MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-3

Total Repeats: 929

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001853	TAACTT	2	12	38	49	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_001853	ATA	2	6	74	79	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001853	T	8	8	162	169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001853	AAT	2	6	181	186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001853	ATT	2	6	281	286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001853	ATT	2	6	294	299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001853	TTA	2	6	300	305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001853	AAT	2	6	339	344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001853	A	6	6	367	372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001853	AAAT	2	8	385	392	75 %	25 %	0 %	0 %	11496704
11	NC_001853	GTC	2	6	395	400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496704
12	NC_001853	ATT	2	6	457	462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496704
13	NC_001853	ATA	2	6	476	481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496704
14	NC_001853	CTA	2	6	488	493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496704
15	NC_001853	AAAG	2	8	568	575	75 %	0 %	25 %	0 %	11496704
16	NC_001853	GGA	2	6	649	654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496704
17	NC_001853	ACA	2	6	701	706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496704
18	NC_001853	CGA	2	6	726	731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496704
19	NC_001853	ATAC	2	8	741	748	50 %	25 %	0 %	25 %	11496704
20	NC_001853	AAT	2	6	772	777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496704
21	NC_001853	TAG	4	12	783	794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496704
22	NC_001853	TTA	2	6	795	800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496704
23	NC_001853	ATA	2	6	814	819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496704
24	NC_001853	ATT	2	6	841	846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496704
25	NC_001853	A	6	6	857	862	100 %	0 %	0 %	0 %	11496704
26	NC_001853	T	8	8	903	910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001853	A	8	8	929	936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001853	A	7	7	939	945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001853	A	6	6	963	968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001853	ATA	2	6	980	985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001853	AAC	2	6	1008	1013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_001853	ATT	2	6	1068	1073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496698
33	NC_001853	AAT	2	6	1087	1092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496698
34	NC_001853	A	8	8	1100	1107	100 %	0 %	0 %	0 %	11496698
35	NC_001853	A	6	6	1135	1140	100 %	0 %	0 %	0 %	11496698
36	NC_001853	ATA	2	6	1142	1147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496698
37	NC_001853	CAA	2	6	1166	1171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496698
38	NC_001853	AATA	2	8	1174	1181	75 %	25 %	0 %	0 %	11496698
39	NC_001853	AT	3	6	1187	1192	50 %	50 %	0 %	0 %	11496698
40	NC_001853	A	6	6	1196	1201	100 %	0 %	0 %	0 %	11496698
41	NC_001853	AT	3	6	1242	1247	50 %	50 %	0 %	0 %	11496698
42	NC_001853	TAT	2	6	1252	1257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496698
43	NC_001853	ATTA	2	8	1261	1268	50 %	50 %	0 %	0 %	11496698
44	NC_001853	CAA	2	6	1289	1294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496698
45	NC_001853	ACT	2	6	1301	1306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496698
46	NC_001853	AAACTA	2	12	1324	1335	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	11496698
47	NC_001853	AACTA	2	10	1343	1352	60 %	20 %	0 %	20 %	11496698
48	NC_001853	CTA	3	9	1355	1363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496698
49	NC_001853	A	6	6	1373	1378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001853	AT	3	6	1424	1429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001853	ATAA	2	8	1439	1446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001853	TAA	2	6	1529	1534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496703
53	NC_001853	AC	3	6	1544	1549	50 %	0 %	0 %	50 %	11496703
54	NC_001853	ACA	2	6	1553	1558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496703
55	NC_001853	A	6	6	1572	1577	100 %	0 %	0 %	0 %	11496703
56	NC_001853	TAG	2	6	1590	1595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496703
57	NC_001853	TAAAC	2	10	1644	1653	60 %	20 %	0 %	20 %	11496703
58	NC_001853	TA	3	6	1695	1700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001853	TTAT	2	8	1729	1736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001853	TAAAC	2	10	1758	1767	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_001853	TTC	3	9	1791	1799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_001853	TA	4	8	1843	1850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001853	AAG	2	6	1851	1856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001853	GA	3	6	1868	1873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001853	TAT	2	6	1908	1913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001853	T	6	6	1921	1926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001853	AAAG	2	8	1931	1938	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001853	AGT	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_001853	AG	3	6	1986	1991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_001853	TA	3	6	2045	2050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001853	AAT	2	6	2054	2059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001853	T	6	6	2061	2066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_001853	TAA	2	6	2071	2076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001853	ATT	2	6	2091	2096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001853	T	6	6	2095	2100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001853	TAG	2	6	2158	2163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001853	CT	3	6	2213	2218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_001853	TAA	2	6	2263	2268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496710
