MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 153496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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95002	NC_002927	GCA	2	6	3282285	3282290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602054
95003	NC_002927	CGCGC	2	10	3282291	3282300	0 %	0 %	40 %	60 %	33602054
95004	NC_002927	GC	6	12	3282398	3282409	0 %	0 %	50 %	50 %	33602054
95005	NC_002927	GCA	2	6	3282414	3282419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602054
95006	NC_002927	CGC	2	6	3282421	3282426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602054
95007	NC_002927	TCCA	2	8	3282431	3282438	25 %	25 %	0 %	50 %	33602054
95008	NC_002927	CGG	2	6	3282450	3282455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602054
95009	NC_002927	TCGA	2	8	3282461	3282468	25 %	25 %	25 %	25 %	33602054
95010	NC_002927	CGG	2	6	3282474	3282479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602054
95011	NC_002927	CAG	2	6	3282499	3282504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602054
95012	NC_002927	GC	3	6	3282509	3282514	0 %	0 %	50 %	50 %	33602054
95013	NC_002927	GGCGT	2	10	3282608	3282617	0 %	20 %	60 %	20 %	33602054
95014	NC_002927	CCA	3	9	3282627	3282635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33602054
95015	NC_002927	CCA	2	6	3282645	3282650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33602054
95016	NC_002927	CGGC	2	8	3282666	3282673	0 %	0 %	50 %	50 %	33602054
95017	NC_002927	TGCAC	2	10	3282690	3282699	20 %	20 %	20 %	40 %	33602054
95018	NC_002927	GCCGGT	2	12	3282705	3282716	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33602054
95019	NC_002927	TCG	2	6	3282782	3282787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602054
95020	NC_002927	GC	4	8	3282806	3282813	0 %	0 %	50 %	50 %	33602054
95021	NC_002927	TCG	2	6	3282815	3282820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602054
95022	NC_002927	TCG	2	6	3282860	3282865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602054
95023	NC_002927	CG	3	6	3282867	3282872	0 %	0 %	50 %	50 %	33602054
95024	NC_002927	GGCC	2	8	3282882	3282889	0 %	0 %	50 %	50 %	33602054
95025	NC_002927	GC	3	6	3282950	3282955	0 %	0 %	50 %	50 %	33602054
95026	NC_002927	GCTC	2	8	3282966	3282973	0 %	25 %	25 %	50 %	33602054
95027	NC_002927	CG	3	6	3282975	3282980	0 %	0 %	50 %	50 %	33602054
95028	NC_002927	CG	5	10	3282999	3283008	0 %	0 %	50 %	50 %	33602054
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95032	NC_002927	AAT	2	6	3283136	3283141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95033	NC_002927	CGG	2	6	3283176	3283181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95034	NC_002927	CAT	2	6	3283199	3283204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33602055
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95039	NC_002927	GC	3	6	3283427	3283432	0 %	0 %	50 %	50 %	33602055
95040	NC_002927	GCA	2	6	3283436	3283441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602055
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95054	NC_002927	GTC	2	6	3283795	3283800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602055
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95056	NC_002927	TAAT	2	8	3284024	3284031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95057	NC_002927	CG	3	6	3284122	3284127	0 %	0 %	50 %	50 %	33602056
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95441	NC_002927	CTG	2	6	3295177	3295182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602064
95442	NC_002927	GCC	3	9	3295207	3295215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602064
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95449	NC_002927	GGCC	2	8	3295512	3295519	0 %	0 %	50 %	50 %	33602065
95450	NC_002927	GCCC	2	8	3295524	3295531	0 %	0 %	25 %	75 %	33602065
95451	NC_002927	GC	3	6	3295599	3295604	0 %	0 %	50 %	50 %	33602065
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95460	NC_002927	GC	3	6	3295810	3295815	0 %	0 %	50 %	50 %	33602065
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95464	NC_002927	GGC	2	6	3295985	3295990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602065
95465	NC_002927	CCAGCG	2	12	3296063	3296074	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33602065
95466	NC_002927	CTG	2	6	3296094	3296099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602065
95467	NC_002927	CCA	2	6	3296126	3296131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33602065
95468	NC_002927	TCC	2	6	3296209	3296214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33602065
95469	NC_002927	CAG	2	6	3296220	3296225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602065
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95471	NC_002927	GCA	2	6	3296381	3296386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602065
95472	NC_002927	GCA	2	6	3296405	3296410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602065
95473	NC_002927	GCG	2	6	3296426	3296431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33602065
95474	NC_002927	TAGCTG	2	12	3296437	3296448	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	33602065
95475	NC_002927	CCG	2	6	3296455	3296460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602065
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95477	NC_002927	CAC	2	6	3296508	3296513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33602065
95478	NC_002927	GC	3	6	3296526	3296531	0 %	0 %	50 %	50 %	33602065
95479	NC_002927	CAC	2	6	3296556	3296561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33602065
95480	NC_002927	ACG	2	6	3296572	3296577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33602065
95481	NC_002927	ATC	2	6	3296606	3296611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95482	NC_002927	GCG	2	6	3296631	3296636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95483	NC_002927	CGCGC	2	10	3296637	3296646	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
95484	NC_002927	GCC	3	9	3296685	3296693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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95486	NC_002927	GTC	2	6	3296761	3296766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33602066
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95490	NC_002927	CCG	2	6	3296951	3296956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33602066
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