MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum) plasmid pLeu

Total Repeats: 271

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002253	ATT	2	6	6	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002253	T	7	7	10	16	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002253	A	7	7	17	23	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002253	A	6	6	43	48	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002253	T	9	9	57	65	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002253	TATT	2	8	85	92	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002253	T	7	7	91	97	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002253	ATTT	2	8	125	132	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002253	AAG	2	6	137	142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002253	A	8	8	151	158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002253	ATTT	3	12	167	178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002253	T	6	6	176	181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002253	A	7	7	186	192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002253	T	9	9	206	214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002253	A	6	6	219	224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002253	A	9	9	246	254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002253	G	7	7	255	261	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002253	A	6	6	290	295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002253	AAGA	2	8	319	326	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002253	TAAA	2	8	334	341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002253	ATA	3	9	385	393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957104
22	NC_002253	CTA	2	6	462	467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957104
23	NC_002253	GAA	2	6	474	479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957104
24	NC_002253	CTT	2	6	492	497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957104
25	NC_002253	T	8	8	533	540	0 %	100 %	0 %	0 %	10957104
26	NC_002253	ATCA	2	8	613	620	50 %	25 %	0 %	25 %	10957104
27	NC_002253	TTG	2	6	673	678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957104
28	NC_002253	T	8	8	697	704	0 %	100 %	0 %	0 %	10957104
29	NC_002253	A	6	6	724	729	100 %	0 %	0 %	0 %	10957104
30	NC_002253	T	7	7	786	792	0 %	100 %	0 %	0 %	10957104
31	NC_002253	TAAT	2	8	828	835	50 %	50 %	0 %	0 %	10957104
32	NC_002253	TTA	2	6	857	862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957104
33	NC_002253	TCA	2	6	893	898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957104
34	NC_002253	AGA	2	6	931	936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957104
35	NC_002253	TCT	2	6	1003	1008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957104
36	NC_002253	TAT	2	6	1134	1139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957104
37	NC_002253	GGT	2	6	1145	1150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957104
38	NC_002253	A	6	6	1153	1158	100 %	0 %	0 %	0 %	10957104
39	NC_002253	ATT	2	6	1168	1173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957104
40	NC_002253	TA	3	6	1174	1179	50 %	50 %	0 %	0 %	10957104
41	NC_002253	TTA	2	6	1188	1193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957104
42	NC_002253	T	6	6	1229	1234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002253	AT	3	6	1235	1240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002253	AT	3	6	1246	1251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002253	ATTTT	2	10	1255	1264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002253	AAT	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002253	T	7	7	1284	1290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002253	AT	3	6	1301	1306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002253	ACTTT	2	10	1307	1316	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_002253	T	9	9	1319	1327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002253	AATA	2	8	1331	1338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002253	A	6	6	1347	1352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002253	AT	3	6	1356	1361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002253	ACAT	2	8	1367	1374	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_002253	ATT	2	6	1379	1384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002253	TTAAA	2	10	1430	1439	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002253	AT	3	6	1444	1449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002253	T	6	6	1480	1485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002253	A	7	7	1508	1514	100 %	0 %	0 %	0 %	10957105
60	NC_002253	A	6	6	1518	1523	100 %	0 %	0 %	0 %	10957105
61	NC_002253	A	6	6	1530	1535	100 %	0 %	0 %	0 %	10957105
62	NC_002253	TA	3	6	1537	1542	50 %	50 %	0 %	0 %	10957105
63	NC_002253	TTTTA	2	10	1591	1600	20 %	80 %	0 %	0 %	10957105
64	NC_002253	CAA	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957105
65	NC_002253	GTT	2	6	1679	1684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957105
66	NC_002253	TAG	2	6	1707	1712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957105
67	NC_002253	GTTATG	2	12	1724	1735	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	10957105
68	NC_002253	A	6	6	1828	1833	100 %	0 %	0 %	0 %	10957105
69	NC_002253	TCT	2	6	1862	1867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957105
70	NC_002253	A	6	6	1899	1904	100 %	0 %	0 %	0 %	10957105
71	NC_002253	GAT	2	6	1910	1915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957105
72	NC_002253	TTATG	2	10	1920	1929	20 %	60 %	20 %	0 %	10957105
73	NC_002253	TTA	2	6	1932	1937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957105
