MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.04

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019774	AAC	2	6	10	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019774	CTA	2	6	63	68	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019774	ATTT	2	8	178	185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019774	CAT	2	6	187	192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019774	AAG	2	6	231	236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019774	TTC	2	6	242	247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019774	GTT	2	6	258	263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019774	A	6	6	299	304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019774	TTC	2	6	4231	4236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019774	A	6	6	4277	4282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019774	GCAA	2	8	4310	4317	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019774	ATA	2	6	5288	5293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019774	ATC	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019774	A	7	7	5352	5358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019774	ATA	2	6	5362	5367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019774	CCG	2	6	5370	5375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_019774	TCA	2	6	5447	5452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019774	TCT	2	6	5469	5474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019774	TGG	2	6	5562	5567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019774	GTG	2	6	5576	5581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019774	CTTT	2	8	5602	5609	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019774	TAT	2	6	5621	5626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019774	AAC	2	6	5771	5776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019774	TGA	2	6	5805	5810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019774	GGAC	2	8	5833	5840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_019774	CATA	2	8	5894	5901	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019774	TGT	2	6	5908	5913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019774	TAAATT	2	12	6005	6016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019774	AT	3	6	6063	6068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019774	TCTA	2	8	7415	7422	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019774	GTT	2	6	7453	7458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019774	T	7	7	7457	7463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019774	CTTTT	2	10	7468	7477	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_019774	T	6	6	7474	7479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019774	T	6	6	7481	7486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019774	T	6	6	7499	7504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019774	T	6	6	7553	7558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019774	TTC	2	6	7577	7582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019774	TAT	2	6	7595	7600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019774	TTC	2	6	7601	7606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019774	TAA	2	6	7628	7633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019774	CTG	2	6	7660	7665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019774	T	6	6	7717	7722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019774	TAA	2	6	7741	7746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019774	T	7	7	7748	7754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019774	TCT	2	6	7760	7765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019774	ATT	3	9	7783	7791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019774	TTA	2	6	7877	7882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019774	TCTT	2	8	7966	7973	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019774	ATT	2	6	7976	7981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019774	ATT	2	6	8087	8092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019774	TAT	2	6	8100	8105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019774	GTAG	2	8	8153	8160	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019774	T	7	7	8169	8175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019774	T	6	6	8233	8238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019774	TA	3	6	8298	8303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019774	AAT	2	6	8423	8428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019774	T	8	8	8436	8443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019774	A	6	6	8460	8465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019774	T	9	9	8470	8478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019774	T	7	7	8544	8550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019774	CAG	2	6	8605	8610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019774	AG	3	6	8619	8624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019774	GA	3	6	8629	8634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019774	TCT	2	6	11519	11524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019774	GCT	2	6	11582	11587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019774	CCAA	2	8	11625	11632	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019774	AAC	2	6	11688	11693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019774	TGA	2	6	11749	11754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019774	ATA	2	6	11755	11760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019774	ACTT	2	8	11763	11770	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019774	CCAA	2	8	11779	11786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019774	TCA	2	6	11790	11795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019774	GGT	2	6	11815	11820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019774	ATC	2	6	11870	11875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019774	A	7	7	12307	12313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019774	TGC	2	6	12330	12335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019774	AG	3	6	12352	12357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019774	GAT	2	6	12377	12382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019774	TAGT	2	8	12415	12422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019774	ATTTT	2	10	13122	13131	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019774	GTT	2	6	13136	13141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019774	TAG	2	6	13255	13260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019774	AGG	2	6	13283	13288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019774	CCCAA	2	10	14164	14173	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_019774	TGT	2	6	14217	14222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019774	A	6	6	14311	14316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019774	A	7	7	14374	14380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019774	CTAC	2	8	14389	14396	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019774	AGA	2	6	14439	14444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019774	TAA	2	6	14456	14461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019774	TAA	2	6	14567	14572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019774	AAAG	2	8	14575	14582	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019774	TAA	2	6	14667	14672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019774	TAA	3	9	14757	14765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019774	GAA	3	9	14782	14790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019774	A	7	7	14795	14801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019774	TTA	2	6	14803	14808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019774	GAA	2	6	14823	