MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-4

Total Repeats: 911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001854	ATA	2	6	53	58	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001854	T	6	6	119	124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001854	T	6	6	192	197	0 %	100 %	0 %	0 %	11496764
4	NC_001854	AAT	2	6	218	223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496764
5	NC_001854	TA	3	6	227	232	50 %	50 %	0 %	0 %	11496764
6	NC_001854	TA	3	6	235	240	50 %	50 %	0 %	0 %	11496764
7	NC_001854	AAC	2	6	262	267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496764
8	NC_001854	CATG	2	8	285	292	25 %	25 %	25 %	25 %	11496764
9	NC_001854	AAAT	2	8	325	332	75 %	25 %	0 %	0 %	11496764
10	NC_001854	ATT	2	6	346	351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496764
11	NC_001854	A	6	6	355	360	100 %	0 %	0 %	0 %	11496764
12	NC_001854	CAAAAA	2	12	389	400	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	11496764
13	NC_001854	CCT	2	6	405	410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11496764
14	NC_001854	AT	3	6	415	420	50 %	50 %	0 %	0 %	11496764
15	NC_001854	CAA	2	6	421	426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496764
16	NC_001854	A	6	6	429	434	100 %	0 %	0 %	0 %	11496764
17	NC_001854	TAT	2	6	507	512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496764
18	NC_001854	A	6	6	532	537	100 %	0 %	0 %	0 %	11496764
19	NC_001854	ATT	2	6	557	562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496764
20	NC_001854	ACT	3	9	597	605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496764
21	NC_001854	AAT	2	6	626	631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001854	AT	3	6	651	656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001854	A	7	7	668	674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001854	A	6	6	678	683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001854	TAATA	2	10	711	720	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001854	ATGG	2	8	736	743	25 %	25 %	50 %	0 %	11496742
27	NC_001854	AAATT	2	10	782	791	60 %	40 %	0 %	0 %	11496742
28	NC_001854	TAA	2	6	792	797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496742
29	NC_001854	A	7	7	974	980	100 %	0 %	0 %	0 %	11496742
30	NC_001854	TTG	2	6	1065	1070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496742
31	NC_001854	TA	3	6	1139	1144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001854	TAT	2	6	1172	1177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001854	AAT	2	6	1216	1221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001854	AT	3	6	1263	1268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001854	A	7	7	1296	1302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001854	ATT	2	6	1305	1310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001854	CAAAA	2	10	1319	1328	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_001854	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001854	TAAA	2	8	1496	1503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001854	GAG	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001854	ACA	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_001854	TAA	2	6	1659	1664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001854	CAA	2	6	1694	1699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_001854	AAACA	2	10	1710	1719	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_001854	A	6	6	1736	1741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001854	TAT	2	6	1750	1755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_001854	TAA	2	6	1758	1763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_001854	A	6	6	1773	1778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001854	A	6	6	1851	1856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001854	CTA	2	6	1857	1862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_001854	AGCC	2	8	1922	1929	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_001854	C	6	6	1928	1933	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_001854	T	6	6	2065	2070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001854	ATC	2	6	2082	2087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_001854	TTTAAT	2	12	2117	2128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001854	A	6	6	2129	2134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001854	TTAA	2	8	2188	2195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001854	ATA	2	6	2299	2304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001854	TA	4	8	2318	2325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001854	T	8	8	2333	2340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001854	ATT	2	6	2364	2369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001854	ACAA	2	8	2428	2435	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_001854	ATT	2	6	2464	2469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001854	ATA	2	6	2490	2495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001854	TAA	2	6	2506	2511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001854	A	6	6	2510	2515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001854	T	8	8	2569	2576	0 %	100 %	0 %	0 %	11496743
68	NC_001854	AAAT	2	8	2612	2619	75 %	25 %	0 %	0 %	11496743
69	NC_001854	TAA	2	6	2651	2656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496743
70	NC_001854	AGA	2	6	2679	2684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496743
71	NC_001854	ATT	2	6	2695	2700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496743
72	NC_001854	CAAAA	2	10	2701	2710	80 %	0 %	0 %	20 %	11496743
73	NC_001854	A	6	6	2707	2712	100 %	0 %	0 %	0 %	11496743
74	NC_001854	AGA	2	6	2724	2729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496743
75	NC_001854	AGA	2	6	2734	2739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496743
76	NC_001854	A	9	9	2739	2747	100 %	0 %	0 %	0 %	11496743
