MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-1

Total Repeats: 939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001851	CTA	2	6	20	25	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_001851	T	7	7	45	51	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001851	A	6	6	111	116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001851	T	8	8	169	176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001851	A	6	6	189	194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001851	TTA	2	6	199	204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001851	GTTTT	2	10	225	234	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001851	TA	3	6	396	401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001851	ATTT	2	8	436	443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001851	ATTTA	2	10	446	455	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001851	GGA	2	6	456	461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001851	ATT	2	6	472	477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823338
13	NC_001851	TG	3	6	489	494	0 %	50 %	50 %	0 %	365823338
14	NC_001851	T	6	6	496	501	0 %	100 %	0 %	0 %	365823338
15	NC_001851	CTT	2	6	587	592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365823338
16	NC_001851	AGA	2	6	640	645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823338
17	NC_001851	TTCT	2	8	777	784	0 %	75 %	0 %	25 %	365823338
18	NC_001851	GAA	2	6	851	856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823338
19	NC_001851	GAA	2	6	893	898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823338
20	NC_001851	AGT	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365823338
21	NC_001851	A	6	6	1026	1031	100 %	0 %	0 %	0 %	365823338
22	NC_001851	TAA	2	6	1033	1038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823338
23	NC_001851	ATA	2	6	1077	1082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823338
24	NC_001851	GAA	2	6	1139	1144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823338
25	NC_001851	A	6	6	1143	1148	100 %	0 %	0 %	0 %	365823338
26	NC_001851	AC	3	6	1151	1156	50 %	0 %	0 %	50 %	365823338
27	NC_001851	TAA	2	6	1186	1191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823338
28	NC_001851	TGG	2	6	1240	1245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	365823338
29	NC_001851	AGA	2	6	1270	1275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823338
30	NC_001851	AAG	2	6	1279	1284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823338
31	NC_001851	AGA	2	6	1360	1365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823338
32	NC_001851	AAT	2	6	1421	1426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823338
33	NC_001851	GAA	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823338
34	NC_001851	ATT	2	6	1572	1577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001851	TAG	2	6	1578	1583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001851	CAT	2	6	1590	1595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_001851	TAC	2	6	1689	1694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_001851	AAC	2	6	1697	1702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_001851	ATT	2	6	1708	1713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001851	A	6	6	1773	1778	100 %	0 %	0 %	0 %	11496642
41	NC_001851	CTT	2	6	1779	1784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496642
42	NC_001851	AT	3	6	1830	1835	50 %	50 %	0 %	0 %	11496642
43	NC_001851	TCAA	2	8	1859	1866	50 %	25 %	0 %	25 %	11496642
44	NC_001851	AAT	2	6	1867	1872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496642
45	NC_001851	ATT	2	6	1877	1882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496642
46	NC_001851	CTA	2	6	1910	1915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496642
47	NC_001851	T	7	7	1935	1941	0 %	100 %	0 %	0 %	11496642
48	NC_001851	A	7	7	2001	2007	100 %	0 %	0 %	0 %	11496642
49	NC_001851	GAC	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496641
50	NC_001851	ACT	2	6	2165	2170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496641
51	NC_001851	AAC	2	6	2179	2184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496641
52	NC_001851	TAG	2	6	2376	2381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496641
53	NC_001851	TAG	2	6	2409	2414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496641
54	NC_001851	TAA	2	6	2570	2575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496641
55	NC_001851	GTT	2	6	2604	2609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496641
56	NC_001851	CT	3	6	2629	2634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_001851	AT	3	6	2635	2640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001851	TTC	2	6	2644	2649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_001851	A	8	8	2661	2668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001851	A	7	7	2671	2677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001851	A	6	6	2695	2700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001851	ATA	2	6	2712	2717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001851	AAC	2	6	2740	2745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_001851	ATT	2	6	2800	2805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001851	AAT	2	6	2819	2824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001851	A	8	8	2832	2839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001851	A	6	6	2867	2872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001851	ATA	2	6	2874	2879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_001851	CAA	2	6	2898	2903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_001851	AT	3	6	2919	2924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001851	ATA	2	6	2942	2947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001851	ATC	2	6	2964	2969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_001851	AT	3	6	2974	2979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001851	TAT	2	6	2984	2989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001851	ATTA	2	8	2993	3000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001851	CAA	2	6	3021	3026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_001851	ACT	2	6	3033	3038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_001851	CAAA	2	8	3051	3058	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_001851	AACTA	2	10	3075	3084	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_001851	CTA	3	9	3087	3095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_001851	A	7	7	3105	3111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001851	ATAA	2	8	3172	3179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_001851	TAA	2	6	3262	3267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496640
