MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 153496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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100002	NC_002927	TGT	2	6	3451041	3451046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100003	NC_002927	TCCT	2	8	3451069	3451076	0 %	50 %	0 %	50 %	33602206
100004	NC_002927	CAT	2	6	3451144	3451149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33602206
100005	NC_002927	GAGC	2	8	3451150	3451157	25 %	0 %	50 %	25 %	33602206
100006	NC_002927	TGG	2	6	3451221	3451226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33602206
100007	NC_002927	ACT	2	6	3451227	3451232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33602206
100008	NC_002927	GCC	2	6	3451235	3451240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602206
100009	NC_002927	GAT	2	6	3451258	3451263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33602206
100010	NC_002927	GCCG	2	8	3451298	3451305	0 %	0 %	50 %	50 %	33602206
100011	NC_002927	CGG	2	6	3451347	3451352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602206
100012	NC_002927	GCC	3	9	3451406	3451414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602206
100013	NC_002927	GCC	2	6	3451488	3451493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100014	NC_002927	CG	3	6	3451521	3451526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100015	NC_002927	CCGT	2	8	3451530	3451537	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100016	NC_002927	CGC	2	6	3451542	3451547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100017	NC_002927	CTT	3	9	3451555	3451563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100018	NC_002927	GCC	2	6	3451637	3451642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602207
100019	NC_002927	CAT	2	6	3451696	3451701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33602207
100020	NC_002927	GCG	2	6	3451705	3451710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602207
100021	NC_002927	CAAG	2	8	3451714	3451721	50 %	0 %	25 %	25 %	33602207
100022	NC_002927	CGA	2	6	3451813	3451818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602207
100023	NC_002927	CCG	2	6	3451843	3451848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602207
100024	NC_002927	GCATC	2	10	3451969	3451978	20 %	20 %	20 %	40 %	33602207
100025	NC_002927	CGC	2	6	3451995	3452000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602207
100026	NC_002927	GCC	2	6	3452119	3452124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602207
100027	NC_002927	TGA	2	6	3452142	3452147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33602207
100028	NC_002927	GCA	2	6	3452149	3452154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602207
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100030	NC_002927	CTG	2	6	3452204	3452209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602207
100031	NC_002927	CGA	2	6	3452212	3452217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602207
100032	NC_002927	GCG	2	6	3452256	3452261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602207
100033	NC_002927	GTG	2	6	3452264	3452269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33602207
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100041	NC_002927	GGC	2	6	3452513	3452518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602207
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100051	NC_002927	GC	3	6	3452903	3452908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100052	NC_002927	CTG	2	6	3452931	3452936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602208
100053	NC_002927	GC	4	8	3452945	3452952	0 %	0 %	50 %	50 %	33602208
100054	NC_002927	GC	4	8	3453016	3453023	0 %	0 %	50 %	50 %	33602208
100055	NC_002927	GCT	2	6	3453029	3453034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602208
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100470	NC_002927	GCA	2	6	3466841	3466846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602215
100471	NC_002927	GC	3	6	3466852	3466857	0 %	0 %	50 %	50 %	33602215
100472	NC_002927	TCC	2	6	3466864	3466869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33602215
100473	NC_002927	AGCC	2	8	3466870	3466877	25 %	0 %	25 %	50 %	33602215
100474	NC_002927	GC	3	6	3466884	3466889	0 %	0 %	50 %	50 %	33602215
100475	NC_002927	CGCC	2	8	3466916	3466923	0 %	0 %	25 %	75 %	33602215
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100492	NC_002927	CGA	2	6	3467513	3467518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602215
100493	NC_002927	CGG	2	6	3467526	3467531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602215
100494	NC_002927	TTG	2	6	3467542	3467547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33602215
100495	NC_002927	CGC	2	6	3467573	3467578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602215
100496	NC_002927	GC	3	6	3467663	3467668	0 %	0 %	50 %	50 %	33602215
100497	NC_002927	GAT	2	6	3467691	3467696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33602215
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100499	NC_002927	CAG	2	6	3467724	3467729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602215
100500	NC_002927	GCC	2	6	3467776	3467781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602215

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