MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 153496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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108502	NC_002927	CGTTA	2	10	3750306	3750315	20 %	40 %	20 %	20 %	33602487
108503	NC_002927	CG	3	6	3750370	3750375	0 %	0 %	50 %	50 %	33602487
108504	NC_002927	TCA	2	6	3750392	3750397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33602487
108505	NC_002927	TCCG	2	8	3750439	3750446	0 %	25 %	25 %	50 %	33602487
108506	NC_002927	CCT	2	6	3750478	3750483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33602488
108507	NC_002927	GTC	2	6	3750491	3750496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602488
108508	NC_002927	GCA	2	6	3750710	3750715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602488
108509	NC_002927	AGC	2	6	3750733	3750738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602488
108510	NC_002927	CGC	2	6	3750742	3750747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602488
108511	NC_002927	TTC	2	6	3750789	3750794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33602488
108512	NC_002927	GCG	2	6	3750800	3750805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602488
108513	NC_002927	TGA	2	6	3750808	3750813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33602488
108514	NC_002927	GCA	2	6	3750877	3750882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602488
108515	NC_002927	GCGCC	2	10	3750918	3750927	0 %	0 %	40 %	60 %	33602489
108516	NC_002927	GGC	2	6	3750928	3750933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602489
108517	NC_002927	TGC	2	6	3750984	3750989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602489
108518	NC_002927	CCA	2	6	3750990	3750995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33602489
108519	NC_002927	CG	3	6	3751008	3751013	0 %	0 %	50 %	50 %	33602489
108520	NC_002927	CGG	2	6	3751107	3751112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602489
108521	NC_002927	CGGCC	2	10	3751159	3751168	0 %	0 %	40 %	60 %	33602489
108522	NC_002927	GCG	2	6	3751192	3751197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602489
108523	NC_002927	CAC	2	6	3751216	3751221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33602489
108524	NC_002927	TCG	2	6	3751235	3751240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602489
108525	NC_002927	GCC	2	6	3751277	3751282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602489
108526	NC_002927	GCTC	2	8	3751288	3751295	0 %	25 %	25 %	50 %	33602489
108527	NC_002927	AGG	2	6	3751301	3751306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33602489
108528	NC_002927	CTC	2	6	3751347	3751352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33602490
108529	NC_002927	GTC	2	6	3751407	3751412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602490
108530	NC_002927	CAC	2	6	3751419	3751424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33602490
108531	NC_002927	GCC	2	6	3751459	3751464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602490
108532	NC_002927	AGC	2	6	3751465	3751470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602490
108533	NC_002927	CGC	2	6	3751567	3751572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602490
108534	NC_002927	GCT	2	6	3751701	3751706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602491
108535	NC_002927	TGC	2	6	3751707	3751712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602491
108536	NC_002927	CGA	2	6	3751776	3751781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602491
108537	NC_002927	GC	3	6	3751785	3751790	0 %	0 %	50 %	50 %	33602491
108538	NC_002927	CCG	2	6	3751800	3751805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602491
108539	NC_002927	CGC	2	6	3751824	3751829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602491
108540	NC_002927	CAAC	2	8	3751924	3751931	50 %	0 %	0 %	50 %	33602491
108541	NC_002927	AGG	2	6	3751951	3751956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33602492
108542	NC_002927	CTT	2	6	3751999	3752004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33602492
108543	NC_002927	AACA	2	8	3752036	3752043	75 %	0 %	0 %	25 %	33602492
108544	NC_002927	GCG	2	6	3752049	3752054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602492
108545	NC_002927	CGA	2	6	3752098	3752103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602492
108546	NC_002927	CTA	2	6	3752137	3752142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33602493
108547	NC_002927	CAA	2	6	3752165	3752170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33602493
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108549	NC_002927	CCA	2	6	3752183	3752188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33602493
108550	NC_002927	GGCG	2	8	3752189	3752196	0 %	0 %	75 %	25 %	33602493
108551	NC_002927	GCC	3	9	3752239	3752247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602493
108552	NC_002927	CGC	2	6	3752253	3752258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602493
108553	NC_002927	CACGT	2	10	3752265	3752274	20 %	20 %	20 %	40 %	33602493
108554	NC_002927	TGC	2	6	3752366	3752371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108555	NC_002927	CAGC	2	8	3752373	3752380	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108556	NC_002927	CGC	2	6	3752393	3752398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108557	NC_002927	CCCCTT	2	12	3752431	3752442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108558	NC_002927	GCT	2	6	3752449	3752454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108559	NC_002927	CA	3	6	3752457	3752462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108560	NC_002927	GGA	2	6	3752491	3752496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108561	NC_002927	TGG	2	6	3752547	3752552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108562	NC_002927	ATC	2	6	3752555	3752560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33602494
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108565	NC_002927	GATTT	2	10	3752720	3752729	20 %	60 %	20 %	0 %	33602494
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108570	NC_002927	GCT	2	6	3752871	3752876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602495
108571	NC_002927	CGT	2	6	3752952	3752957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602495
108572	NC_002927	GGCC	2	8	3752959	3752966	0 %	0 %	50 %	50 %	33602495
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108585	NC_002927	ACGG	2	8	3753564	3753571	25 %	0 %	50 %	25 %	33602496
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108589	NC_002927	TTAT	2	8	3753677	3753684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108590	NC_002927	GAC	2	6	3753784	3753789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602497
108591	NC_002927	CG	5	10	3753813	3753822	0 %	0 %	50 %	50 %	33602497
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108601	NC_002927	ACA	2	6	3754362	3754367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33602498
108602	NC_002927	GCC	2	6	3754424	3754429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602498
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108606	NC_002927	GTC	2	6	3754650	3754655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108607	NC_002927	CGA	2	6	3754756	3754761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602499
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108609	NC_002927	CGA	2	6	3754841	3754846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602499
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108613	NC_002927	CGG	2	6	3755167	3755172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108614	NC_002927	GCA	2	6	3755183	3755188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108615	NC_002927	GCT	2	6	3755208	3755213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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