84	NC_001851	ACA	2	6	3286	3291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496640
85	NC_001851	A	6	6	3305	3310	100 %	0 %	0 %	0 %	11496640
86	NC_001851	TAAA	2	8	3337	3344	75 %	25 %	0 %	0 %	11496640
87	NC_001851	GCT	2	6	3354	3359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496640
88	NC_001851	AGT	2	6	3363	3368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496640
89	NC_001851	AGA	2	6	3396	3401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001851	ACTT	2	8	3408	3415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_001851	ATAA	2	8	3416	3423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_001851	T	6	6	3458	3463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_001851	AAC	2	6	3474	3479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_001851	ATT	2	6	3483	3488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_001851	CGTCC	2	10	3560	3569	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_001851	TTTC	2	8	3600	3607	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_001851	A	6	6	3670	3675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_001851	AT	6	12	3725	3736	50 %	50 %	0 %	0 %	11496655
99	NC_001851	CT	3	6	3788	3793	0 %	50 %	0 %	50 %	11496655
100	NC_001851	T	7	7	3811	3817	0 %	100 %	0 %	0 %	11496655
101	NC_001851	TTA	2	6	3860	3865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_001851	ACT	2	6	3875	3880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_001851	TAG	2	6	3895	3900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_001851	AGA	2	6	3988	3993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_001851	TGA	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_001851	CTT	2	6	4022	4027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_001851	A	6	6	4038	4043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_001851	AGA	2	6	4050	4055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_001851	AC	3	6	4084	4089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_001851	TAA	2	6	4110	4115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_001851	ACA	2	6	4128	4133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_001851	A	7	7	4171	4177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_001851	A	6	6	4183	4188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001851	TTC	2	6	4202	4207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_001851	A	7	7	4280	4286	100 %	0 %	0 %	0 %	365823339
116	NC_001851	TTA	2	6	4294	4299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823339
117	NC_001851	A	6	6	4324	4329	100 %	0 %	0 %	0 %	365823339
118	NC_001851	AGA	2	6	4334	4339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823339
119	NC_001851	AGA	2	6	4356	4361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823339
120	NC_001851	GCA	2	6	4362	4367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365823339
121	NC_001851	ACA	2	6	4377	4382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365823339
122	NC_001851	GAAGA	2	10	4414	4423	60 %	0 %	40 %	0 %	365823339
123	NC_001851	AG	3	6	4427	4432	50 %	0 %	50 %	0 %	365823339
124	NC_001851	AAG	2	6	4433	4438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823339
125	NC_001851	AG	3	6	4437	4442	50 %	0 %	50 %	0 %	365823339
126	NC_001851	AG	3	6	4447	4452	50 %	0 %	50 %	0 %	365823339
127	NC_001851	GAGAAA	2	12	4453	4464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823339
128	NC_001851	ACT	2	6	4494	4499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_001851	ACA	2	6	4597	4602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_001851	CTA	2	6	4609	4614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_001851	AC	3	6	4618	4623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_001851	TTAT	2	8	4645	4652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_001851	TAG	2	6	4667	4672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_001851	AAGAT	2	10	4687	4696	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_001851	CAGA	2	8	4722	4729	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_001851	CTTAT	2	10	4873	4882	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_001851	ATGA	2	8	4914	4921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_001851	CTA	2	6	4942	4947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_001851	CAA	2	6	4992	4997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_001851	TCT	2	6	5000	5005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_001851	A	6	6	5012	5017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_001851	T	6	6	5041	5046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_001851	ATA	4	12	5078	5089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_001851	TACACT	2	12	5124	5135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_001851	TCT	2	6	5201	5206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_001851	AT	3	6	5216	5221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_001851	ATT	2	6	5248	5253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_001851	T	6	6	5252	5257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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