MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. HZ2

Total Repeats: 8717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021879	A	7	7	874733	874739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_021879	TTA	2	6	874753	874758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021879	CTA	2	6	874770	874775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_021879	GTA	2	6	876266	876271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_021879	TGCA	2	8	876283	876290	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5006	NC_021879	GAA	2	6	876305	876310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_021879	ATAC	2	8	876320	876327	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5008	NC_021879	CAA	2	6	876336	876341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_021879	CAATA	2	10	878091	878100	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5010	NC_021879	ACA	2	6	878127	878132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_021879	ATG	2	6	878161	878166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_021879	CT	3	6	878177	878182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5013	NC_021879	GA	3	6	878191	878196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_021879	AC	3	6	878574	878579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_021879	A	6	6	878656	878661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_021879	GTG	2	6	878721	878726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_021879	GCAT	2	8	878734	878741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5018	NC_021879	TTC	2	6	879817	879822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_021879	CTT	2	6	879834	879839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_021879	TA	3	6	879866	879871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_021879	CAA	2	6	879995	880000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_021879	TC	3	6	880646	880651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5023	NC_021879	GGTT	2	8	880662	880669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021879	CTA	2	6	880680	880685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_021879	CCT	2	6	880706	880711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_021879	AC	3	6	880718	880723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_021879	ACA	2	6	880727	880732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_021879	CTC	2	6	880763	880768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_021879	AT	3	6	880806	880811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_021879	GTA	2	6	880871	880876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_021879	T	6	6	883056	883061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_021879	T	7	7	883071	883077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_021879	AAG	2	6	883129	883134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_021879	CT	3	6	883256	883261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5035	NC_021879	AGA	2	6	883263	883268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_021879	TAT	2	6	883274	883279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_021879	TGC	2	6	883280	883285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_021879	AT	3	6	883313	883318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_021879	ATA	2	6	883775	883780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_021879	TA	3	6	883779	883784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_021879	TGT	2	6	883984	883989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_021879	ATA	2	6	884019	884024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_021879	GCT	2	6	884061	884066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_021879	GA	3	6	884092	884097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_021879	CGTA	2	8	884136	884143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5046	NC_021879	AGA	2	6	884189	884194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_021879	ATGC	2	8	884229	884236	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_021879	T	6	6	884309	884314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_021879	TG	3	6	884390	884395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_021879	GA	3	6	884436	884441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_021879	TAA	2	6	884468	884473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_021879	ACA	2	6	884586	884591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_021879	GAA	2	6	884595	884600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_021879	GCT	2	6	884635	884640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_021879	A	6	6	884805	884810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_021879	A	6	6	884848	884853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_021879	T	6	6	884894	884899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_021879	A	6	6	884909	884914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_021879	GCG	2	6	886390	886395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_021879	AATA	2	8	886430	886437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_021879	AGT	2	6	886461	886466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_021879	AAC	2	6	886504	886509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_021879	CA	4	8	886592	886599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_021879	CAT	2	6	886670	886675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_021879	CTT	2	6	886699	886704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_021879	TTCTGA	2	12	886724	886735	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5067	NC_021879	TCA	2	6	886832	886837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_021879	ATT	2	6	886855	886860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_021879	ACG	2	6	887002	887007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_021879	TATT	2	8	887036	887043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_021879	GCT	2	6	887132	887137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_021879	CTG	2	6	887162	887167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_021879	AT	3	6	887190	887195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_021879	CAT	2	6	887203	887208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_021879	CT	3	6	887236	887241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5076	NC_021879	CAA	2	6	887256	887261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_021879	CTA	2	6	887267	887272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_021879	TAT	2	6	887320	887325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021879	ACCT	2	8	887339	887346	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5080	NC_021879	CTT	2	6	887439	887444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_021879	CAA	2	6	887457	887462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_021879	ATTT	2	8	887466	887473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_021879	A	6	6	887519	887524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_021879	GCTC	2	8	889050	889057	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5085	NC_021879	AGA	2	6	889064	889069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_021879	CAC	2	6	889108	889113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_021879	CTG	2	6	889148	889153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_021879	TAG	2	6	889154	889159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_021879	AGT	2	6	889245	889250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_021879	TGC	2	6	889263	889268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_021879	GTT	2	6	889293	889298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021879	GT	3	6	890191	890196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_021879	ATT	2	6	890852	890857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_021879	TCT	2	6	890880	890885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_021879	CTT	2	6	890896	890901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_021879	ATT	2	6	890914	890919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_021879	T	6	6	890935	890940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_021879	ACT	2	6	890957	890962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_021879	GGTG	2	8	890990	890997	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_021879	ATT	2	6	892553	892558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_021879	TCT	2	6	892581	892586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_021879	CTT	2	6	892597	892602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_021879	T	6	6	892624	892629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_021879	ACT	2	6	892646	892651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_021879	GGTG	2	8	892679	892686	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_021879	TGG	2	6	892689	892694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021879	ATGCA	2	10	892698	892707	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5108	NC_021879	TTGG	2	8	892716	892723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_021879	TAA	2	6	892867	892872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_021879	TA	3	6	892879	892884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_021879	AGT	2	6	892893	892898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_021879	TCA	2	6	892914	892919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_021879	GAA	2	6	892961	892966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_021879	TAA	2	6	893039	893044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_021879	ACT	2	6	893054	893059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_021879	A	6	6	893104	893109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_021879	CCG	2	6	893120	893125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5118	NC_021879	ACT	2	6	893202	893207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_021879	TGC	2	6	893255	893260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_021879	CCT	2	6	893313	893318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_021879	TAT	2	6	893331	893336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_021879	TAA	2	6	893435	893440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_021879	GT	4	8	893455	893462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_021879	GTTATG	2	12	893465	893476	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_021879	TAG	2	6	894785	894790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_021879	GC	3	6	894819	894824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5127	NC_021879	AGC	2	6	894854	894859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_021879	TTGC	2	8	894865	894872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5129	NC_021879	TG	3	6	894906	894911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_021879	GTT	2	6	894918	894923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_021879	TGG	2	6	894953	894958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_021879	GTG	2	6	894966	894971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_021879	TC	3	6	895008	895013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5134	NC_021879	TG	3	6	895033	895038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_021879	CTT	2	6	895056	895061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5137	NC_021879	ATGT	2	8	895156	895163	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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