MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 153496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_002927	GCG	2	6	530774	530779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14502	NC_002927	CAC	2	6	530812	530817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14503	NC_002927	GGAA	2	8	530857	530864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_002927	T	6	6	530962	530967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_002927	ACC	2	6	530995	531000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33599492
14506	NC_002927	AGC	2	6	531044	531049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599492
14507	NC_002927	TGC	2	6	531050	531055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599492
14508	NC_002927	TGA	2	6	531059	531064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599492
14509	NC_002927	CT	4	8	531069	531076	0 %	50 %	0 %	50 %	33599492
14510	NC_002927	CAA	2	6	531081	531086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33599492
14511	NC_002927	GCC	2	6	531217	531222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599492
14512	NC_002927	CACGAT	2	12	531225	531236	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33599492
14513	NC_002927	CG	3	6	531260	531265	0 %	0 %	50 %	50 %	33599492
14514	NC_002927	CG	3	6	531308	531313	0 %	0 %	50 %	50 %	33599492
14515	NC_002927	GGGGT	2	10	531373	531382	0 %	20 %	80 %	0 %	33599492
14516	NC_002927	GCC	2	6	531425	531430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599492
14517	NC_002927	GGC	2	6	531441	531446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599492
14518	NC_002927	CGGA	2	8	531470	531477	25 %	0 %	50 %	25 %	33599492
14519	NC_002927	GCCG	2	8	531498	531505	0 %	0 %	50 %	50 %	33599492
14520	NC_002927	TGC	2	6	531533	531538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599492
14521	NC_002927	GC	3	6	531543	531548	0 %	0 %	50 %	50 %	33599492
14522	NC_002927	CGA	2	6	531549	531554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599492
14523	NC_002927	AGG	2	6	531638	531643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33599492
14524	NC_002927	CAA	2	6	531723	531728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33599492
14525	NC_002927	CGA	2	6	531741	531746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599492
14526	NC_002927	GCT	2	6	531843	531848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599492
14527	NC_002927	GC	3	6	531892	531897	0 %	0 %	50 %	50 %	33599492
14528	NC_002927	TCA	2	6	531929	531934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599492
14529	NC_002927	GAC	2	6	531937	531942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599492
14530	NC_002927	TGC	2	6	531953	531958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599492
14531	NC_002927	CGT	2	6	531959	531964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599492
14532	NC_002927	CGG	2	6	531995	532000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599492
14533	NC_002927	CG	3	6	532019	532024	0 %	0 %	50 %	50 %	33599492
14534	NC_002927	GCT	2	6	532089	532094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599492
14535	NC_002927	GGA	2	6	532095	532100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33599492
14536	NC_002927	GGA	2	6	532119	532124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33599492
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14538	NC_002927	GCT	2	6	532209	532214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599492
14539	NC_002927	TAC	2	6	532306	532311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599492
14540	NC_002927	CGG	2	6	532316	532321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599492
14541	NC_002927	CGG	3	9	532331	532339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599492
14542	NC_002927	GAA	2	6	532368	532373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33599492
14543	NC_002927	TGC	3	9	532385	532393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599492
14544	NC_002927	GGC	2	6	532471	532476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599492
14545	NC_002927	GAAGA	2	10	532504	532513	60 %	0 %	40 %	0 %	33599492
14546	NC_002927	GCA	2	6	532563	532568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599492
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14550	NC_002927	TGC	2	6	532667	532672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599492
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14552	NC_002927	AGG	2	6	532694	532699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33599492
14553	NC_002927	CG	3	6	532749	532754	0 %	0 %	50 %	50 %	33599492
14554	NC_002927	GCT	3	9	532797	532805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599492
14555	NC_002927	GCT	2	6	532815	532820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599492
14556	NC_002927	GC	3	6	532829	532834	0 %	0 %	50 %	50 %	33599492
14557	NC_002927	CGG	2	6	532847	532852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599492
14558	NC_002927	GCG	2	6	532913	532918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14559	NC_002927	CG	3	6	532924	532929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14560	NC_002927	ACG	2	6	532969	532974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14561	NC_002927	GAGG	2	8	533005	533012	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_002927	GGA	2	6	533049	533054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14563	NC_002927	GGA	2	6	533092	533097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14564	NC_002927	GGA	2	6	533135	533140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14565	NC_002927	GTCG	2	8	533141	533148	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14566	NC_002927	CAT	2	6	533226	533231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599493
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14569	NC_002927	CAGC	2	8	533289	533296	25 %	0 %	25 %	50 %	33599493
14570	NC_002927	GCG	2	6	533302	533307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599493
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14586	NC_002927	CG	4	8	533946	533953	0 %	0 %	50 %	50 %	33599494
14587	NC_002927	GC	5	10	533968	533977	0 %	0 %	50 %	50 %	33599494
14588	NC_002927	GC	3	6	533992	533997	0 %	0 %	50 %	50 %	33599494
14589	NC_002927	GC	4	8	534116	534123	0 %	0 %	50 %	50 %	33599494
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14594	NC_002927	GCC	2	6	534262	534267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599494
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14596	NC_002927	TGT	2	6	534291	534296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33599494
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14598	NC_002927	GGGC	2	8	534329	534336	0 %	0 %	75 %	25 %	33599494
14599	NC_002927	CAGC	2	8	534382	534389	25 %	0 %	25 %	50 %	33599494
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14602	NC_002927	TCC	2	6	534471	534476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14603	NC_002927	GCG	2	6	534492	534497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14604	NC_002927	CGG	2	6	534522	534527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599495
14605	NC_002927	GCT	2	6	534536	534541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599495
14606	NC_002927	GCCC	2	8	534553	534560	0 %	0 %	25 %	75 %	33599495
14607	NC_002927	AGC	2	6	534561	534566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599495
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14609	NC_002927	GCGCA	2	10	534603	534612	20 %	0 %	40 %	40 %	33599495
14610	NC_002927	GCTG	2	8	534619	534626	0 %	25 %	50 %	25 %	33599495
14611	NC_002927	GCG	2	6	534627	534632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599495
14612	NC_002927	CGGGG	3	15	534635	534649	0 %	0 %	80 %	20 %	33599495
14613	NC_002927	GC	3	6	534657	534662	0 %	0 %	50 %	50 %	33599495
14614	NC_002927	GC	3	6	534666	534671	0 %	0 %	50 %	50 %	33599495
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14621	NC_002927	CAG	3	9	534882	534890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599496
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14862	NC_002927	CGA	2	6	542420	542425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14865	NC_002927	CGTGC	2	10	542462	542471	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14866	NC_002927	CGA	2	6	542525	542530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14994	NC_002927	CTG	2	6	548140	548145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599509
14995	NC_002927	TGG	2	6	548165	548170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599509
14996	NC_002927	GTAT	2	8	548210	548217	25 %	50 %	25 %	0 %	33599509
14997	NC_002927	GAT	2	6	548265	548270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599509
14998	NC_002927	ATT	2	6	548371	548376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33599509
14999	NC_002927	AGC	2	6	548468	548473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599509
15000	NC_002927	GA	3	6	548488	548493	50 %	0 %	50 %	0 %	33599509

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