MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp3

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021992	CG	3	6	3	8	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021992	CTG	2	6	157	162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021992	CGC	2	6	199	204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_021992	GC	3	6	262	267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021992	GCC	2	6	326	331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_021992	CCCG	2	8	372	379	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_021992	CTT	2	6	394	399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021992	CTG	2	6	478	483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021992	CGGC	2	8	519	526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021992	CTTCCC	2	12	601	612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_021992	CCG	2	6	642	647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_021992	CG	3	6	693	698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021992	GCCT	2	8	740	747	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021992	CCA	2	6	783	788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_021992	CGC	3	9	818	826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_021992	CAT	2	6	927	932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021992	AC	3	6	951	956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021992	TGC	2	6	1002	1007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021992	TGG	2	6	1059	1064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021992	CAC	2	6	1131	1136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_021992	TTC	2	6	1220	1225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021992	CG	3	6	1347	1352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021992	CCA	2	6	1446	1451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_021992	GGCC	2	8	1494	1501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021992	CTG	2	6	1561	1566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021992	CGT	2	6	1591	1596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021992	CACC	2	8	1674	1681	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_021992	CAC	2	6	1684	1689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_021992	ACAG	2	8	1712	1719	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021992	CCA	2	6	1743	1748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_021992	CCA	3	9	1761	1769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_021992	CAG	2	6	1786	1791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021992	CG	3	6	1800	1805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021992	CG	3	6	1810	1815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021992	CCG	2	6	1869	1874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_021992	ACC	2	6	1976	1981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_021992	CCCGT	2	10	2041	2050	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_021992	CGC	2	6	2056	2061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_021992	GCT	2	6	2130	2135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021992	ATC	2	6	2144	2149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021992	CCA	2	6	2196	2201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_021992	CCG	2	6	2253	2258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_021992	CTG	2	6	2305	2310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021992	CAG	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021992	CG	3	6	2369	2374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021992	CTC	2	6	2416	2421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_021992	GACCG	2	10	2434	2443	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_021992	GCG	2	6	2477	2482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021992	ATCCAG	2	12	2506	2517	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021992	CAG	2	6	2566	2571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021992	GC	3	6	3114	3119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021992	TTA	2	6	3129	3134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021992	TTGC	2	8	3146	3153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021992	AGAAA	2	10	3215	3224	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021992	AGC	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021992	TCGA	2	8	3348	3355	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021992	CTGCC	2	10	4251	4260	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_021992	TCC	3	9	4266	4274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_021992	TCAG	2	8	4315	4322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021992	C	6	6	4341	4346	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_021992	CAA	2	6	4356	4361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021992	CT	3	6	4381	4386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021992	ACG	2	6	4418	4423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021992	GGC	2	6	4436	4441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021992	GCT	2	6	4539	4544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021992	CACGA	2	10	5208	5217	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_021992	TCA	2	6	5250	5255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021992	CCG	2	6	5292	5297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_021992	GGAC	2	8	5319	5326	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021992	ACCAA	2	10	5415	5424	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_021992	CCA	2	6	5425	5430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_021992	CA	3	6	5429	5434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_021992	TGC	2	6	5476	5481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021992	GCT	2	6	5491	5496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021992	T	6	6	5550	5555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021992	TGG	2	6	5635	5640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021992	TGCAT	2	10	5649	5658	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_021992	TGGG	2	8	5730	5737	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021992	CG	3	6	5742	5747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021992	GGC	2	6	5760	5765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021992	CGG	2	6	5780	5785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021992	AGTG	2	8	5873	5880	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021992	AT	3	6	5936	5941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021992	T	7	7	5957	5963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021992	ATCT	2	8	7178	7185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021992	AAAT	2	8	7186	7193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021992	GAC	2	6	7216	7221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021992	ATC	2	6	7238	7243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021992	GTATCA	2	12	7275	7286	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021992	CTG	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021992	CAC	2	6	7334	7339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_021992	TC	3	6	7353	7358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021992	GGGC	2	8	7368	7375	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_021992	ACC	2	6	7383	7388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_021992	CT	4	8	7856	7863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021992	TG	3	6	7878	7883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021992	CCA	2	6	7967	7972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_021992	C	7	7	7990	7996	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NC_021992	GGCACT	2	12	8064	8075	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021992	CGT	2	6	8097	8102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021992	CCA	2	6	8149	8154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_021992	A	7	7	8216	8222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021992	CGA	2	6	8224	8229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021992	ATT	2	6	9000	9005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021992	T	6	6	9021	9026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021992	AGA	2	6	14234	14239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021992	CTG	2	6	14279	14284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021992	CTC	2	6	14982	14987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_021992	AGA	2	6	15284	15289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021992	GCT	2	6	15358	15363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021992	AGA	2	6	15365	15370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021992	TTC	3	9	15397	15405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021992	TCC	2	6	15538	15543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.