77	NC_001854	ATA	2	6	2774	2779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496743
78	NC_001854	AAAT	2	8	2807	2814	75 %	25 %	0 %	0 %	11496743
79	NC_001854	TATAT	2	10	2833	2842	40 %	60 %	0 %	0 %	11496743
80	NC_001854	AAAT	2	8	2904	2911	75 %	25 %	0 %	0 %	11496743
81	NC_001854	ACA	2	6	2947	2952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496743
82	NC_001854	A	6	6	3013	3018	100 %	0 %	0 %	0 %	11496743
83	NC_001854	TAAAA	2	10	3054	3063	80 %	20 %	0 %	0 %	11496743
84	NC_001854	AT	3	6	3081	3086	50 %	50 %	0 %	0 %	11496743
85	NC_001854	TAA	2	6	3092	3097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496743
86	NC_001854	ATC	2	6	3119	3124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496743
87	NC_001854	AGA	2	6	3144	3149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496743
88	NC_001854	CGCAAT	2	12	3159	3170	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	11496743
89	NC_001854	ATC	2	6	3229	3234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496743
90	NC_001854	AAT	2	6	3256	3261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496743
91	NC_001854	AAT	2	6	3265	3270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496743
92	NC_001854	GAT	2	6	3274	3279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496743
93	NC_001854	A	6	6	3283	3288	100 %	0 %	0 %	0 %	11496743
94	NC_001854	A	7	7	3294	3300	100 %	0 %	0 %	0 %	11496743
95	NC_001854	CTT	2	6	3302	3307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496743
96	NC_001854	TAG	2	6	3323	3328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496743
97	NC_001854	TTAA	2	8	3334	3341	50 %	50 %	0 %	0 %	11496743
98	NC_001854	TTAA	2	8	3353	3360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001854	T	8	8	3381	3388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_001854	T	6	6	3390	3395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_001854	TCT	2	6	3401	3406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_001854	TAG	2	6	3430	3435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_001854	TAA	2	6	3495	3500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_001854	TTA	2	6	3501	3506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_001854	TTA	2	6	3514	3519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_001854	TTC	2	6	3529	3534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_001854	TAA	2	6	3551	3556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_001854	TCT	2	6	3559	3564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_001854	T	7	7	3587	3593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_001854	TTA	2	6	3622	3627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_001854	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_001854	TAA	2	6	3692	3697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_001854	TAA	2	6	3780	3785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001854	AAAAG	2	10	3800	3809	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_001854	GATT	2	8	3885	3892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_001854	TCA	2	6	3931	3936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_001854	GAT	2	6	3970	3975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_001854	AGC	2	6	4003	4008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_001854	GTA	2	6	4058	4063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_001854	AAT	2	6	4073	4078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_001854	TAA	2	6	4089	4094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001854	A	6	6	4105	4110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_001854	A	6	6	4139	4144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_001854	TGA	2	6	4195	4200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_001854	ATAAAA	2	12	4209	4220	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_001854	AAC	2	6	4240	4245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_001854	TAAAA	2	10	4264	4273	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_001854	A	6	6	4270	4275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_001854	TGTT	2	8	4294	4301	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_001854	T	6	6	4341	4346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001854	A	6	6	4375	4380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_001854	AAAT	2	8	4384	4391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_001854	CAG	2	6	4433	4438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_001854	GAA	3	9	4514	4522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_001854	A	6	6	4528	4533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_001854	GGC	2	6	4609	4614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_001854	A	6	6	4625	4630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_001854	TA	3	6	4649	4654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_001854	TTAAT	2	10	4655	4664	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_001854	T	6	6	4664	4669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_001854	AATCAT	2	12	4830	4841	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_001854	TAT	2	6	4851	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_001854	A	6	6	4861	4866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_001854	A	6	6	4899	4904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_001854	ATTAAT	2	12	4927	4938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_001854	CCA	2	6	4942	4947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_001854	AAT	2	6	4960	4965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_001854	AT	3	6	4991	4996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_001854	A	6	6	5072	5077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_001854	TAA	2	6	5097	5102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_001854	AT	3	6	5150	5155	50 %	50 %	0 %	0 %	11496753
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