MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 153496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
144001	NC_002927	CGCGT	2	10	5002204	5002213	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144002	NC_002927	ATC	2	6	5002273	5002278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33603674
144003	NC_002927	GC	3	6	5002308	5002313	0 %	0 %	50 %	50 %	33603674
144004	NC_002927	GCC	2	6	5002359	5002364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603674
144005	NC_002927	TGC	2	6	5002376	5002381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603674
144006	NC_002927	TGGC	2	8	5002393	5002400	0 %	25 %	50 %	25 %	33603674
144007	NC_002927	CGATC	2	10	5002407	5002416	20 %	20 %	20 %	40 %	33603674
144008	NC_002927	GCC	3	9	5002468	5002476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603674
144009	NC_002927	TCA	2	6	5002484	5002489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33603674
144010	NC_002927	GC	4	8	5002491	5002498	0 %	0 %	50 %	50 %	33603674
144011	NC_002927	GCC	2	6	5002563	5002568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603674
144012	NC_002927	GTG	2	6	5002642	5002647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33603674
144013	NC_002927	CAG	2	6	5002674	5002679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603674
144014	NC_002927	CCA	2	6	5002706	5002711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33603674
144015	NC_002927	GAA	2	6	5002740	5002745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33603674
144016	NC_002927	GAT	2	6	5002821	5002826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33603674
144017	NC_002927	GC	3	6	5002878	5002883	0 %	0 %	50 %	50 %	33603674
144018	NC_002927	CAC	2	6	5002884	5002889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33603674
144019	NC_002927	TCT	2	6	5002895	5002900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33603674
144020	NC_002927	GCG	2	6	5002903	5002908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603674
144021	NC_002927	GCC	2	6	5002950	5002955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603674
144022	NC_002927	CTCGGC	2	12	5002962	5002973	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	33603674
144023	NC_002927	GCC	2	6	5003043	5003048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603674
144024	NC_002927	GCA	2	6	5003060	5003065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603674
144025	NC_002927	CGC	2	6	5003108	5003113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603674
144026	NC_002927	CGC	4	12	5003153	5003164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603674
144027	NC_002927	CTC	2	6	5003175	5003180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33603674
144028	NC_002927	GCG	2	6	5003346	5003351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603674
144029	NC_002927	CG	3	6	5003350	5003355	0 %	0 %	50 %	50 %	33603674
144030	NC_002927	CGA	2	6	5003360	5003365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603674
144031	NC_002927	GCA	2	6	5003452	5003457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603675
144032	NC_002927	GC	3	6	5003485	5003490	0 %	0 %	50 %	50 %	33603675
144033	NC_002927	CGT	2	6	5003497	5003502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603675
144034	NC_002927	GGT	2	6	5003509	5003514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33603675
144035	NC_002927	CGG	2	6	5003515	5003520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603675
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144037	NC_002927	TCG	2	6	5003565	5003570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603675
144038	NC_002927	TGC	2	6	5003590	5003595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603675
144039	NC_002927	GCG	2	6	5003617	5003622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603675
144040	NC_002927	TGA	2	6	5003626	5003631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33603675
144041	NC_002927	ATGT	2	8	5003640	5003647	25 %	50 %	25 %	0 %	33603675
144042	NC_002927	TGGAAA	2	12	5003668	5003679	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	33603675
144043	NC_002927	GC	3	6	5003718	5003723	0 %	0 %	50 %	50 %	33603675
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144050	NC_002927	CCG	2	6	5003917	5003922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603675
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144054	NC_002927	CGG	2	6	5004106	5004111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603675
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144061	NC_002927	GCGCC	2	10	5004272	5004281	0 %	0 %	40 %	60 %	33603675
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144067	NC_002927	CGGC	2	8	5004328	5004335	0 %	0 %	50 %	50 %	33603675
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144331	NC_002927	GAG	2	6	5012863	5012868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33603683
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144333	NC_002927	CTG	2	6	5012917	5012922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603683
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144470	NC_002927	CTGC	2	8	5017558	5017565	0 %	25 %	25 %	50 %	33603689
144471	NC_002927	GGC	2	6	5017586	5017591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603689
144472	NC_002927	TCA	2	6	5017611	5017616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33603689
144473	NC_002927	TGC	2	6	5017671	5017676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603689
144474	NC_002927	GC	3	6	5017675	5017680	0 %	0 %	50 %	50 %	33603689
144475	NC_002927	TTC	2	6	5017700	5017705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33603689
144476	NC_002927	GAC	2	6	5017706	5017711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603689
144477	NC_002927	GAA	2	6	5017784	5017789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33603689
144478	NC_002927	TCG	2	6	5017797	5017802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603689
144479	NC_002927	CG	4	8	5017804	5017811	0 %	0 %	50 %	50 %	33603689
144480	NC_002927	GAG	2	6	5017838	5017843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33603689
144481	NC_002927	CGG	2	6	5017876	5017881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603689
144482	NC_002927	GTC	2	6	5017901	5017906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603689
144483	NC_002927	GCGCT	2	10	5017943	5017952	0 %	20 %	40 %	40 %	33603689
144484	NC_002927	GCT	2	6	5017954	5017959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603689
144485	NC_002927	TGA	2	6	5018091	5018096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33603689
144486	NC_002927	CG	3	6	5018112	5018117	0 %	0 %	50 %	50 %	33603689
144487	NC_002927	CGG	3	9	5018146	5018154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603689
144488	NC_002927	GC	3	6	5018212	5018217	0 %	0 %	50 %	50 %	33603689
144489	NC_002927	GCC	2	6	5018224	5018229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144490	NC_002927	GAG	2	6	5018245	5018250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144491	NC_002927	CTG	2	6	5018286	5018291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603690
144492	NC_002927	CTGGCG	2	12	5018298	5018309	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33603690
144493	NC_002927	CGG	2	6	5018320	5018325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603690
144494	NC_002927	GCC	2	6	5018331	5018336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603690
144495	NC_002927	GGGC	2	8	5018381	5018388	0 %	0 %	75 %	25 %	33603690
144496	NC_002927	GC	3	6	5018403	5018408	0 %	0 %	50 %	50 %	33603690
144497	NC_002927	TGG	2	6	5018410	5018415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33603690
144498	NC_002927	GTC	3	9	5018448	5018456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603690
144499	NC_002927	GCGG	2	8	5018472	5018479	0 %	0 %	75 %	25 %	33603690
144500	NC_002927	CAT	2	6	5018480	5018485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33603690

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