79	NC_001853	CAG	2	6	2307	2312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496710
80	NC_001853	A	6	6	2318	2323	100 %	0 %	0 %	0 %	11496710
81	NC_001853	CTT	2	6	2328	2333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496710
82	NC_001853	T	6	6	2332	2337	0 %	100 %	0 %	0 %	11496710
83	NC_001853	ATT	2	6	2344	2349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496710
84	NC_001853	CTT	2	6	2357	2362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496710
85	NC_001853	ATTT	2	8	2365	2372	25 %	75 %	0 %	0 %	11496710
86	NC_001853	T	6	6	2467	2472	0 %	100 %	0 %	0 %	11496710
87	NC_001853	CAA	2	6	2481	2486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496710
88	NC_001853	CAA	2	6	2496	2501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496710
89	NC_001853	AGA	2	6	2506	2511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496710
90	NC_001853	ACA	2	6	2543	2548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496710
91	NC_001853	T	6	6	2560	2565	0 %	100 %	0 %	0 %	11496710
92	NC_001853	CAT	2	6	2598	2603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496710
93	NC_001853	ATC	2	6	2635	2640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496710
94	NC_001853	AATT	2	8	2641	2648	50 %	50 %	0 %	0 %	11496710
95	NC_001853	TTC	2	6	2671	2676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496710
96	NC_001853	TTA	2	6	2702	2707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496710
97	NC_001853	T	6	6	2722	2727	0 %	100 %	0 %	0 %	11496710
98	NC_001853	ATATAG	2	12	2730	2741	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11496710
99	NC_001853	ATA	2	6	2789	2794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496710
100	NC_001853	AAT	2	6	2844	2849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496710
101	NC_001853	CAA	2	6	2862	2867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496710
102	NC_001853	CTA	2	6	2903	2908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496710
103	NC_001853	ATA	2	6	2919	2924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496710
104	NC_001853	A	6	6	2954	2959	100 %	0 %	0 %	0 %	11496710
105	NC_001853	T	7	7	2961	2967	0 %	100 %	0 %	0 %	11496710
106	NC_001853	T	6	6	3056	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_001853	TA	3	6	3073	3078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_001853	T	6	6	3079	3084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_001853	A	7	7	3085	3091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_001853	ATTA	2	8	3122	3129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_001853	TC	3	6	3131	3136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_001853	T	8	8	3155	3162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_001853	T	7	7	3172	3178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001853	TA	3	6	3199	3204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_001853	A	6	6	3207	3212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_001853	T	6	6	3276	3281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_001853	TAA	2	6	3283	3288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_001853	A	7	7	3302	3308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_001853	TCA	2	6	3353	3358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_001853	GAT	2	6	3390	3395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_001853	A	6	6	3420	3425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001853	A	6	6	3429	3434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_001853	ATT	2	6	3441	3446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_001853	AAT	2	6	3449	3454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_001853	T	6	6	3474	3479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_001853	A	6	6	3485	3490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_001853	ATT	2	6	3500	3505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_001853	AAGA	2	8	3518	3525	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_001853	ATC	2	6	3608	3613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_001853	TA	3	6	3623	3628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001853	GTAA	2	8	3630	3637	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_001853	ACCA	2	8	3722	3729	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_001853	ATT	2	6	3761	3766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_001853	T	6	6	3785	3790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_001853	A	7	7	3804	3810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_001853	TCA	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_001853	TAA	3	9	3842	3850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_001853	TTAA	2	8	3892	3899	50 %	50 %	0 %	0 %	11496712
139	NC_001853	AAT	2	6	3915	3920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496712
140	NC_001853	TTA	2	6	3933	3938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496712
141	NC_001853	TTC	2	6	3952	3957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496712
142	NC_001853	T	6	6	3968	3973	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
143	NC_001853	TCT	2	6	4007	4012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496712
144	NC_001853	ATTTTC	2	12	4048	4059	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	11496712
145	NC_001853	TTA	2	6	4103	4108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496712
146	NC_001853	T	6	6	4196	4201	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
147	NC_001853	TCT	3	9	4235	4243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496712
148	NC_001853	TCT	2	6	4306	4311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496712
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500	NC_001853	TTTA	2	8	15900	15907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

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