MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum) plasmid pTrp

Total Repeats: 227

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002252	T	7	7	2	8	0 %	100 %	0 %	0 %	10957100
2	NC_002252	A	7	7	35	41	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
3	NC_002252	ACA	2	6	64	69	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957100
4	NC_002252	ATC	2	6	77	82	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957100
5	NC_002252	ATT	2	6	105	110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957100
6	NC_002252	CAG	2	6	119	124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957100
7	NC_002252	TAA	2	6	129	134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957100
8	NC_002252	A	8	8	133	140	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
9	NC_002252	CTG	2	6	185	190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957100
10	NC_002252	CT	3	6	217	222	0 %	50 %	0 %	50 %	10957100
11	NC_002252	A	7	7	268	274	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
12	NC_002252	T	6	6	280	285	0 %	100 %	0 %	0 %	10957100
13	NC_002252	A	7	7	287	293	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
14	NC_002252	ACA	2	6	326	331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957100
15	NC_002252	TGA	2	6	336	341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957100
16	NC_002252	A	7	7	346	352	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
17	NC_002252	T	6	6	353	358	0 %	100 %	0 %	0 %	10957100
18	NC_002252	AAC	2	6	403	408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957100
19	NC_002252	T	6	6	433	438	0 %	100 %	0 %	0 %	10957100
20	NC_002252	A	6	6	496	501	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
21	NC_002252	TTTA	2	8	524	531	25 %	75 %	0 %	0 %	10957100
22	NC_002252	TTG	2	6	545	550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957100
23	NC_002252	ATC	2	6	554	559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957100
24	NC_002252	A	9	9	560	568	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
25	NC_002252	A	7	7	611	617	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
26	NC_002252	A	7	7	625	631	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
27	NC_002252	AGA	2	6	636	641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957100
28	NC_002252	AGAAA	2	10	645	654	80 %	0 %	20 %	0 %	10957100
29	NC_002252	GAA	2	6	658	663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957100
30	NC_002252	A	7	7	750	756	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
31	NC_002252	AATT	2	8	764	771	50 %	50 %	0 %	0 %	10957100
32	NC_002252	T	8	8	811	818	0 %	100 %	0 %	0 %	10957100
33	NC_002252	A	8	8	855	862	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
34	NC_002252	T	6	6	883	888	0 %	100 %	0 %	0 %	10957100
35	NC_002252	ATG	2	6	944	949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957100
36	NC_002252	A	7	7	950	956	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
37	NC_002252	A	7	7	1005	1011	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
38	NC_002252	CAG	2	6	1038	1043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957100
39	NC_002252	AGT	2	6	1209	1214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957100
40	NC_002252	AATT	2	8	1310	1317	50 %	50 %	0 %	0 %	10957100
41	NC_002252	GAAGGG	2	12	1327	1338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957100
42	NC_002252	CGG	2	6	1350	1355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957100
43	NC_002252	CAA	2	6	1436	1441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957100
44	NC_002252	GTT	2	6	1459	1464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957100
45	NC_002252	AG	3	6	1494	1499	50 %	0 %	50 %	0 %	10957100
46	NC_002252	TAA	2	6	1520	1525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957100
47	NC_002252	A	7	7	1533	1539	100 %	0 %	0 %	0 %	10957100
48	NC_002252	ACA	2	6	1591	1596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957101
49	NC_002252	AAC	2	6	1624	1629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957101
50	NC_002252	A	7	7	1639	1645	100 %	0 %	0 %	0 %	10957101
51	NC_002252	ATT	2	6	1683	1688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957101
52	NC_002252	A	6	6	1701	1706	100 %	0 %	0 %	0 %	10957101
53	NC_002252	TAA	2	6	1777	1782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957101
54	NC_002252	A	7	7	1781	1787	100 %	0 %	0 %	0 %	10957101
55	NC_002252	TAG	2	6	1807	1812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957101
56	NC_002252	TCA	2	6	1826	1831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957101
57	NC_002252	TAG	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957101
58	NC_002252	GGC	2	6	1851	1856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957101
59	NC_002252	CAT	2	6	1894	1899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957101
60	NC_002252	ATG	2	6	1909	1914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957101
61	NC_002252	CAA	2	6	1979	1984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957101
62	NC_002252	A	6	6	2020	2025	100 %	0 %	0 %	0 %	10957101
63	NC_002252	AAC	2	6	2093	2098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957101
64	NC_002252	A	6	6	2119	2124	100 %	0 %	0 %	0 %	10957101
65	NC_002252	AT	3	6	2147	2152	50 %	50 %	0 %	0 %	10957101
66	NC_002252	A	9	9	2170	2178	100 %	0 %	0 %	0 %	10957101
