MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 153496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
105001	NC_002927	TCC	2	6	3621757	3621762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105002	NC_002927	CCTC	2	8	3621801	3621808	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
105003	NC_002927	AC	3	6	3621811	3621816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105004	NC_002927	TCTT	2	8	3621870	3621877	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105005	NC_002927	GCT	2	6	3621947	3621952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105006	NC_002927	TTTC	2	8	3622019	3622026	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105007	NC_002927	CTG	2	6	3622115	3622120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105008	NC_002927	GTC	2	6	3622165	3622170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105009	NC_002927	TCG	2	6	3622190	3622195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105010	NC_002927	CCA	2	6	3622214	3622219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105011	NC_002927	CCA	2	6	3622374	3622379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105012	NC_002927	TGC	2	6	3622392	3622397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105013	NC_002927	TG	4	8	3622472	3622479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105014	NC_002927	A	6	6	3622532	3622537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105015	NC_002927	TTCA	2	8	3622544	3622551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105016	NC_002927	TGCTT	2	10	3622567	3622576	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105017	NC_002927	GAC	2	6	3622582	3622587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105018	NC_002927	GCC	2	6	3622592	3622597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105019	NC_002927	GTT	2	6	3622632	3622637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105020	NC_002927	CAG	3	9	3622691	3622699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105021	NC_002927	GAA	2	6	3622714	3622719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105022	NC_002927	T	6	6	3622721	3622726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105023	NC_002927	CGT	2	6	3622931	3622936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105024	NC_002927	CAA	2	6	3622938	3622943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105025	NC_002927	CCGCC	2	10	3622988	3622997	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
105026	NC_002927	TGC	2	6	3623002	3623007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105027	NC_002927	CCCTG	2	10	3623015	3623024	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
105028	NC_002927	GCT	2	6	3623144	3623149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105029	NC_002927	TCTA	2	8	3623188	3623195	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105030	NC_002927	TGG	2	6	3623266	3623271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33602360
105031	NC_002927	ATCT	2	8	3623334	3623341	25 %	50 %	0 %	25 %	33602360
105032	NC_002927	CGT	2	6	3623348	3623353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602360
105033	NC_002927	TGC	2	6	3623359	3623364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602360
105034	NC_002927	GC	3	6	3623402	3623407	0 %	0 %	50 %	50 %	33602360
105035	NC_002927	GCT	2	6	3623486	3623491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602360
105036	NC_002927	TCA	2	6	3623521	3623526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33602360
105037	NC_002927	GC	3	6	3623548	3623553	0 %	0 %	50 %	50 %	33602360
105038	NC_002927	GCC	2	6	3623687	3623692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602360
105039	NC_002927	GGA	2	6	3623693	3623698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33602360
105040	NC_002927	GGC	2	6	3623703	3623708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602360
105041	NC_002927	CGA	2	6	3623741	3623746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602360
105042	NC_002927	CGC	2	6	3623753	3623758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602360
105043	NC_002927	CG	3	6	3623804	3623809	0 %	0 %	50 %	50 %	33602360
105044	NC_002927	CAGC	2	8	3623810	3623817	25 %	0 %	25 %	50 %	33602360
105045	NC_002927	GCA	2	6	3623914	3623919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602360
105046	NC_002927	CAG	2	6	3623921	3623926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602360
105047	NC_002927	GCG	2	6	3623989	3623994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602360
105048	NC_002927	CGA	2	6	3624023	3624028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602360
105049	NC_002927	CG	3	6	3624039	3624044	0 %	0 %	50 %	50 %	33602360
105050	NC_002927	GGC	2	6	3624072	3624077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602360
105051	NC_002927	CGG	2	6	3624128	3624133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602360
105052	NC_002927	GGGC	2	8	3624140	3624147	0 %	0 %	75 %	25 %	33602360
105053	NC_002927	CGA	2	6	3624155	3624160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602360