14828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019774	A	6	6	14827	14832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019774	CAG	2	6	14884	14889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019774	ATT	2	6	14915	14920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019774	CAGA	2	8	14937	14944	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019774	ATA	2	6	14949	14954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019774	GAA	2	6	14967	14972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019774	A	6	6	14991	14996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019774	A	6	6	15045	15050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019774	A	6	6	15063	15068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019774	A	6	6	15070	15075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019774	A	7	7	15086	15092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019774	ATAG	2	8	15126	15133	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019774	ACA	2	6	15215	15220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019774	TTAT	2	8	15222	15229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019774	GTCC	2	8	15288	15295	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_019774	TCA	2	6	15318	15323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019774	GTT	2	6	15352	15357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019774	ATA	2	6	15502	15507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019774	AAAG	2	8	15519	15526	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019774	CCA	2	6	15546	15551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_019774	ACC	2	6	15560	15565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_019774	AGA	2	6	15654	15659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019774	ATG	2	6	15675	15680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019774	GCG	2	6	15752	15757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019774	ATT	2	6	15759	15764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019774	T	7	7	15770	15776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019774	GAT	2	6	15822	15827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019774	ATATT	2	10	15834	15843	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019774	ATT	2	6	18766	18771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019774	ATT	2	6	18776	18781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019774	CAAAAT	2	12	18814	18825	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_019774	AT	3	6	19312	19317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019774	TATT	2	8	19327	19334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019774	TAAT	2	8	20305	20312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019774	TCA	2	6	20329	20334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019774	ATAC	2	8	20371	20378	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019774	TA	3	6	20544	20549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019774	GCCA	2	8	20654	20661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019774	T	6	6	20691	20696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019774	AGC	2	6	20741	20746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019774	TAAT	2	8	20884	20891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019774	TAC	2	6	20899	20904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019774	CAT	2	6	23535	23540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_019774	CTTTCA	2	12	23579	23590	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_019774	CTA	2	6	23600	23605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_019774	CTTG	2	8	25991	25998	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_019774	TAACA	2	10	25999	26008	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_019774	ATT	2	6	26049	26054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019774	T	6	6	26053	26058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019774	TAA	2	6	26082	26087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019774	TA	3	6	26771	26776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_019774	TA	3	6	32561	32566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_019774	ATT	2	6	35763	35768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_019774	ATT	2	6	38699	38704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_019774	A	7	7	73732	73738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_019774	GTC	2	6	73756	73761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_019774	CAA	2	6	73850	73855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_019774	AAAG	2	8	73888	73895	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
297	NC_019774	TA	3	6	73916	73921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_019774	ATT	2	6	73952	73957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_019774	TAA	2	6	73979	73984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_019774	TCT	2	6	73989	73994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
301	NC_019774	CAG	2	6	74013	74018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_019774	AGC	2	6	74045	74050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_019774	T	8	8	74051	74058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_019774	A	6	6	74100	74105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_019774	T	6	6	76742	76747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_019774	TTG	2	6	76785	76790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
307	NC_019774	AATT	2	8	80604	80611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_019774	CAAC	2	8	80634	80641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
309	NC_019774	ATC	2	6	80647	80652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
310	NC_019774	CAA	2	6	83908	83913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
311	NC_019774	TAAA	2	8	83915	83922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_019774	TAA	2	6	84004	84009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_019774	A	8	8	84017	84024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
314	NC_019774	TTG	2	6	84080	84085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
315	NC_019774	T	6	6	84099	84104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
316	NC_019774	CAA	2	6	84117	84122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
317	NC_019774	AAT	2	6	84152	84157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_019774	GAT	2	6	84171	84176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
319	NC_019774	GGTT	2	8	84181	84188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
320	NC_019774	AATT	2	8	84212	84219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
321	NC_019774	GGTTT	2	10	95736	95745	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
322	NC_019774	CTTTC	2	10	95760	95769	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
323	NC_019774	TAAT	2	8	95995	96002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_019774	GTT	2	6	96035	96040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
325	NC_019774	ACCTGA	2	12	96050	96061	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
326	NC_019774	GGTT	2	8	96155	96162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
327	NC_019774	TTAT	2	8	96211	96218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
328	NC_019774	AATA	2	8	96223	96230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
329	NC_019774	GAT	2	6	96237	96242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
330	NC_019774	TAA	2	6	96309	96314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
331	NC_019774	GCTT	2	8	96798	96805	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
332	NC_019774	ATT	2	6	96856	96861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.