MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 153496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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138002	NC_002927	GTC	2	6	4799554	4799559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603473
138003	NC_002927	CAG	2	6	4799587	4799592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603473
138004	NC_002927	GCA	2	6	4799652	4799657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603473
138005	NC_002927	CGT	2	6	4799735	4799740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138006	NC_002927	A	8	8	4799742	4799749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138007	NC_002927	GC	3	6	4799778	4799783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138008	NC_002927	GCTG	2	8	4799820	4799827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138009	NC_002927	GC	3	6	4799841	4799846	0 %	0 %	50 %	50 %	33603474
138010	NC_002927	CG	3	6	4799866	4799871	0 %	0 %	50 %	50 %	33603474
138011	NC_002927	CGT	2	6	4799896	4799901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603474
138012	NC_002927	CGGCCA	2	12	4799902	4799913	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33603474
138013	NC_002927	GCG	2	6	4799927	4799932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603474
138014	NC_002927	GCCAC	2	10	4800012	4800021	20 %	0 %	20 %	60 %	33603474
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138016	NC_002927	GCT	2	6	4800047	4800052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603474
138017	NC_002927	CAG	2	6	4800092	4800097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603474
138018	NC_002927	CG	5	10	4800098	4800107	0 %	0 %	50 %	50 %	33603474
138019	NC_002927	GCC	2	6	4800236	4800241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603474
138020	NC_002927	CG	3	6	4800271	4800276	0 %	0 %	50 %	50 %	33603474
138021	NC_002927	CGGC	2	8	4800289	4800296	0 %	0 %	50 %	50 %	33603474
138022	NC_002927	ATGGG	2	10	4800300	4800309	20 %	20 %	60 %	0 %	33603474
138023	NC_002927	GC	3	6	4800399	4800404	0 %	0 %	50 %	50 %	33603474
138024	NC_002927	CAG	2	6	4800410	4800415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603474
138025	NC_002927	CGA	2	6	4800448	4800453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603474
138026	NC_002927	CGCC	2	8	4800474	4800481	0 %	0 %	25 %	75 %	33603474
138027	NC_002927	CGG	2	6	4800502	4800507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603474
138028	NC_002927	GAT	2	6	4800527	4800532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33603474
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138032	NC_002927	CGA	2	6	4800628	4800633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603474
138033	NC_002927	CGG	2	6	4800667	4800672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603474
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138042	NC_002927	GCC	2	6	4801093	4801098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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138117	NC_002927	CGCC	2	8	4803362	4803369	0 %	0 %	25 %	75 %	33603477
138118	NC_002927	GCA	2	6	4803430	4803435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603478
138119	NC_002927	CTG	3	9	4803438	4803446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603478
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138212	NC_002927	CGCTC	2	10	4807197	4807206	0 %	20 %	20 %	60 %	33603483
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138220	NC_002927	GCGCC	2	10	4807540	4807549	0 %	0 %	40 %	60 %	33603483
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138467	NC_002927	GAT	2	6	4815355	4815360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33603493
138468	NC_002927	CTT	2	6	4815400	4815405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33603493
138469	NC_002927	CCG	2	6	4815408	4815413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603493
138470	NC_002927	TTG	2	6	4815422	4815427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33603493
138471	NC_002927	CCA	2	6	4815441	4815446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33603493
138472	NC_002927	CG	3	6	4815489	4815494	0 %	0 %	50 %	50 %	33603493
138473	NC_002927	GCA	2	6	4815567	4815572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603493
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138475	NC_002927	CTT	2	6	4815601	4815606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33603493
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138478	NC_002927	GCA	4	12	4815681	4815692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603493
138479	NC_002927	GC	3	6	4815695	4815700	0 %	0 %	50 %	50 %	33603493
138480	NC_002927	TGG	2	6	4815732	4815737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33603493
138481	NC_002927	TTC	2	6	4815770	4815775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33603493
138482	NC_002927	TTG	2	6	4815839	4815844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33603493
138483	NC_002927	GAA	2	6	4815871	4815876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33603493
138484	NC_002927	GCT	2	6	4815888	4815893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33603493
138485	NC_002927	CCTT	2	8	4815956	4815963	0 %	50 %	0 %	50 %	33603493
138486	NC_002927	GAC	2	6	4815979	4815984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603493
138487	NC_002927	GCG	2	6	4816043	4816048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33603493
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138489	NC_002927	CAG	2	6	4816057	4816062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603493
138490	NC_002927	CAG	2	6	4816075	4816080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603493
138491	NC_002927	GGT	2	6	4816124	4816129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138492	NC_002927	CCGG	2	8	4816145	4816152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138493	NC_002927	GC	3	6	4816164	4816169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138494	NC_002927	GCC	2	6	4816180	4816185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138495	NC_002927	TGAA	2	8	4816212	4816219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138496	NC_002927	TAC	2	6	4816272	4816277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138497	NC_002927	TTG	2	6	4816361	4816366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138498	NC_002927	GCC	2	6	4816390	4816395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33603494
138499	NC_002927	CGA	2	6	4816450	4816455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33603494
138500	NC_002927	GTG	2	6	4816474	4816479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33603494

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