105054	NC_002927	CG	3	6	3624200	3624205	0 %	0 %	50 %	50 %	33602360
105055	NC_002927	GGC	2	6	3624228	3624233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602360
105056	NC_002927	ACC	2	6	3624271	3624276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33602360
105057	NC_002927	CG	3	6	3624313	3624318	0 %	0 %	50 %	50 %	33602360
105058	NC_002927	CTCG	2	8	3624392	3624399	0 %	25 %	25 %	50 %	33602360
105059	NC_002927	CG	3	6	3624436	3624441	0 %	0 %	50 %	50 %	33602360
105060	NC_002927	CG	3	6	3624455	3624460	0 %	0 %	50 %	50 %	33602360
105061	NC_002927	GC	3	6	3624501	3624506	0 %	0 %	50 %	50 %	33602360
105062	NC_002927	CG	3	6	3624517	3624522	0 %	0 %	50 %	50 %	33602360
105063	NC_002927	GTG	2	6	3624549	3624554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33602360
105064	NC_002927	TCG	2	6	3624604	3624609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602360
105065	NC_002927	CAT	2	6	3624662	3624667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33602360
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105067	NC_002927	CAG	2	6	3624762	3624767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602361
105068	NC_002927	GGCC	2	8	3624794	3624801	0 %	0 %	50 %	50 %	33602361
105069	NC_002927	CAG	2	6	3624894	3624899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602361
105070	NC_002927	CAG	2	6	3624930	3624935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602361
105071	NC_002927	CACC	2	8	3624981	3624988	25 %	0 %	0 %	75 %	33602361
105072	NC_002927	GGC	2	6	3625098	3625103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602361
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105085	NC_002927	GCGG	2	8	3625500	3625507	0 %	0 %	75 %	25 %	33602361
105086	NC_002927	GGCCG	2	10	3625539	3625548	0 %	0 %	60 %	40 %	33602361
105087	NC_002927	GC	3	6	3625555	3625560	0 %	0 %	50 %	50 %	33602361
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105098	NC_002927	CG	3	6	3625912	3625917	0 %	0 %	50 %	50 %	33602362
105099	NC_002927	TGC	2	6	3626005	3626010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602362
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105103	NC_002927	ATAC	2	8	3626171	3626178	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105104	NC_002927	TAT	2	6	3626190	3626195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105105	NC_002927	T	6	6	3626219	3626224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105106	NC_002927	CAT	2	6	3626235	3626240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33602363
105107	NC_002927	CAT	2	6	3626271	3626276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33602363
105108	NC_002927	ACTGT	2	10	3626311	3626320	20 %	40 %	20 %	20 %	33602363
105109	NC_002927	ATC	2	6	3626380	3626385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33602363
105110	NC_002927	TGG	2	6	3626399	3626404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33602363
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105112	NC_002927	GGC	2	6	3626478	3626483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602363
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105117	NC_002927	CGGCG	2	10	3626562	3626571	0 %	0 %	60 %	40 %	33602363
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105119	NC_002927	CG	4	8	3626619	3626626	0 %	0 %	50 %	50 %	33602363
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105220	NC_002927	GC	3	6	3629724	3629729	0 %	0 %	50 %	50 %	33602365
105221	NC_002927	CTG	2	6	3629733	3629738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602365
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105224	NC_002927	GCG	3	9	3629827	3629835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602365
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105229	NC_002927	CG	3	6	3630009	3630014	0 %	0 %	50 %	50 %	33602365
105230	NC_002927	GCCG	2	8	3630035	3630042	0 %	0 %	50 %	50 %	33602365
105231	NC_002927	GC	3	6	3630058	3630063	0 %	0 %	50 %	50 %	33602365
105232	NC_002927	TGC	2	6	3630112	3630117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602365
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105234	NC_002927	GGCC	3	12	3630131	3630142	0 %	0 %	50 %	50 %	33602365
105235	NC_002927	CCACCG	2	12	3630160	3630171	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	33602365
105236	NC_002927	CAAGGT	2	12	3630185	3630196	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33602365
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105470	NC_002927	CGG	2	6	3637881	3637886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602373
105471	NC_002927	GCTT	2	8	3637896	3637903	0 %	50 %	25 %	25 %	33602373
105472	NC_002927	TCG	2	6	3637904	3637909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602373
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105497	NC_002927	CGT	2	6	3638611	3638616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602374
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105499	NC_002927	GCC	3	9	3638696	3638704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602374
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