MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 153496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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103002	NC_002927	CCTCCA	2	12	3552325	3552336	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	33602300
103003	NC_002927	CGGC	2	8	3552354	3552361	0 %	0 %	50 %	50 %	33602300
103004	NC_002927	TGA	2	6	3552427	3552432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33602300
103005	NC_002927	CCG	2	6	3552462	3552467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602300
103006	NC_002927	CGCCAG	2	12	3552554	3552565	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33602300
103007	NC_002927	CG	3	6	3552589	3552594	0 %	0 %	50 %	50 %	33602300
103008	NC_002927	GCA	2	6	3552598	3552603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602300
103009	NC_002927	GCGA	2	8	3552607	3552614	25 %	0 %	50 %	25 %	33602300
103010	NC_002927	GC	3	6	3552615	3552620	0 %	0 %	50 %	50 %	33602300
103011	NC_002927	GCAC	2	8	3552787	3552794	25 %	0 %	25 %	50 %	33602300
103012	NC_002927	CGC	2	6	3552824	3552829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602300
103013	NC_002927	GCC	2	6	3552854	3552859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602300
103014	NC_002927	CGC	2	6	3552868	3552873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602300
103015	NC_002927	CAC	2	6	3552890	3552895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33602300
103016	NC_002927	GC	3	6	3552929	3552934	0 %	0 %	50 %	50 %	33602300
103017	NC_002927	CCA	2	6	3553106	3553111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33602300
103018	NC_002927	GCCA	2	8	3553119	3553126	25 %	0 %	25 %	50 %	33602300
103019	NC_002927	TGG	2	6	3553138	3553143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33602300
103020	NC_002927	GC	4	8	3553160	3553167	0 %	0 %	50 %	50 %	33602300
103021	NC_002927	GC	3	6	3553193	3553198	0 %	0 %	50 %	50 %	33602300
103022	NC_002927	GGCA	2	8	3553261	3553268	25 %	0 %	50 %	25 %	33602300
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103024	NC_002927	GC	3	6	3553318	3553323	0 %	0 %	50 %	50 %	33602300
103025	NC_002927	CAG	2	6	3553331	3553336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602300
103026	NC_002927	GC	4	8	3553394	3553401	0 %	0 %	50 %	50 %	33602300
103027	NC_002927	GCCG	2	8	3553423	3553430	0 %	0 %	50 %	50 %	33602300
103028	NC_002927	AGA	2	6	3553456	3553461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33602300
103029	NC_002927	ACG	2	6	3553485	3553490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602300
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103031	NC_002927	TGC	2	6	3553534	3553539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602300
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103033	NC_002927	GCC	2	6	3553600	3553605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602300
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103036	NC_002927	CG	3	6	3553694	3553699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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103039	NC_002927	GC	4	8	3553747	3553754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103040	NC_002927	CGC	2	6	3553761	3553766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602301
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103055	NC_002927	GCT	2	6	3554312	3554317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602301
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103461	NC_002927	TCCA	2	8	3566167	3566174	25 %	25 %	0 %	50 %	33602314
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103463	NC_002927	CAC	2	6	3566217	3566222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33602314
103464	NC_002927	GGCC	2	8	3566327	3566334	0 %	0 %	50 %	50 %	33602314
103465	NC_002927	CTG	2	6	3566340	3566345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602314
103466	NC_002927	CGC	2	6	3566423	3566428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602314
103467	NC_002927	GC	3	6	3566430	3566435	0 %	0 %	50 %	50 %	33602314
103468	NC_002927	GC	3	6	3566494	3566499	0 %	0 %	50 %	50 %	33602314
103469	NC_002927	CGG	2	6	3566610	3566615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103470	NC_002927	GA	3	6	3566637	3566642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103471	NC_002927	TGC	2	6	3566654	3566659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103472	NC_002927	TA	3	6	3566682	3566687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103473	NC_002927	TTG	2	6	3566753	3566758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103474	NC_002927	A	7	7	3566828	3566834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103475	NC_002927	CAT	2	6	3566864	3566869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103476	NC_002927	CTG	2	6	3566955	3566960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161609267
103477	NC_002927	CG	4	8	3566971	3566978	0 %	0 %	50 %	50 %	161609267
103478	NC_002927	CG	3	6	3566985	3566990	0 %	0 %	50 %	50 %	161609267
103479	NC_002927	CG	3	6	3567065	3567070	0 %	0 %	50 %	50 %	161609267
103480	NC_002927	CG	3	6	3567079	3567084	0 %	0 %	50 %	50 %	161609267
103481	NC_002927	TGGCCA	2	12	3567085	3567096	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161609267
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103483	NC_002927	TCG	2	6	3567127	3567132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161609267
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103494	NC_002927	CG	3	6	3567495	3567500	0 %	0 %	50 %	50 %	161609267
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103498	NC_002927	CG	3	6	3567617	3567622	0 %	0 %	50 %	50 %	161609267
103499	NC_002927	ACGCG	2	10	3567627	3567636	20 %	0 %	40 %	40 %	161609267
103500	NC_002927	GCA	2	6	3567661	3567666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161609267

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