232	NC_002927	AGC	2	6	5221749	5221754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603886
150233	NC_002927	ACC	2	6	5221755	5221760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33603886
150234	NC_002927	CAGC	2	8	5221784	5221791	25 %	0 %	25 %	50 %	33603886
150235	NC_002927	TCG	2	6	5221818	5221823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603886
150236	NC_002927	GGC	2	6	5221832	5221837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603886
150237	NC_002927	GCG	2	6	5221840	5221845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603886
150238	NC_002927	CTC	2	6	5221850	5221855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33603886
150239	NC_002927	GC	3	6	5221917	5221922	0 %	0 %	50 %	50 %	33603886
150240	NC_002927	TGA	2	6	5221945	5221950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33603886
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150242	NC_002927	GC	3	6	5222011	5222016	0 %	0 %	50 %	50 %	33603886
150243	NC_002927	GTC	2	6	5222018	5222023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603886
150244	NC_002927	GC	3	6	5222088	5222093	0 %	0 %	50 %	50 %	33603886
150245	NC_002927	GC	3	6	5222152	5222157	0 %	0 %	50 %	50 %	33603886
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150251	NC_002927	GCC	2	6	5222370	5222375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603887
150252	NC_002927	GC	3	6	5222399	5222404	0 %	0 %	50 %	50 %	33603887
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150255	NC_002927	CTG	2	6	5222673	5222678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603887
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150262	NC_002927	CAG	2	6	5222940	5222945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603887
150263	NC_002927	ACA	2	6	5223011	5223016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150264	NC_002927	CTG	2	6	5223143	5223148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150265	NC_002927	TC	3	6	5223219	5223224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150266	NC_002927	GTT	2	6	5223252	5223257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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150302	NC_002927	C	6	6	5224534	5224539	0 %	0 %	0 %	100 %	33603888
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150329	NC_002927	GC	3	6	5225439	5225444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150330	NC_002927	AAG	2	6	5225476	5225481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33603890
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150336	NC_002927	CGT	2	6	5225617	5225622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603890
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150348	NC_002927	TCA	2	6	5225872	5225877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33603890
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150464	NC_002927	CGCC	2	8	5230068	5230075	0 %	0 %	25 %	75 %	33603894
150465	NC_002927	GGC	2	6	5230197	5230202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603894
150466	NC_002927	CGGC	2	8	5230232	5230239	0 %	0 %	50 %	50 %	33603894
150467	NC_002927	CCCGA	2	10	5230255	5230264	20 %	0 %	20 %	60 %	33603894
150468	NC_002927	CCAT	2	8	5230310	5230317	25 %	25 %	0 %	50 %	33603894
150469	NC_002927	GCCG	2	8	5230330	5230337	0 %	0 %	50 %	50 %	33603894
150470	NC_002927	GGC	2	6	5230383	5230388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603894
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150473	NC_002927	TGC	2	6	5230463	5230468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603894
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150476	NC_002927	GCC	2	6	5230655	5230660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603895
150477	NC_002927	CGGG	2	8	5230692	5230699	0 %	0 %	75 %	25 %	33603895
150478	NC_002927	CGAC	2	8	5230713	5230720	25 %	0 %	25 %	50 %	33603895
150479	NC_002927	GCCC	2	8	5230742	5230749	0 %	0 %	25 %	75 %	33603895
150480	NC_002927	GCA	2	6	5230780	5230785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603895
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150484	NC_002927	AGG	2	6	5231003	5231008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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150489	NC_002927	CGT	2	6	5231298	5231303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603896
150490	NC_002927	CG	4	8	5231304	5231311	0 %	0 %	50 %	50 %	33603896
150491	NC_002927	GCC	2	6	5231374	5231379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603896
150492	NC_002927	GAA	2	6	5231391	5231396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33603896
150493	NC_002927	CTG	2	6	5231400	5231405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603896
150494	NC_002927	GCT	2	6	5231450	5231455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603896
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150497	NC_002927	GCC	2	6	5231511	5231516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603896
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150499	NC_002927	ACG	2	6	5231572	5231577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603896
150500	NC_002927	GCC	2	6	5231647	5231652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603896

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