MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 153496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7126	NC_002927	TCA	2	6	268655	268660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599255
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7129	NC_002927	CGGC	2	8	268823	268830	0 %	0 %	50 %	50 %	33599255
7130	NC_002927	CGA	2	6	268833	268838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599255
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7132	NC_002927	CG	4	8	268899	268906	0 %	0 %	50 %	50 %	33599255
7133	NC_002927	GCCGC	2	10	268920	268929	0 %	0 %	40 %	60 %	33599255
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7154	NC_002927	TGC	2	6	269483	269488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599255
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7159	NC_002927	CGA	3	9	269565	269573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599255
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7203	NC_002927	CGG	3	9	271134	271142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599256
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7221	NC_002927	CAAG	2	8	271636	271643	50 %	0 %	25 %	25 %	33599257
7222	NC_002927	AAG	2	6	271652	271657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33599257
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7225	NC_002927	CTGG	2	8	271843	271850	0 %	25 %	50 %	25 %	33599257
7226	NC_002927	CAC	3	9	271888	271896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33599257
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7239	NC_002927	CGG	2	6	272246	272251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599258
7240	NC_002927	TCG	2	6	272329	272334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599258
7241	NC_002927	CGC	2	6	272362	272367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599258
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7243	NC_002927	GC	3	6	272393	272398	0 %	0 %	50 %	50 %	33599258
7244	NC_002927	CG	4	8	272409	272416	0 %	0 %	50 %	50 %	33599258
7245	NC_002927	AGC	2	6	272431	272436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599258
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7247	NC_002927	TCG	2	6	272488	272493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599258
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7373	NC_002927	GAG	2	6	276527	276532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33599262
7374	NC_002927	GAC	2	6	276569	276574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599262
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7376	NC_002927	GCT	2	6	276610	276615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599262
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7380	NC_002927	GC	4	8	276774	276781	0 %	0 %	50 %	50 %	33599262
7381	NC_002927	GCGG	2	8	276784	276791	0 %	0 %	75 %	25 %	33599262
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7385	NC_002927	GGT	2	6	276979	276984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599263
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7421	NC_002927	GC	3	6	278323	278328	0 %	0 %	50 %	50 %	33599264
7422	NC_002927	CGG	2	6	278349	278354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599264
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7424	NC_002927	CGC	2	6	278443	278448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599264
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7427	NC_002927	GAG	2	6	278583	278588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7428	NC_002927	C	7	7	278593	278599	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7429	NC_002927	GCC	2	6	278600	278605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599265
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7432	NC_002927	GCG	2	6	278777	278782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599265
7433	NC_002927	GCA	2	6	278832	278837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599265
7434	NC_002927	GCGCG	2	10	278842	278851	0 %	0 %	60 %	40 %	33599265
7435	NC_002927	TGCG	2	8	278858	278865	0 %	25 %	50 %	25 %	33599265
7436	NC_002927	CAT	2	6	278890	278895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599265
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7453	NC_002927	GCGCAG	2	12	279552	279563	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	33599266
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7458	NC_002927	AGGA	2	8	279721	279728	50 %	0 %	50 %	0 %	33599266
7459	NC_002927	GCA	2	6	279731	279736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599266
7460	NC_002927	GCGTG	2	10	279737	279746	0 %	20 %	60 %	20 %	33599266
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7470	NC_002927	GC	3	6	280168	280173	0 %	0 %	50 %	50 %	33599266
7471	NC_002927	ACG	2	6	280180	280185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599266
7472	NC_002927	CGA	2	6	280247	280252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599266
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7474	NC_002927	GCC	2	6	280384	280389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599266
7475	NC_002927	TG	3	6	280437	280442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7476	NC_002927	ACGGCG	2	12	280467	280478	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	33599267
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7478	NC_002927	CG	3	6	280648	280653	0 %	0 %	50 %	50 %	33599267
7479	NC_002927	GCGG	2	8	280675	280682	0 %	0 %	75 %	25 %	33599267
7480	NC_002927	CATA	2	8	280683	280690	50 %	25 %	0 %	25 %	33599267
7481	NC_002927	GGTC	2	8	280741	280748	0 %	25 %	50 %	25 %	33599267
7482	NC_002927	CGG	3	9	280768	280776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599267
7483	NC_002927	GGCCGC	2	12	280793	280804	0 %	0 %	50 %	50 %	33599267
7484	NC_002927	CG	4	8	280805	280812	0 %	0 %	50 %	50 %	33599267
7485	NC_002927	GC	3	6	280844	280849	0 %	0 %	50 %	50 %	33599267
7486	NC_002927	CAGG	2	8	280859	280866	25 %	0 %	50 %	25 %	33599267
7487	NC_002927	CG	3	6	280867	280872	0 %	0 %	50 %	50 %	33599267
7488	NC_002927	GCTG	2	8	280873	280880	0 %	25 %	50 %	25 %	33599267
7489	NC_002927	GC	3	6	280919	280924	0 %	0 %	50 %	50 %	33599267
7490	NC_002927	GTC	2	6	280952	280957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599267
7491	NC_002927	GGCC	2	8	280966	280973	0 %	0 %	50 %	50 %	33599267
7492	NC_002927	GGGC	2	8	281066	281073	0 %	0 %	75 %	25 %	33599267
7493	NC_002927	GGC	2	6	281084	281089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599267
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7495	NC_002927	CGC	2	6	281116	281121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599267
7496	NC_002927	GC	3	6	281124	281129	0 %	0 %	50 %	50 %	33599267
7497	NC_002927	GCCA	2	8	281139	281146	25 %	0 %	25 %	50 %	33599267
7498	NC_002927	GC	3	6	281169	281174	0 %	0 %	50 %	50 %	33599267
7499	NC_002927	GCC	3	9	281258	281266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599267
7500	NC_002927	CG	3	6	281276	281281	0 %	0 %	50 %	50 %	33599267

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