74	NC_002253	TAT	2	6	1953	1958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957105
75	NC_002253	AT	3	6	1975	1980	50 %	50 %	0 %	0 %	10957105
76	NC_002253	A	9	9	1994	2002	100 %	0 %	0 %	0 %	10957105
77	NC_002253	A	8	8	2027	2034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002253	T	9	9	2039	2047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002253	A	7	7	2048	2054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002253	AT	3	6	2078	2083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002253	CTT	2	6	2099	2104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_002253	A	7	7	2107	2113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002253	TTAA	2	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002253	A	6	6	2149	2154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002253	TA	5	10	2156	2165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002253	T	6	6	2177	2182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002253	GAAA	2	8	2198	2205	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002253	A	7	7	2203	2209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002253	ATTT	2	8	2215	2222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002253	A	6	6	2234	2239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002253	ATT	2	6	2281	2286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002253	TAAA	2	8	2334	2341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002253	TGT	2	6	2379	2384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957106
94	NC_002253	ATT	2	6	2385	2390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957106
95	NC_002253	TAA	2	6	2473	2478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957106
96	NC_002253	TAA	2	6	2502	2507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957106
97	NC_002253	A	7	7	2543	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	10957106
98	NC_002253	TA	3	6	2573	2578	50 %	50 %	0 %	0 %	10957106
99	NC_002253	A	7	7	2582	2588	100 %	0 %	0 %	0 %	10957106
100	NC_002253	T	7	7	2589	2595	0 %	100 %	0 %	0 %	10957106
101	NC_002253	T	6	6	2606	2611	0 %	100 %	0 %	0 %	10957106
102	NC_002253	AAAT	2	8	2637	2644	75 %	25 %	0 %	0 %	10957106
103	NC_002253	T	6	6	2647	2652	0 %	100 %	0 %	0 %	10957106
104	NC_002253	A	8	8	2656	2663	100 %	0 %	0 %	0 %	10957106
105	NC_002253	A	7	7	2674	2680	100 %	0 %	0 %	0 %	10957106
106	NC_002253	A	7	7	2683	2689	100 %	0 %	0 %	0 %	10957106
107	NC_002253	A	6	6	2694	2699	100 %	0 %	0 %	0 %	10957106
108	NC_002253	ATTT	2	8	2704	2711	25 %	75 %	0 %	0 %	10957106
109	NC_002253	TAAT	2	8	2781	2788	50 %	50 %	0 %	0 %	10957106
110	NC_002253	A	9	9	2833	2841	100 %	0 %	0 %	0 %	10957106
111	NC_002253	GATA	2	8	2842	2849	50 %	25 %	25 %	0 %	10957106
112	NC_002253	TA	3	6	2874	2879	50 %	50 %	0 %	0 %	10957106
113	NC_002253	A	9	9	2879	2887	100 %	0 %	0 %	0 %	10957106
114	NC_002253	ATAAA	2	10	2890	2899	80 %	20 %	0 %	0 %	10957106
115	NC_002253	CAT	2	6	2925	2930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_002253	ATT	2	6	2938	2943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002253	ATG	2	6	2950	2955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002253	ATTT	2	8	2980	2987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002253	GTT	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957107
120	NC_002253	CAAG	2	8	3089	3096	50 %	0 %	25 %	25 %	10957107
121	NC_002253	TCA	2	6	3179	3184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957107
122	NC_002253	T	7	7	3324	3330	0 %	100 %	0 %	0 %	10957107
123	NC_002253	ATA	2	6	3383	3388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957107
124	NC_002253	T	6	6	3399	3404	0 %	100 %	0 %	0 %	10957107
125	NC_002253	A	7	7	3409	3415	100 %	0 %	0 %	0 %	10957107
126	NC_002253	TGA	2	6	3430	3435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957107
127	NC_002253	CTA	2	6	3459	3464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957107
128	NC_002253	ATTA	2	8	3502	3509	50 %	50 %	0 %	0 %	10957107
129	NC_002253	TAA	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957107
130	NC_002253	A	6	6	3583	3588	100 %	0 %	0 %	0 %	10957107
131	NC_002253	TTTG	2	8	3589	3596	0 %	75 %	25 %	0 %	10957107
132	NC_002253	CAGG	2	8	3686	3693	25 %	0 %	50 %	25 %	10957107
133	NC_002253	AGA	2	6	3754	3759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957107
134	NC_002253	AAT	2	6	3760	3765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957107
135	NC_002253	AGA	2	6	3784	3789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957107
136	NC_002253	ATTA	2	8	3812	3819	50 %	50 %	0 %	0 %	10957107
137	NC_002253	TAA	2	6	3880	3885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957107
138	NC_002253	TAG	2	6	3891	3896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957107
139	NC_002253	GTA	2	6	3897	3902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957107
140	NC_002253	TTC	2	6	3916	3921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957107
141	NC_002253	CCA	2	6	3928	3933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957107
142	NC_002253	A	6	6	3946	3951	100 %	0 %	0 %	0 %	10957107
143	NC_002253	A	6	6	3955	3960	100 %	0 %	0 %	0 %	10957107
144	NC_002253	AGT	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957107
145	NC_002253	AAG	2	6	3996	4001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957107
146	NC_002253	ACTTA	2	10	4006	4015	40 %	40 %	0 %	20 %	10957107
147	NC_002253	AGC	2	6	4033	4038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957107
148	NC_002253	TAA	2	6	4069	4074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957107
149	NC_002253	T	6	6	4108	4113	0 %	100 %	0 %	0 %	10957107
150	NC_002253	A	6	6	4127	4132	100 %	0 %	0 %	0 %	10957107
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.