67	NC_002252	T	7	7	2199	2205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002252	TCC	2	6	2236	2241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_002252	AAAACA	2	12	2283	2294	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_002252	ACA	2	6	2296	2301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_002252	T	6	6	2351	2356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002252	ATT	2	6	2375	2380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002252	AAG	2	6	2384	2389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002252	AGG	2	6	2420	2425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002252	A	6	6	2435	2440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002252	A	6	6	2449	2454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002252	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002252	GGTG	2	8	2491	2498	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002252	CAA	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_002252	T	6	6	2656	2661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002252	A	7	7	2689	2695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002252	TG	3	6	2791	2796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002252	AGAA	2	8	2814	2821	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002252	GAG	2	6	2840	2845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002252	CAT	2	6	2876	2881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_002252	TCT	2	6	2885	2890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_002252	AT	3	6	2961	2966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002252	ACAA	2	8	3042	3049	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_002252	TGT	2	6	3095	3100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002252	A	6	6	3130	3135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002252	T	7	7	3142	3148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002252	A	6	6	3189	3194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002252	CAAAA	2	10	3217	3226	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_002252	T	6	6	3242	3247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002252	A	7	7	3250	3256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002252	T	10	10	3257	3266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002252	ATACA	2	10	3272	3281	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_002252	TA	5	10	3320	3329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002252	A	6	6	3365	3370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002252	ATTA	2	8	3392	3399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002252	A	7	7	3432	3438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002252	TAT	2	6	3449	3454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002252	AT	3	6	3453	3458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002252	ATTGTT	2	12	3469	3480	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002252	TAT	2	6	3487	3492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002252	ATTA	2	8	3496	3503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002252	TTTA	2	8	3511	3518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002252	TTA	2	6	3525	3530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002252	AT	4	8	3540	3547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002252	T	6	6	3554	3559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002252	ATT	2	6	3577	3582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002252	TTTAA	2	10	3585	3594	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002252	AGTT	2	8	3597	3604	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002252	T	7	7	3630	3636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002252	A	7	7	3663	3669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002252	ACA	2	6	3692	3697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_002252	ATC	2	6	3705	3710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_002252	ATT	2	6	3733	3738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002252	CAG	2	6	3747	3752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_002252	TAA	2	6	3757	3762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002252	A	8	8	3761	3768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002252	CTG	2	6	3813	3818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_002252	CT	3	6	3845	3850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_002252	A	7	7	3896	3902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002252	T	6	6	3908	3913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002252	A	7	7	3915	3921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002252	ACA	2	6	3954	3959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_002252	TGA	2	6	3964	3969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002252	A	7	7	3974	3980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002252	T	6	6	3981	3986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002252	AAC	2	6	4031	4036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_002252	T	6	6	4061	4066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002252	A	6	6	4124	4129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002252	TTTA	2	8	4152	4159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002252	TTG	2	6	4173	4178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002252	ATC	2	6	4182	4187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_002252	A	9	9	4188	4196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002252	A	7	7	4239	4245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002252	A	7	7	4253	4259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002252	AGA	2	6	4264	4269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002252	AGAAA	2	10	4273	4282	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002252	GAA	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002252	A	7	7	4378	4384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002252	AATT	2	8	4392	4399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002252	T	8	8	4439	4446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002252	A	8	8	4483	4490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002252	T	6	6	4511	4516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002252	ATG	2	6	4572	4577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002252	A	7	7	4578	4584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002252	A	7	7	4633	4639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002252	CAG	2	6	4666	4671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_002252	AGT	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_002252	ATT	2	6	6006	6011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_002252	AAG	2	6	6015	6020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_002252	A	6	6	6080	6085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.