MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.06

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019775	AT	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019775	T	7	7	18	24	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019775	TCT	2	6	30	35	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019775	ATCA	2	8	36	43	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019775	TA	3	6	62	67	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019775	ATT	2	6	168	173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019775	TA	3	6	223	228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019775	TACT	2	8	251	258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019775	GTT	2	6	280	285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019775	AAAC	2	8	348	355	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019775	TGG	2	6	376	381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019775	ATT	2	6	452	457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019775	ATTTT	2	10	1043	1052	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019775	TAT	2	6	1055	1060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019775	ATGTGA	2	12	1110	1121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019775	AGTG	2	8	5040	5047	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019775	CGT	2	6	5067	5072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019775	TTCT	2	8	5074	5081	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019775	T	6	6	5081	5086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019775	ACC	2	6	5088	5093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_019775	GTG	2	6	5136	5141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019775	TGG	2	6	5146	5151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019775	TGT	2	6	5153	5158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019775	TAG	2	6	5190	5195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019775	CTA	2	6	5199	5204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019775	TA	3	6	5214	5219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019775	A	6	6	5219	5224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019775	ATTT	2	8	5226	5233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019775	A	7	7	5237	5243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019775	GATTT	2	10	5263	5272	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019775	TC	3	6	5310	5315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019775	TTACTT	2	12	5345	5356	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019775	CAAA	2	8	5458	5465	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019775	TCAA	2	8	5506	5513	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019775	T	9	9	5528	5536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019775	CTG	2	6	5539	5544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019775	CGG	2	6	5556	5561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019775	CTA	2	6	5663	5668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019775	AAT	2	6	5740	5745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019775	ATAG	2	8	5765	5772	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019775	TTTA	2	8	5775	5782	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019775	A	6	6	5790	5795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019775	AGATA	2	10	5815	5824	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019775	TAT	2	6	5858	5863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019775	AT	3	6	5862	5867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019775	TAG	2	6	6476	6481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019775	TA	3	6	6546	6551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019775	AACT	2	8	6569	6576	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019775	GA	3	6	6700	6705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019775	TAC	2	6	7958	7963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019775	ACG	2	6	8027	8032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019775	CAA	2	6	8056	8061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019775	A	6	6	8138	8143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019775	AATC	2	8	8156	8163	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019775	ATTA	2	8	8600	8607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019775	CTT	2	6	9255	9260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019775	A	6	6	13276	13281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019775	CGA	2	6	13665	13670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019775	AAAAT	2	10	13674	13683	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019775	ATTT	2	8	14407	14414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019775	AAT	2	6	14463	14468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019775	TAT	2	6	14474	14479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019775	TAA	2	6	14548	14553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019775	GAA	2	6	18955	18960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019775	GTTT	2	8	18961	18968	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019775	CT	3	6	18991	18996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019775	ATTT	2	8	19030	19037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019775	TTAA	2	8	20086	20093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019775	AT	3	6	20168	20173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019775	ATCA	2	8	20186	20193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019775	AT	3	6	20207	20212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019775	AT	3	6	20271	20276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019775	ATG	2	6	20354	20359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019775	A	7	7	20362	20368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019775	T	6	6	20420	20425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019775	ATTT	2	8	20718	20725	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019775	T	8	8	20723	20730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019775	AAT	2	6	20759	20764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019775	CATA	2	8	21544	21551	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019775	ACC	2	6	21562	21567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_019775	GGT	2	6	21585	21590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019775	TAAAC	2	10	21652	21661	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_019775	AGTA	2	8	21686	21693	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019775	TA	3	6	21716	21721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019775	AAT	2	6	21771	21776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019775	AT	3	6	21876	21881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019775	TGAT	2	8	21901	21908	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019775	AGA	2	6	21909	21914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019775	A	7	7	21920	21926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019775	AT	5	10	21938	21947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019775	T	6	6	21954	21959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019775	A	6	6	21987	21992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019775	ATA	2	6	22037	22042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019775	CT	3	6	22299	22304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019775	GTC	2	6	22351	22356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019775	TA	3	6	22413	22418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019775	AT	3	6	22420	22425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019775	GTC	2	6	22464	22469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019775	ATAG	2	8	22476	22483	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019775	CCA	2	6	22672	22677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_019775	TAACC	2	10	22696	22705	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_019775	TAT	2	6	22725	22730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019775	T	6	6	22775	22780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019775	A	6	6	22808	22813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.